基于反向分子對(duì)接的三種木蘭科植物抗腫瘤活性研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-16 19:20
現(xiàn)今,越來(lái)越多的人遭受惡性腫瘤的嚴(yán)重威脅,據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)報(bào)道,2018年全球新發(fā)惡性腫瘤病例達(dá)到了 1810萬(wàn),有960多萬(wàn)人因惡性腫瘤而死亡,惡性腫瘤已成為了全球第二大導(dǎo)致死亡的原因。近年來(lái),由惡性腫瘤引起的發(fā)病和死亡率呈逐年急劇上升的趨勢(shì)。傳統(tǒng)癌癥療法(化學(xué)療法,放射療法,外科手術(shù)療法)的治療效果難以滿足人們的期望,也具有明顯的毒性和副作用。抗腫瘤分子靶向治療由于特異性好、毒副作用小等特點(diǎn)越來(lái)越受到專家學(xué)者的青睞,日益成為了一個(gè)熱門的研究課題。凹葉木蘭、中緬木蓮和紫玉蘭在西南地區(qū)作為傳統(tǒng)藥用植物對(duì)于許多疾病有著較好的治療價(jià)值,如行氣平喘、化濕導(dǎo)滯、治療鼻炎、頭痛、低血壓、疏肝理氣等功效。然而這三種傳統(tǒng)藥用植物在抗腫瘤活性方面的研究比較缺乏。因此本文利用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)中的反向分子對(duì)接方法,結(jié)合PharmaDB藥效團(tuán)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)凹葉木蘭、中緬木蓮、紫玉蘭中所提取的37種化合物,進(jìn)行抗腫瘤或抗癌研究,并分析化合物與癌癥相關(guān)受體蛋白的相互作用機(jī)制及化合物的藥代動(dòng)力學(xué)、毒理性質(zhì)。最后選取了紫玉蘭中提取的6種化合物進(jìn)行了體外抗腫瘤活性試驗(yàn)。37種化合物的反向分子對(duì)接結(jié)果表...
【文章來(lái)源】:中央民族大學(xué)北京市211工程院校985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 惡性腫瘤現(xiàn)狀
1.2 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的研究現(xiàn)狀
1.3 木蘭科植物的研究現(xiàn)狀
1.3.1 木蘭屬(Magnolia Linn.)植物研究現(xiàn)狀
1.3.2 木蓮屬(Manglietia Bl.)植物研究現(xiàn)狀
第2章 研究方法
2.1 實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
2.2 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)概述
2.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)原理及方法
2.3.1 優(yōu)化配體化合物的結(jié)構(gòu)
2.3.2 反向分子對(duì)接(Reverse Docking)
2.3.3 文獻(xiàn)研究法
2.3.4 全柔性分子對(duì)接(Flexible Docking)
2.3.5 化合物的藥代動(dòng)力學(xué)和毒理預(yù)測(cè)
2.3.6 化合物的抗腫瘤活性實(shí)驗(yàn)
第3章 37種化合物的反向分子對(duì)接結(jié)果分析
3.1 反向分子對(duì)接結(jié)果
3.2 反向分子對(duì)接結(jié)果分析
第4章 23種化合物的全柔性分子對(duì)接結(jié)果分析
第5章 23種化合物的藥代動(dòng)力學(xué)和毒理預(yù)測(cè)
5.1 藥代動(dòng)力學(xué)(ADMET)預(yù)測(cè)
5.2 毒理(TOPKAT)預(yù)測(cè)
第6章 紫玉蘭中6種化合物的抗腫瘤活性實(shí)驗(yàn)
6.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.1.1 細(xì)胞系
6.1.2 試劑及儀器
6.1.3 統(tǒng)計(jì)軟件
6.2 實(shí)驗(yàn)方法
6.2.1 細(xì)胞的復(fù)蘇
6.2.2 細(xì)胞的傳代培養(yǎng)
6.2.3 藥物作用
6.2.4 WST-1法
6.2.5 細(xì)胞凍存
6.3 結(jié)果分析
6.3.1 6種化合物抗BXPC-3細(xì)胞的活性
6.3.2 6種化合物抗MCF-7細(xì)胞的活性
第7章 結(jié)論與展望
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于反向分子對(duì)接和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)確定冬凌草甲素抗腫瘤的潛在作用機(jī)制[J]. 劉偉,張彥忠,白素平. 中國(guó)新藥雜志. 2019(17)
[2]Honokiol inhibits breast cancer cell metastasis by blocking EMT through modulation of Snail/Slug protein translation[J]. Wen-die Wang,Yue Shang,Yi Li,Shu-zhen Chen. Acta Pharmacologica Sinica. 2019(09)
