發(fā)布時間：2021-09-03 13:59

　　研究背景:肝細胞癌是嚴重影響生活質量和生命健康的消化系統(tǒng)常見的疾病之一,據最新數據表明,肝細胞癌占全球惡性腫瘤發(fā)病率第六位,在惡性腫瘤死因中占第四位。雖然目前對肝細胞癌的治療方法較多,且以手術治療為主,但絕大多數病人仍難免死于腫瘤的復發(fā)和轉移。然而目前對于其惡性程度高,治療效果差,患者預后不理想的確切分子機制尚不完全清楚,因此,探索新的基因功能改變與肝細胞癌發(fā)展的關系,對揭示肝細胞癌發(fā)生發(fā)展的分子機制、提高患者預后及生存重要的意義。核仁紡錘體相關蛋白（NUSAP1）是一種重要的微管結合蛋白,它在有絲分裂過程中參與微管交聯,調控著絲粒微管的功能,支配著染色體的擺動。此外,NUSAP1還調控紡錘體組裝、染色體分離和細胞分裂。近年來研究表明NUSAP1在黑素瘤、乳腺癌、急性骨髓性白血病等許多腫瘤中都存在高表達,但是NUSAP1與肝癌的關系以及參與細胞生物學過程中的確切機制并未十分明確。本研究旨在探討NUSAP1在HCC中的表達情況及其與預后不良之間的關系,同時探究NUSAP1在HCC發(fā)生發(fā)展過程中生物學作用及其分子機制,尋找HCC早期診斷相關的分子標志物和藥物作用靶點。方法:1、收集6個獨立... 

【文章來源】：南昌大學江西省 211工程院校

【文章頁數】：60 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

A用Meta分析對GEO數據庫中數據集篩選差異表達基因的流程圖

第3章結果24圖3.1B37個差異表達基因在肝細胞癌和正常組織中表達情況的可視化熱圖綜上，基于6個獨立數據集（5個GEO數據集和1個TCGA數據集）共714例肝細胞癌組織樣本和359例正常樣本的整合分析，我們共篩選出11個在所有數據集的肝細胞癌組織中都顯著且穩(wěn)定高表達的基因：BBOX1,CENPA,DLGAP5,FOXM1,KIF20A,KIF4A,MKI67,NCAPG,NUSAP1,SFN,和TPX2。由于其中大部分基因在癌癥中的發(fā)生發(fā)展作用已經在許多研究中得到證實，只有關于NUSAP1的研究甚少，雖然我們猜測NUSAP1可能參與肝細胞癌的發(fā)生發(fā)展，但其在肝細胞癌中的功能及作用仍然未知，因此我們對NUSAP1展開進一步的研究。3.2NUSAP1在HCC中高表達且與患者生存和臨床病理分型有關NUSAP1是一種約55KD大小的核仁蛋白，它是有絲分裂過程中紡錘體形成的重要組成部分。為了證實NUSAP1在肝細胞癌中的表達情況，我們整合了GEO數據庫中的6個數據集進行NUSAP1單個基因的Meta分析，通過計算標準化均

第3章結果25數差(SMD)及其95%CI繪制森林圖，如圖3.2A。結果表明，NUSAP1在肝細胞癌中的表達量是顯著高于正常肝組織對照組的，差異有統(tǒng)計學意義（95%CI=1.63-2.26，P=1.87×10-73）。并且6個數據集之間異質性較�。≒=0.11，I2=44%），結果可靠性強。圖3.2ANUSAP1在癌組織和正常組織表達差異Meta分析為了進一步研究NUSAP1在肝細胞癌發(fā)生發(fā)展中的作用，我們整合了轉錄組與臨床生存數據。我們將TCGA的肝癌相關表達數據分為兩組，即癌組織和非癌組織，進行表達差異分析。結果顯示NUSAP1在癌組織和非癌組織中的表達差異顯著(t值=8.93,P=7.17×1016如圖3.2B)，與上述Meta分析結果一致。同時，我們對肝癌的臨床樣本進行生存分析，以基因表達值的中位值為二分類閾值，將樣本分為高表達組和低表達組；進行LogRank檢驗發(fā)現NUSAP1高表達與NUSAP1低表達組的生存曲線有明顯差異，且差異有統(tǒng)計學意義（P=0.00929，圖3.2C），也就是說NUSAP1高表達的患者生存時間更短圖3.2BNUASP1在癌組織和癌旁組織中的表達程度圖3.2CNUSAP1表達與患者生存的關系


本文編號：3381242