本文選題：呼倫貝爾羊　切入點(diǎn)：脂肪　出處：《甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：呼倫貝爾羊是生長在呼倫貝爾大草原上的蒙古羊系的品種之一,由于牧草多樣性豐富,環(huán)境無污染,其生產(chǎn)的羊肉味道鮮美,肉質(zhì)細(xì)嫩。從尾型分類,呼倫貝爾羊兩個(gè)類群均屬于脂尾型,但是“巴爾虎”羊的尾巴顯著大于短尾羊。影響尾型形成的主要原因是脂肪沉積,但是尾部脂肪沉積的機(jī)理研究尚不清楚。而對(duì)呼倫貝爾羊兩個(gè)類群的區(qū)別的研究還停留在肉質(zhì)對(duì)比和外形比較階段,并沒有深層次的對(duì)比其脂肪代謝的差異。為此,我們首先通過體尺數(shù)據(jù)分析刪選極端個(gè)體,然后通過RNA-seq測(cè)序技術(shù)對(duì)呼倫貝爾羊的尾部脂肪組織進(jìn)行測(cè)序。并將其分成三個(gè)組進(jìn)行差異基因分析和通路分析。以期獲得呼倫貝爾羊大小尾之間的差異,以及不同性別之間的表達(dá)差異。其具體的研究內(nèi)容有:1.在呼倫貝爾草原隨機(jī)選擇6月齡的2000個(gè)個(gè)體,并對(duì)312只呼倫貝爾羊的體長、體高、胸圍、尾寬、尾長、尾周長、尾重、胴體重進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),兩個(gè)品系的體長、體高、胸圍、胴體重?zé)o顯著差異,尾寬、尾長、尾周長、尾重差異顯著。計(jì)算尾重和胴體重的相關(guān)性發(fā)現(xiàn),二者呈正相關(guān)性(P0.05)。2.通過RNA-seq技術(shù)對(duì)呼倫貝爾羊的兩個(gè)品系的12只羊進(jìn)行測(cè)序。并將其分為三種組合分別進(jìn)行差異基因和通路分析。第一組為呼倫貝爾羊大尾和小尾組之間的比較,共獲得差異基因267個(gè),已驗(yàn)證與脂肪相關(guān)的基因3個(gè)。研究表明,這三個(gè)基因均存在差異表達(dá)。并對(duì)脂肪相關(guān)基因CFD、PLIN4和THY1通過熒光定量對(duì)其表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證。Clue GO分析共發(fā)現(xiàn)6條通路,并未獲得KEGG通路。將呼倫貝爾大尾羊和小尾羊差異基因通過IPA(Ingenuity Pathway Anaylsis)軟件進(jìn)行通路分析,其中p0.05,共獲得12個(gè)脂肪相關(guān)通路。并對(duì)每個(gè)樣品中各個(gè)剪接事件的數(shù)目進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果表明TSS和TTS剪切事件發(fā)生概率遠(yuǎn)高于其他事件的發(fā)生。第二組為呼倫貝爾羊公羊中的大尾和小尾之間的差異分析,共獲得差異表達(dá)基因104個(gè),通過Clue GO分析共獲得13條通路,其中包括一個(gè)KEGG結(jié)果和12個(gè)GO分析結(jié)果。IPA軟件進(jìn)行分析,標(biāo)準(zhǔn)為p0.05,共獲得45個(gè)脂肪相關(guān)通路結(jié)果。第三組為呼倫貝母羊中的大小尾之間的差異分,共獲得差異表達(dá)基因2006個(gè),通過Clue GO分析共獲得52條通路,其中KEGG通路為5條。IPA軟件進(jìn)行分析,標(biāo)準(zhǔn)為p0.05,共獲得310個(gè)脂肪相關(guān)通路結(jié)果。通過差異基因分析和通路分析,我們選擇了5個(gè)脂肪相關(guān)基因IL18、HOXA10、UGCG、LPL、IRX3進(jìn)行熒光定量驗(yàn)證,了解其在不同性別綿羊中的表達(dá)情況。研究表明,這5個(gè)基因均存在性別特異性。上述研究從轉(zhuǎn)錄組水平篩選出呼倫比爾羊不同尾型和性別間的差異表達(dá)基因,這些差異表達(dá)基因參與了脂肪代謝、線粒體結(jié)構(gòu)和功能、能量代謝、糖類合成和分解等過程。并對(duì)不同性別綿羊的大小尾分別進(jìn)行分析,獲得了不同性別差異基因數(shù)目和通路差異表達(dá)的結(jié)果,并通過熒光定量驗(yàn)證了部分差異表達(dá)基因在不同組織中的表達(dá)情況。這些研究結(jié)果為進(jìn)一步研究綿羊脂肪代謝的分子機(jī)理提供新的方向、線索和依據(jù)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S826
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本文編號(hào)：1598449