環(huán)狀RNA circSP3通過作為miR-198的海綿調(diào)節(jié)CDK4的表達(dá)促進(jìn)肝細(xì)胞癌的增殖、遷移和侵襲
發(fā)布時(shí)間:2021-08-22 04:22
目的:探究在肝細(xì)胞肝癌中circSP3的表達(dá)、作用以及circSP3通過作為miR-198海綿調(diào)節(jié)CDK4的表達(dá)從而促進(jìn)肝細(xì)胞癌的增殖、遷移和侵襲的相關(guān)機(jī)制。方法:采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)circSP3在肝細(xì)胞癌患者癌組織和癌旁肝組織中的表達(dá)水平,此外檢測(cè)4種肝癌細(xì)胞(Hep-3B、Huh7、Bel-7402、SMMC-7721)和正常肝細(xì)胞(HL-77O2)中的表達(dá)水平。使用質(zhì)粒轉(zhuǎn)染以及慢病毒感染Hep-3B和Huh-7細(xì)胞,從而篩選得到過表達(dá)以及敲低circSP3表達(dá)的肝癌細(xì)胞株。同時(shí)采用CCK-8實(shí)驗(yàn),Transwell遷移實(shí)驗(yàn)和Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)分別檢測(cè)circSP3對(duì)肝癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響。采用裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證circSP3在體內(nèi)對(duì)細(xì)胞增殖活性的影響。然后使用生物信息學(xué)分析,qRT-PCR,雙熒光素酶測(cè)定和蛋白質(zhì)印跡分析circSP3,miR-198和CDK4之間的關(guān)系。之后的救援實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證circSP3通過作為miR-198海綿調(diào)節(jié)CDK4的表達(dá)從而促進(jìn)肝細(xì)胞癌的增殖、遷移和侵襲。結(jié)果:qRT-PCR結(jié)果表明,相比與癌旁肝組織和正常肝...
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
circSP3在HCC組織中的表達(dá)水平Figure1.RelativeexpressionofcircSP3inHCCtissues.qRT-PCR檢測(cè)50對(duì)HCC組織和對(duì)應(yīng)癌旁肝組織中circSP3的表達(dá)水平
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文282.2circSP3環(huán)狀結(jié)構(gòu)確定通過Sanger測(cè)序,數(shù)據(jù)庫(kù)查詢和RNaseR處理確認(rèn)circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。CircSP3(chr2:174,819,600–174,820,960)源自SP3基因座中的外顯子區(qū)域,該區(qū)域位于染色體2q31.1(圖2A)上。為了確認(rèn)circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu),我們首先將circSP3的PCR產(chǎn)物插入T載體進(jìn)行Sanger測(cè)序。如圖2B所示,測(cè)序結(jié)果與circBase提供的circSP3的反向剪接區(qū)域一致。另外,我們?cè)O(shè)計(jì)了兩組引物,一組用于環(huán)形轉(zhuǎn)錄本的引物,另一組用于線性轉(zhuǎn)錄本的引物。然后,我們將circRNA敲低質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到細(xì)胞中,并使用RTPCR檢測(cè)SP3的環(huán)狀和線性轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平。結(jié)果表明,circSP3水平顯著降低,而SP3線性轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)水平?jīng)]有變化(圖2C)。最后,對(duì)RNA進(jìn)行RNaseR核酸外切酶的消化抗性實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,使用RNaseR核酸外切酶處理之后線性SP3表達(dá)水平被明顯降低,而circSP3的表達(dá)水平?jīng)]有明顯變化(圖2D)?傮w而言,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明了circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。圖2.circSP3環(huán)狀結(jié)構(gòu)確定Figure2.ConfirmationofcircularstructureofcircSP3A,B.Sange測(cè)序以及數(shù)據(jù)庫(kù)查詢驗(yàn)證circSP3的位置以及環(huán)化位點(diǎn)。
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文29C,D.qRT-PCR檢測(cè)circSP3敲低以及RnaseR處理后線性SP3和circSP3的表達(dá)。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。A,B.SangesequencinganddatabasequeryverifythepositionofcircSP3andthecircularizationsite.C,D.qRT-PCRwasusedtodetectcircSP3knockdownandlinearSP3andcircSP3expressionafterRnaseRtreatment.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.2.3circSP3在HCC細(xì)胞中的表達(dá)采用qRT-PCR對(duì)4種HCC細(xì)胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝細(xì)胞(HL-77O2)中circSP3的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,同正常肝細(xì)胞相比,4種HCC細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平均顯著上調(diào);相對(duì)于正常肝細(xì)胞,Hep-3B(P<0.05),SMMC-7721(P<0.001),Bel-7402(P<0.001)和Huh7(P<0.001),中circSP3的表達(dá)量分別為:1.440±0.1286,1.603±0.05783,1.637±0.03180,2.222±0.1931。4種HCC細(xì)胞中,Huh-7細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平最高,而Hep-3B細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平最低。因此選用Hep-3B細(xì)胞和Huh-7細(xì)胞作為后續(xù)實(shí)驗(yàn)對(duì)象。圖3.circSP3在HCC細(xì)胞中的表達(dá)水平Figure3.ExpressionofcircSP3inHCCcelllines.qRT-PCR檢測(cè)4種HCC細(xì)胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝細(xì)胞(HL-77O2)中circSP3的表達(dá)水平。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。RelativecircSP3expressionlevelsinfiveHCCcelllines(Hep-3B,Huh7,SMMC-7721andBel-7402)andonenormalhumanhepatocyte(HL-7702)wasdetectedbyqRT-PCR.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.
