目的:三陰性乳腺癌（Triple negative breast cancer,TNBC）為乳腺癌中分子機(jī)制最復(fù)雜的分子亞型,其不表達(dá)其他三種乳腺癌分子分型中的任何靶向基因,因此備受關(guān)注。TNBC在乳腺癌中占10-20%,其中多為年輕女性,轉(zhuǎn)移率高、組織學(xué)分級高、易復(fù)發(fā)。TNBC的疾病機(jī)制仍未明確,臨床診治困難,本課題旨在:1、通過生物信息學(xué)方法篩選TNBC與正常乳腺組織差異表達(dá)的基因,分析其集中發(fā)揮的生物學(xué)功能,定位富集的細(xì)胞成分以及主要參與的信號通路,預(yù)測可能與TNBC預(yù)后相關(guān)基因,并分析有意義的差異表達(dá)基因在乳腺癌組織與細(xì)胞系中的表達(dá),從而確定可能在TNBC中影響其發(fā)生發(fā)展的核心基因。2、通過觀察關(guān)鍵基因Nek2和β-catenin在TNBC腫瘤組織與細(xì)胞系中的表達(dá),并分析其與TNBC患者臨床特征之間的關(guān)系,由此為TNBC臨床診斷挖掘新的理論依據(jù)及提供可靠的生物標(biāo)記物。方法:1、生物信息學(xué)分析TNBC發(fā)生發(fā)展相關(guān)的基因（1）篩選TNBC與非TNBC的腫瘤組織、正常乳腺基因芯片中的差異表達(dá)基因（1）從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫中挑選GSE3895... 

【文章來源】：山西醫(yī)科大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

GSE38959（A）與GSE27447（B）差異表達(dá)基因

DEG的基因本體GO分析

7山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文2.2.2KEGG/生物途徑分析信號通路分析顯示，細(xì)胞周期/有絲分裂、DNA復(fù)制、有絲分裂M--M/G1期和M期是上調(diào)的DEG參與的信號通路（圖1-3A）。腦實質(zhì)到上皮的轉(zhuǎn)化是所有下調(diào)的DEG參與的信號通路（圖1-3B）。圖1-3：DEG的KEGG/生物途徑分析2.3共同差異表達(dá)基因為了篩選兩個基因芯片中共同差異表達(dá)基因，對2個數(shù)據(jù)集的差異表達(dá)基因制作維恩圖，藍(lán)色代表GSE2447數(shù)據(jù)集中所有差異基因，黃代表GSE38959數(shù)據(jù)集中所有差異基因，灰黃色代表二者相交集的基因數(shù)。得到Nek2、THSD4、ESR1、TFF1、AGR3、RNF128、FOXA1、WIF1、PRR15、AZGP1、PMCHL1、LAMP3、ANKRD30A共13個共同差異表達(dá)基因（圖1-4）。圖1-4：共同差異表達(dá)基因維恩圖AB


本文編號：3400110