目的:結(jié)直腸癌（colorectal cancer,CRC）是發(fā)病及死亡率均呈持續(xù)上升態(tài)勢(shì)的惡性消化道腫瘤之一。研究認(rèn)為多因素參與了CRC的發(fā)生發(fā)展,近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)膽囊切除術(shù)可導(dǎo)致腸道微生物失調(diào),繼而膽酸代謝障礙,使患者處于結(jié)直腸癌的高危狀態(tài),然而究其腸道菌群特征變化是否因膽囊切除術(shù)后改變知之甚少。鑒于此,本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),探尋膽囊切除術(shù)后患者腸道菌群的一些改變?cè)诙鄻有�、分布及相�?duì)豐度的方面,目的研究結(jié)直腸癌發(fā)病原因是否涵蓋膽囊切除術(shù)后影響菌群變化這一方面。方法:選取在山西省人民醫(yī)院就診的,位于2018年3月至2019年9月時(shí)間段內(nèi),并符合要求的入組人員20例,其中健康志愿者4例、LC術(shù)后患者5例、結(jié)直腸癌患者6例、LC術(shù)后結(jié)直腸癌患者5例,并采集相應(yīng)糞便標(biāo)本20例,對(duì)采集的糞便樣本分組（A、B、C、D組）。再對(duì)樣本相關(guān)細(xì)菌進(jìn)行DNA提取與檢測(cè),PCR擴(kuò)增、產(chǎn)物純化等相關(guān)操作,再通過(guò)生物信息學(xué)分析獲得特定實(shí)驗(yàn)樣品中細(xì)菌物種組成、復(fù)雜性及分布變化等諸多信息。結(jié)果:實(shí)驗(yàn)共得到了835502條高質(zhì)量擴(kuò)增特征序列（即OTU）,后按99%序列相似性聚類,為獲得物種注釋信息對(duì)比核糖體RNA... 

【文章來(lái)源】：山西醫(yī)科大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】：37 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

B分別為各組在門、AB

6本研究的Alphal稀釋曲線走勢(shì)趨于平緩，表明此次測(cè)序結(jié)果的已經(jīng)可以代表樣本的復(fù)雜程度，繼續(xù)增加測(cè)序深度將無(wú)意義。我們對(duì)Group1（A組、B組、C組、D組）、Group2（健康組、腫瘤組）、Group3（A組、B組）、Group4（A組、C組）、Group5（B組、D組）、Group6（C組、D組）的相關(guān)菌群的物種多樣性進(jìn)行了比較分析。在得到整體的Alpha多樣性指數(shù)后，比較各分組之間多樣性指數(shù)用KruskalWallis方法差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P＞0.05）。詳見(jiàn)圖2及表1.A圖1A、B分別為各組在門、屬水平上的菌群組成及相對(duì)豐度A圖2（A）稀釋性曲線。（B）shnnon指數(shù)的箱型圖。（C）shnnon指數(shù)的組間多重比較。BACGroupsB

7圖3LEfSe分析LDA柱狀圖（LDA＞2，物種在組間具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異）圖4LEfSe分析的cladogram圖說(shuō)明：cladogram圖由內(nèi)到外，對(duì)應(yīng)界門綱目科屬不同的分類層級(jí)，層級(jí)間連線表所屬關(guān)系。每個(gè)圓圈節(jié)點(diǎn)代表一個(gè)物種，節(jié)點(diǎn)為黃色代表在分組間差異不顯著，不為黃色則代表該物種是對(duì)應(yīng)顏色分組的特征微生物（在該分組豐度顯著較高）。有顏色的扇形區(qū)域標(biāo)注了特征微生物的下屬分類區(qū)間。表1各組間物種多樣性差異分析結(jié)果Group1Group2SamplesizePermutationsPseudo-FP-valueAB99991.380.175C109990.980.430D99991.210.263ABC

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]腸道微生物刺激組織蛋白酶K分泌介導(dǎo)TLR4依賴的M2巨噬細(xì)胞極化并促進(jìn)結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移[D]. 李睿.南方醫(yī)科大學(xué) 2019



本文編號(hào)：3362701