[3]2014年中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病和死亡分析[J]. 陳萬(wàn)青,李賀,孫可欣,鄭榮壽,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),顧秀瑛,赫捷. 中華腫瘤雜志. 2018 (01)
[4]基于分子對(duì)接虛擬技術(shù)及Western blotting實(shí)驗(yàn)考察蒼耳亭對(duì)肝癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化作用靶點(diǎn)的影響[J]. 吳育,曹剛,石美琴,楊水英,姜曉燕. 藥物評(píng)價(jià)研究. 2017(11)
[5]廣玉蘭葉化學(xué)成分及其抗腫瘤活性研究[J]. 馬芳芳,胡占興,陳建,梁光義,徐必學(xué). 中國(guó)藥學(xué)雜志. 2016(12)
[6]GPR109A同源建模及其與吡唑類激動(dòng)劑對(duì)接模擬[J]. 楊帆,張藝鵬,黃佳琪,曹洪玉. 計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2016(05)
[7]抗腫瘤靶向藥物研究現(xiàn)狀[J]. 權(quán)修權(quán),樸惠順,康琳,尹學(xué)哲,高鐘鎬. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2015(05)
[8]木蘭屬植物的研究概況[J]. 馬芳芳,梁光義. 貴陽(yáng)中醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(01)
[9]我國(guó)木蓮屬植物研究進(jìn)展[J]. 付建生,董文淵,劉興東,趙敏燕. 林業(yè)調(diào)查規(guī)劃. 2014(02)
[10]世界衛(wèi)生組織發(fā)布《2014年世界癌癥報(bào)告》[J]. 中國(guó)衛(wèi)生政策研究. 2014(02)
博士論文
[1]多位點(diǎn)結(jié)合型流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的設(shè)計(jì)、合成與活性研究[D]. 張健.山東大學(xué) 2019
[2]基于多組學(xué)數(shù)據(jù)和網(wǎng)絡(luò)模型的復(fù)雜疾病靶標(biāo)預(yù)測(cè)及藥物基因組學(xué)研究[D]. 李杰.華東理工大學(xué) 2018
碩士論文
[1]基于深度學(xué)習(xí)的藥物活性研究[D]. 高雙印.新疆大學(xué) 2017
[2]核苷酸氧化損傷修復(fù)酶MTH1抑制劑的設(shè)計(jì)與合成[D]. 王曉麗.青島科技大學(xué) 2017
[3]凹葉木蘭和中緬木蓮中有抗腫瘤潛力的植物次生代謝產(chǎn)物研究[D]. 包楊梅.中央民族大學(xué) 2016
[4]計(jì)算藥物重定位策略在篩選AchE抑制劑中的應(yīng)用[D]. 趙東昱.大連理工大學(xué) 2015
[5]兩種民族地區(qū)藥用植物化學(xué)成分研究[D]. 藍(lán)曉聰.中央民族大學(xué) 2010
[6]N,N-二甲基-2-溴苯乙胺類衍生物和黃酮類化合物構(gòu)效關(guān)系的研究[D]. 杜娟.四川大學(xué) 2005
本文編號(hào):3628513
【文章來(lái)源】:中央民族大學(xué)北京市211工程院校985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 惡性腫瘤現(xiàn)狀
1.2 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的研究現(xiàn)狀
1.3 木蘭科植物的研究現(xiàn)狀
1.3.1 木蘭屬(Magnolia Linn.)植物研究現(xiàn)狀
1.3.2 木蓮屬(Manglietia Bl.)植物研究現(xiàn)狀
第2章 研究方法
2.1 實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
2.2 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)概述
2.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)原理及方法
2.3.1 優(yōu)化配體化合物的結(jié)構(gòu)
2.3.2 反向分子對(duì)接(Reverse Docking)
2.3.3 文獻(xiàn)研究法
2.3.4 全柔性分子對(duì)接(Flexible Docking)
2.3.5 化合物的藥代動(dòng)力學(xué)和毒理預(yù)測(cè)
2.3.6 化合物的抗腫瘤活性實(shí)驗(yàn)
第3章 37種化合物的反向分子對(duì)接結(jié)果分析
3.1 反向分子對(duì)接結(jié)果
3.2 反向分子對(duì)接結(jié)果分析
第4章 23種化合物的全柔性分子對(duì)接結(jié)果分析
