目的:結(jié)直腸癌（colorectal cancer,CRC）是發(fā)病及死亡率均呈持續(xù)上升態(tài)勢的惡性消化道腫瘤之一。研究認為多因素參與了CRC的發(fā)生發(fā)展,近年來研究發(fā)現(xiàn)膽囊切除術可導致腸道微生物失調(diào),繼而膽酸代謝障礙,使患者處于結(jié)直腸癌的高危狀態(tài),然而究其腸道菌群特征變化是否因膽囊切除術后改變知之甚少。鑒于此,本研究采用高通量測序技術,探尋膽囊切除術后患者腸道菌群的一些改變在多樣性、分布及相對豐度的方面,目的研究結(jié)直腸癌發(fā)病原因是否涵蓋膽囊切除術后影響菌群變化這一方面。方法:選取在山西省人民醫(yī)院就診的,位于2018年3月至2019年9月時間段內(nèi),并符合要求的入組人員20例,其中健康志愿者4例、LC術后患者5例、結(jié)直腸癌患者6例、LC術后結(jié)直腸癌患者5例,并采集相應糞便標本20例,對采集的糞便樣本分組（A、B、C、D組）。再對樣本相關細菌進行DNA提取與檢測,PCR擴增、產(chǎn)物純化等相關操作,再通過生物信息學分析獲得特定實驗樣品中細菌物種組成、復雜性及分布變化等諸多信息。結(jié)果:實驗共得到了835502條高質(zhì)量擴增特征序列（即OTU）,后按99%序列相似性聚類,為獲得物種注釋信息對比核糖體RNA... 

【文章來源】：山西醫(yī)科大學山西省

【文章頁數(shù)】：37 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

B分別為各組在門、AB

6本研究的Alphal稀釋曲線走勢趨于平緩，表明此次測序結(jié)果的已經(jīng)可以代表樣本的復雜程度，繼續(xù)增加測序深度將無意義。我們對Group1（A組、B組、C組、D組）、Group2（健康組、腫瘤組）、Group3（A組、B組）、Group4（A組、C組）、Group5（B組、D組）、Group6（C組、D組）的相關菌群的物種多樣性進行了比較分析。在得到整體的Alpha多樣性指數(shù)后，比較各分組之間多樣性指數(shù)用KruskalWallis方法差異無統(tǒng)計學差異（P＞0.05）。詳見圖2及表1.A圖1A、B分別為各組在門、屬水平上的菌群組成及相對豐度A圖2（A）稀釋性曲線。（B）shnnon指數(shù)的箱型圖。（C）shnnon指數(shù)的組間多重比較。BACGroupsB

7圖3LEfSe分析LDA柱狀圖（LDA＞2，物種在組間具有統(tǒng)計學差異）圖4LEfSe分析的cladogram圖說明：cladogram圖由內(nèi)到外，對應界門綱目科屬不同的分類層級，層級間連線表所屬關系。每個圓圈節(jié)點代表一個物種，節(jié)點為黃色代表在分組間差異不顯著，不為黃色則代表該物種是對應顏色分組的特征微生物（在該分組豐度顯著較高）。有顏色的扇形區(qū)域標注了特征微生物的下屬分類區(qū)間。表1各組間物種多樣性差異分析結(jié)果Group1Group2SamplesizePermutationsPseudo-FP-valueAB99991.380.175C109990.980.430D99991.210.263ABC

【參考文獻】：
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博士論文
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本文編號：3362701