本文關(guān)鍵詞：惡唑烷酮類耐藥基因cfr和optrA在豬源MRSA和CoNS中流行及傳播機(jī)制的研究　出處：《中國農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：耐甲氧西林金葡菌(MRSA)和凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)是引起臨床感染和社區(qū)獲得性感染的重要病原菌。食品動物源耐藥細(xì)菌可通過食物鏈條傳遞給人類,嚴(yán)重影響人類健康。目前,惡唑烷酮類的利奈唑胺是治療MRSA和CoNS感染的特效抗菌藥物。而廣泛存在于動物源和人源細(xì)菌質(zhì)粒上的基因cfr,可同時介導(dǎo)五類化學(xué)結(jié)構(gòu)不相關(guān)抗菌藥物包括利奈唑胺的耐藥。盡管新批準(zhǔn)的惡唑烷酮類藥物泰地唑利可有效地治療由MRSA和MRCoNS等多重耐藥病原菌(包括cfr陽性菌株)引起的感染,但是新型耐藥基因optrA可對包括泰地唑利在內(nèi)的惡唑烷酮類及酰胺醇類藥物耐藥。目前,盡管有許多報(bào)道顯示了cfr基因在革蘭陽性菌和optrA基因在腸球菌中的流行傳播情況,但卻鮮有報(bào)道豬源MRSA中cfr基因的流行傳播情況,對optrA基因在MRSA和CoNS中流行情況的研究也未見報(bào)道。本研究以2013-2014年分離的400株MRSA、525株MRCoNS和594株耐氟苯尼考(florfenicol, FFC)的凝固酶陰性葡萄球菌(FRCoNS)為研究對象,重點(diǎn)調(diào)查了cfr在MRSA菌株以及optrA基因在MRSA、MRCoNS和FRCoNS菌株之中的流行傳播情況。結(jié)果顯示11株MRSA菌株中攜帶了cfr基因,其檢出率為2.8%；34株MRCoNS菌株攜帶了optrA基因,檢出率為6.5%;20株耐FRCoNS菌株攜帶了optrA基因,檢出率為3.4%；沒有MRSA菌株攜帶optrA基因。值得注意的是,在optrA陽性MRCoNS和FRCoNS菌株中,分別有17.6%和55.0%的菌株同時攜帶著cfr基因。進(jìn)一步對cfr陽性MRSA菌株定位和遺傳背景分析。10株菌cfr基因定位于～35-kb質(zhì)粒上1株定位于染色體中。9株定位于質(zhì)粒的cfr基因遺傳背景和質(zhì)粒pSS-02一致；1株和質(zhì)粒pSCFS7-like一致,插入序列IS21-558可能介導(dǎo)cfr基因在不同MRSA菌株之間的傳播。在cfr基因定位于染色體的菌株中,該基因上下游分別由相同方向的插入序列ISEnfa4IS256環(huán)繞,進(jìn)一步序列分析發(fā)現(xiàn)ISEnfa4-cfr-IS256插入到該染色體SCCmecccr復(fù)合物的上游區(qū)域。本研究首次發(fā)現(xiàn)一株MRCoNS(松鼠葡萄球菌)wo28-3中同時攜帶cfr和optrA基因,S1-PFGE和Southern雜交結(jié)果證實(shí)其共存于同一質(zhì)粒pWo28-3,功能性試驗(yàn)證實(shí)攜帶單一optrA基因的葡萄球菌和腸球菌對惡唑烷酮類藥物耐藥。全質(zhì)粒DNA測序結(jié)果表明pWo28-3中的cfr區(qū)域含有aadD、ble、aacA-aphD耐藥基因簇,和質(zhì)粒pJP1-like具有很高的同源性。隨后對2014年MRCoNS菌株進(jìn)行optrA基因的篩查、定位和遺傳背景分析,共發(fā)現(xiàn)33株菌攜帶optrA,其中4株定位于質(zhì)粒的菌株,其遺傳背景和pWo28-3一致。其它位于染色體的共含有6種不同的遺傳背景。所有結(jié)構(gòu)中的optrA基因上游均存在假定轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)基因araC,且araC上游區(qū)域直接或間接銜接復(fù)合轉(zhuǎn)座子Tn558。另外有3株菌的optrA遺傳背景以兩種不同方式鄰近c(diǎn)cr復(fù)合物。11株同時攜帶這兩種多重耐藥基因的FRCoNS菌中,2株菌的cfr和optrA共存于同一質(zhì)粒,其遺傳背景和pWo28-3類似；cfr和optrA共存于染色體上的4株菌,3株首次optrA上游存在ISEnfa5和cfr基因。5株cfr定位于質(zhì)粒菌中cfr遺傳背景和質(zhì)粒pJP1like類似。此外,其它定位于染色體菌株共含有三種遺傳背景。綜上所述,本研究首次在豬源MRSA中發(fā)現(xiàn)cfr基因插入到SCCmec結(jié)構(gòu)的ccr上游。同時,本研究首次開展了optrA在CoNS之中的分子流行調(diào)查,發(fā)現(xiàn)optrA和crf基因共存于MRCoNS中的現(xiàn)象,并系統(tǒng)地調(diào)查了optrA和cfr基因在CoNS中的流行傳播情況。optrA和cfr基因共存,限制了惡唑烷酮類及動物專用抗菌藥物如酰胺醇類等的抗菌效率,亟需深入加強(qiáng)optrA和cfr基因在動物源MRSA和CoNS的檢測和監(jiān)測,為風(fēng)險(xiǎn)評估和控制提供科學(xué)依據(jù)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S852.6

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本文編號：1355270