第5章 23種化合物的藥代動(dòng)力學(xué)和毒理預(yù)測(cè)
5.1 藥代動(dòng)力學(xué)(ADMET)預(yù)測(cè)
5.2 毒理(TOPKAT)預(yù)測(cè)
第6章 紫玉蘭中6種化合物的抗腫瘤活性實(shí)驗(yàn)
6.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.1.1 細(xì)胞系
6.1.2 試劑及儀器
6.1.3 統(tǒng)計(jì)軟件
6.2 實(shí)驗(yàn)方法
6.2.1 細(xì)胞的復(fù)蘇
6.2.2 細(xì)胞的傳代培養(yǎng)
6.2.3 藥物作用
6.2.4 WST-1法
6.2.5 細(xì)胞凍存
6.3 結(jié)果分析
6.3.1 6種化合物抗BXPC-3細(xì)胞的活性
6.3.2 6種化合物抗MCF-7細(xì)胞的活性
第7章 結(jié)論與展望
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于反向分子對(duì)接和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)確定冬凌草甲素抗腫瘤的潛在作用機(jī)制[J]. 劉偉,張彥忠,白素平. 中國(guó)新藥雜志. 2019(17)
[2]Honokiol inhibits breast cancer cell metastasis by blocking EMT through modulation of Snail/Slug protein translation[J]. Wen-die Wang,Yue Shang,Yi Li,Shu-zhen Chen. Acta Pharmacologica Sinica. 2019(09)
[3]2014年中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病和死亡分析[J]. 陳萬(wàn)青,李賀,孫可欣,鄭榮壽,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),顧秀瑛,赫捷. 中華腫瘤雜志. 2018 (01)
[4]基于分子對(duì)接虛擬技術(shù)及Western blotting實(shí)驗(yàn)考察蒼耳亭對(duì)肝癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化作用靶點(diǎn)的影響[J]. 吳育,曹剛,石美琴,楊水英,姜曉燕. 藥物評(píng)價(jià)研究. 2017(11)
[5]廣玉蘭葉化學(xué)成分及其抗腫瘤活性研究[J]. 馬芳芳,胡占興,陳建,梁光義,徐必學(xué). 中國(guó)藥學(xué)雜志. 2016(12)
[6]GPR109A同源建模及其與吡唑類激動(dòng)劑對(duì)接模擬[J]. 楊帆,張藝鵬,黃佳琪,曹洪玉. 計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2016(05)
[7]抗腫瘤靶向藥物研究現(xiàn)狀[J]. 權(quán)修權(quán),樸惠順,康琳,尹學(xué)哲,高鐘鎬. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2015(05)
[8]木蘭屬植物的研究概況[J]. 馬芳芳,梁光義. 貴陽(yáng)中醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(01)
[9]我國(guó)木蓮屬植物研究進(jìn)展[J]. 付建生,董文淵,劉興東,趙敏燕. 林業(yè)調(diào)查規(guī)劃. 2014(02)
[10]世界衛(wèi)生組織發(fā)布《2014年世界癌癥報(bào)告》[J]. 中國(guó)衛(wèi)生政策研究. 2014(02)
博士論文
[1]多位點(diǎn)結(jié)合型流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的設(shè)計(jì)、合成與活性研究[D]. 張健.山東大學(xué) 2019
[2]基于多組學(xué)數(shù)據(jù)和網(wǎng)絡(luò)模型的復(fù)雜疾病靶標(biāo)預(yù)測(cè)及藥物基因組學(xué)研究[D]. 李杰.華東理工大學(xué) 2018
碩士論文
[1]基于深度學(xué)習(xí)的藥物活性研究[D]. 高雙印.新疆大學(xué) 2017
[2]核苷酸氧化損傷修復(fù)酶MTH1抑制劑的設(shè)計(jì)與合成[D]. 王曉麗.青島科技大學(xué) 2017
[3]凹葉木蘭和中緬木蓮中有抗腫瘤潛力的植物次生代謝產(chǎn)物研究[D]. 包楊梅.中央民族大學(xué) 2016
[4]計(jì)算藥物重定位策略在篩選AchE抑制劑中的應(yīng)用[D]. 趙東昱.大連理工大學(xué) 2015
[5]兩種民族地區(qū)藥用植物化學(xué)成分研究[D]. 藍(lán)曉聰.中央民族大學(xué) 2010
[6]N,N-二甲基-2-溴苯乙胺類衍生物和黃酮類化合物構(gòu)效關(guān)系的研究[D]. 杜娟.四川大學(xué) 2005
本文編號(hào):3628513
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