研究目的高尿酸血癥(Hyperuricemia,HUA)是一種由嘌呤代謝紊亂、尿酸(Uric acid,UA)產(chǎn)生過多或者尿酸排泄減少等引起的血尿酸水平升高的代謝性疾病。HUA是遺傳學(xué)、性別、年齡、生活方式和環(huán)境等多種因素共同作用的結(jié)果,已發(fā)展成為僅次于糖尿病的第二大代謝性疾病。目前,對高尿酸血癥與腸道菌群的相關(guān)性研究的對象多為實驗動物,本研究基于臨床病例,通過16S rDNA V3+V4區(qū)二代測序技術(shù)及生物信息分析技術(shù),探索高尿酸血癥相關(guān)腸道菌群變化。研究方法采集高尿酸血癥和非高尿酸血癥志愿者的糞便樣本,本研究通過運用傾向性評分匹配法對研究中采集到的樣本進(jìn)行1:1匹配并分組,降低混雜因素對實驗結(jié)果的干擾;對樣本的16S rDNA的V3-V4可變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,采用Illumina HiSeq2500進(jìn)行高通量測序;調(diào)用DADA2對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行去噪生成feature表;R edgeR包和bnlearn包篩選差異核心菌群并繪制貝葉斯關(guān)系網(wǎng)絡(luò),對差異菌群在門、綱、目、科、屬各水平進(jìn)行富集分析,繪制分類樹;使用PICRUSt平臺對核心菌群進(jìn)行宏基因組功能預(yù)測,STAMP軟件對功能預(yù)測結(jié)果進(jìn)...

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－４：?４８例樣本ｒｅａｄｓ數(shù)描述??

二、數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果??基于ＩＵｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ測序技術(shù)對研究參與者的腸道菌群結(jié)構(gòu)進(jìn)行了解析。經(jīng)過數(shù)據(jù)過??濾、合并、去除嵌合體后，４８個樣本共獲得２?８１３?１０７條ｒｅａｄｓ，平均每個樣本含有５８６０６．３９５８??條ｒｅａｄｓ，所有樣本中ｒｅａｄｓ數(shù)最少的含有２１?２３１....

圖３－５?Ｃｈａｏｌ及ｓｈａｎｎｏｎ多樣性稀釋曲線??

９５７３９?１９５１３９?１９３９６７?１７８９４２?７４４５６??Ｍ９２?１８６８３８?１５３１８４?１５２３６４?１５０８７３?１０１０１９?４５５１３??Ｍ９３?１９５８６１?１５９１６９?１５８２９０?１５７３５６?７６０９９?３５６５２??Ｍ９８?２１３５２０?１７７３....

圖３－７?ＡＳＶ分布韋恩圖??２０??

由Ｒａｎｋ－ａｂｕｎｄａｎｃｅ曲線所示（圖３－６），在水平方向，曲線在橫軸上的跨度較大，垂??直方向，曲線越下降平緩，說明物種的豐富度較高，物種分布均勻。??１０°??１?１?１?．?１?１?１???１０＇１?ｒ?－??＾?１〇．？?＿??１〇＊５?？：?－??０?１００?２００....

圖３－８：?ＨＵＡ組門水平物種相對豐度柱狀圖??

平的有５１４７個，注釋到屬水平的有３７９４個，注釋到種水平的有８１個，ＨＵＡ組注釋到門水??平的有４５８２個，注釋屬水平的有３３０７個ＡＳＶ，注釋到種水平的有８１個ＡＳＶ。??二、物種組成分析??本研究分別從門、綱、目、科、屬水平上對菌群進(jìn)行鑒定和分析，最終共鑒定丨５個??門，２....

本文編號：3902512