本文編號(hào):3356993
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
circSP3在HCC組織中的表達(dá)水平Figure1.RelativeexpressionofcircSP3inHCCtissues.qRT-PCR檢測(cè)50對(duì)HCC組織和對(duì)應(yīng)癌旁肝組織中circSP3的表達(dá)水平
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文282.2circSP3環(huán)狀結(jié)構(gòu)確定通過Sanger測(cè)序,數(shù)據(jù)庫(kù)查詢和RNaseR處理確認(rèn)circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。CircSP3(chr2:174,819,600–174,820,960)源自SP3基因座中的外顯子區(qū)域,該區(qū)域位于染色體2q31.1(圖2A)上。為了確認(rèn)circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu),我們首先將circSP3的PCR產(chǎn)物插入T載體進(jìn)行Sanger測(cè)序。如圖2B所示,測(cè)序結(jié)果與circBase提供的circSP3的反向剪接區(qū)域一致。另外,我們?cè)O(shè)計(jì)了兩組引物,一組用于環(huán)形轉(zhuǎn)錄本的引物,另一組用于線性轉(zhuǎn)錄本的引物。然后,我們將circRNA敲低質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到細(xì)胞中,并使用RTPCR檢測(cè)SP3的環(huán)狀和線性轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平。結(jié)果表明,circSP3水平顯著降低,而SP3線性轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)水平?jīng)]有變化(圖2C)。最后,對(duì)RNA進(jìn)行RNaseR核酸外切酶的消化抗性實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,使用RNaseR核酸外切酶處理之后線性SP3表達(dá)水平被明顯降低,而circSP3的表達(dá)水平?jīng)]有明顯變化(圖2D)?傮w而言,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明了circSP3的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。圖2.circSP3環(huán)狀結(jié)構(gòu)確定Figure2.ConfirmationofcircularstructureofcircSP3A,B.Sange測(cè)序以及數(shù)據(jù)庫(kù)查詢驗(yàn)證circSP3的位置以及環(huán)化位點(diǎn)。
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文29C,D.qRT-PCR檢測(cè)circSP3敲低以及RnaseR處理后線性SP3和circSP3的表達(dá)。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。A,B.SangesequencinganddatabasequeryverifythepositionofcircSP3andthecircularizationsite.C,D.qRT-PCRwasusedtodetectcircSP3knockdownandlinearSP3andcircSP3expressionafterRnaseRtreatment.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.2.3circSP3在HCC細(xì)胞中的表達(dá)采用qRT-PCR對(duì)4種HCC細(xì)胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝細(xì)胞(HL-77O2)中circSP3的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,同正常肝細(xì)胞相比,4種HCC細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平均顯著上調(diào);相對(duì)于正常肝細(xì)胞,Hep-3B(P<0.05),SMMC-7721(P<0.001),Bel-7402(P<0.001)和Huh7(P<0.001),中circSP3的表達(dá)量分別為:1.440±0.1286,1.603±0.05783,1.637±0.03180,2.222±0.1931。4種HCC細(xì)胞中,Huh-7細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平最高,而Hep-3B細(xì)胞中circSP3的表達(dá)水平最低。因此選用Hep-3B細(xì)胞和Huh-7細(xì)胞作為后續(xù)實(shí)驗(yàn)對(duì)象。圖3.circSP3在HCC細(xì)胞中的表達(dá)水平Figure3.ExpressionofcircSP3inHCCcelllines.qRT-PCR檢測(cè)4種HCC細(xì)胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝細(xì)胞(HL-77O2)中circSP3的表達(dá)水平。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。RelativecircSP3expressionlevelsinfiveHCCcelllines(Hep-3B,Huh7,SMMC-7721andBel-7402)andonenormalhumanhepatocyte(HL-7702)wasdetectedbyqRT-PCR.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.
本文編號(hào):3356993
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