膀胱癌關(guān)鍵基因篩選以及與臨床特征的相關(guān)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-14 14:07
目的:在泌尿外科疾病中,膀胱癌十分常見(jiàn)。近年來(lái),我國(guó)膀胱癌的發(fā)病率有所上升,盡管采取了許多積極的治療措施,但晚期或轉(zhuǎn)移性膀胱癌患者的生存狀況仍然很差,同時(shí)膀胱癌患者的預(yù)后監(jiān)測(cè)也是疾病管理中的一大難題,所以尋找可靠的分子標(biāo)志物進(jìn)行早期診斷和預(yù)后監(jiān)測(cè)成為一個(gè)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。本研究通過(guò)比較GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中膀胱癌和正常組織的基因表達(dá),篩選出與膀胱癌發(fā)生、發(fā)展高度相關(guān)的基因,進(jìn)一步分析基因表達(dá)水平與各種臨床資料參數(shù)和預(yù)后之間的關(guān)系,并探討這些基因的分子機(jī)制。為尋找膀胱癌潛在的分子診斷標(biāo)志物和精準(zhǔn)的靶向治療提供一定的科學(xué)依據(jù)。方法:GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索關(guān)鍵詞“bladder cancer”,下載膀胱癌基因芯片數(shù)據(jù),采用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的在線分析工具GEO2R篩選差異表達(dá)基因,對(duì)篩選出的差異基因進(jìn)行GO和KEEG富集分析,研究其分子功能及信號(hào)通路。應(yīng)用String在線工具構(gòu)建蛋白—蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),下載Cytoscape軟件,應(yīng)用軟件中的MCODE插件分析蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因。在GEPIA網(wǎng)站中分析關(guān)鍵基因與預(yù)后的關(guān)系,應(yīng)用SPSS25.0軟件的卡方檢驗(yàn)分析關(guān)鍵(Hub)基因的表達(dá)水平與病理級(jí)別、年...
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:39 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
共表達(dá)基因
山西醫(yī)科大學(xué)(博)碩士學(xué)位論文8圖2膀胱癌關(guān)鍵基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)紅色:表達(dá)上調(diào)基因藍(lán)色:表達(dá)下調(diào)基因2.4關(guān)鍵基因的預(yù)后生存分析通過(guò)GEPIA網(wǎng)站分析22個(gè)核心基因與膀胱癌患者預(yù)后的關(guān)系,結(jié)果顯示STON1、SDPR、APOD、DCN基因高表達(dá)組的中位生存時(shí)間明顯低于低表達(dá)組(p<0.05),TK1、COL16A1、MS4A6、CCNB2、KIF2等基因高表達(dá)組與低表達(dá)組之間中位生存時(shí)間相比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。以上結(jié)果表明STON1、SDPR、APOD、DCN基因的表達(dá)水平與患者總生存期明顯相關(guān)(P<0.05),基因的高表達(dá)不利于患者的預(yù)后生存(圖3-6)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同侵襲性膀胱癌患者預(yù)后與基因差異表達(dá)研究[J]. 韓耕宇,李華福,許宸,謝群. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)電子雜志. 2018(11)
本文編號(hào):3284292
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:39 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
共表達(dá)基因
山西醫(yī)科大學(xué)(博)碩士學(xué)位論文8圖2膀胱癌關(guān)鍵基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)紅色:表達(dá)上調(diào)基因藍(lán)色:表達(dá)下調(diào)基因2.4關(guān)鍵基因的預(yù)后生存分析通過(guò)GEPIA網(wǎng)站分析22個(gè)核心基因與膀胱癌患者預(yù)后的關(guān)系,結(jié)果顯示STON1、SDPR、APOD、DCN基因高表達(dá)組的中位生存時(shí)間明顯低于低表達(dá)組(p<0.05),TK1、COL16A1、MS4A6、CCNB2、KIF2等基因高表達(dá)組與低表達(dá)組之間中位生存時(shí)間相比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。以上結(jié)果表明STON1、SDPR、APOD、DCN基因的表達(dá)水平與患者總生存期明顯相關(guān)(P<0.05),基因的高表達(dá)不利于患者的預(yù)后生存(圖3-6)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同侵襲性膀胱癌患者預(yù)后與基因差異表達(dá)研究[J]. 韓耕宇,李華福,許宸,謝群. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)電子雜志. 2018(11)
本文編號(hào):3284292
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