16S rDNA高通量測序分析肉芽腫性小葉性乳腺炎的菌群特征
發(fā)布時間:2021-07-11 04:09
目的:探討改進肉芽腫性小葉性乳腺炎病灶中細菌檢測的方法,評估比較肉芽腫性小葉性乳腺炎中的肉芽腫和病灶旁組織中的菌群分布差異,進一步研究肉芽腫性小葉性乳腺炎與細菌感染的關系。方法:收集2018年6月2020年4月于湖南省人民醫(yī)院初治新發(fā)的46例經(jīng)病理確診的肉芽腫性小葉性乳腺炎患者的病例資料,選擇術前2周內(nèi)未進行抗感染治療的14例患者作為研究對象,于手術室無菌條件下收取每例患者的肉芽腫病灶、病灶旁組織(介于正常組織和病灶之間的組織,且距離病灶至少12cm)以及膿液樣本各1份,共取得36份樣本(其中膿液樣本9份,肉芽腫樣本14份,病灶旁組織樣本13份),將收集到的9份膿液樣本及時接種于培養(yǎng)基中,進行微生物培養(yǎng)與鑒定。另將收集到的14份肉芽腫組織樣本設置為RY組,13份病灶旁組織樣本設置為ZF組,提取兩組樣本的DNA,應用高通量測序技術,對RY及ZF組菌群進行16S rDNA測序,并利用QIIME等軟件將測序結果與16S數(shù)據(jù)庫比對進行物種注釋,根據(jù)物種豐度信息進行物種分類與豐度分析、Alpha多樣性分析及Beta多樣性分析,進一步對肉芽腫性小葉性乳腺...
【文章來源】:湖南師范大學湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本稀釋曲線
物種累積箱型圖
碩士學位論文14兩個指標,以衡量兩個樣本間的相異系數(shù),在物種多樣性方面,其數(shù)值大小反映了這兩個樣本間存在的差異大校并基于Unifrac進行主坐標分析(PCoA,PrincipalCo-ordinatesAnalysis),見圖6、圖7。圖6基于WeightedUnifrac距離的PCoA分析圖圖7基于UnweightedUnifrac距離的PCoA分析圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肉芽腫性小葉性乳腺炎300例臨床病理學分析[J]. 陳玲,張曉云,王延文,趙秋楓,丁華野. 中華病理學雜志. 2019 (03)
[2]乳腺炎性病變臨床診治[J]. 徐紅,王雋婕. 武警醫(yī)學. 2019(01)
[3]非哺乳期乳腺炎病因?qū)W研究進展[J]. 屠道遠,甄林林,李振,趙瑞鵬,劉敏敏,厲芝. 中華乳腺病雜志(電子版). 2018(01)
[4]16S rDNA基因序列分析在非哺乳期乳腺炎病原菌檢測中的應用價值[J]. 周飛,劉璐,劉麗媛,王斐,于理想,相玉娟,馬忠兵,余之剛. 山東大學學報(醫(yī)學版). 2018(01)
[5]肉芽腫小葉性乳腺炎的治療進展[J]. 朱耀華,范培芝,張超杰. 醫(yī)學與哲學(B). 2016(05)
[6]Aetiology of idiopathic granulomatous mastitis[J]. Fatih Altintoprak,Taner Kivilcim,Orhan Veli Ozkan. World Journal of Clinical Cases. 2014(12)
[7]非哺乳期乳腺炎的免疫學研究進展[J]. 張超杰,孔成. 大連醫(yī)科大學學報. 2014(04)
[8]非哺乳期乳腺炎的現(xiàn)代研究進展[J]. 肖薔,張超杰. 醫(yī)學與哲學(B). 2013(03)
[9]動態(tài)磁共振成像在肉芽腫性乳腺炎手術評估中的應用價值[J]. 張超杰,范培芝,劉鵬,張志功. 中國現(xiàn)代醫(yī)學雜志. 2012(21)
[10]非哺乳期乳腺炎27例原因分析與治療體會[J]. 谷云芝,宋德余. 中國誤診學雜志. 2010(28)
碩士論文
[1]初步分析肉芽腫小葉性乳腺炎影響因素及分類治療效果[D]. 朱耀華.湖南師范大學 2018
[2]華南地區(qū)肉芽腫性小葉性乳腺炎的細菌學研究[D]. 王業(yè)勝.廣東藥科大學 2017
[3]CD68、CD163、CD57、IgG4在肉芽腫性乳腺炎中的表達及其臨床意義[D]. 孔成.湖南師范大學 2016
本文編號:3277306
【文章來源】:湖南師范大學湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本稀釋曲線
物種累積箱型圖
碩士學位論文14兩個指標,以衡量兩個樣本間的相異系數(shù),在物種多樣性方面,其數(shù)值大小反映了這兩個樣本間存在的差異大校并基于Unifrac進行主坐標分析(PCoA,PrincipalCo-ordinatesAnalysis),見圖6、圖7。圖6基于WeightedUnifrac距離的PCoA分析圖圖7基于UnweightedUnifrac距離的PCoA分析圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肉芽腫性小葉性乳腺炎300例臨床病理學分析[J]. 陳玲,張曉云,王延文,趙秋楓,丁華野. 中華病理學雜志. 2019 (03)
[2]乳腺炎性病變臨床診治[J]. 徐紅,王雋婕. 武警醫(yī)學. 2019(01)
[3]非哺乳期乳腺炎病因?qū)W研究進展[J]. 屠道遠,甄林林,李振,趙瑞鵬,劉敏敏,厲芝. 中華乳腺病雜志(電子版). 2018(01)
[4]16S rDNA基因序列分析在非哺乳期乳腺炎病原菌檢測中的應用價值[J]. 周飛,劉璐,劉麗媛,王斐,于理想,相玉娟,馬忠兵,余之剛. 山東大學學報(醫(yī)學版). 2018(01)
[5]肉芽腫小葉性乳腺炎的治療進展[J]. 朱耀華,范培芝,張超杰. 醫(yī)學與哲學(B). 2016(05)
[6]Aetiology of idiopathic granulomatous mastitis[J]. Fatih Altintoprak,Taner Kivilcim,Orhan Veli Ozkan. World Journal of Clinical Cases. 2014(12)
[7]非哺乳期乳腺炎的免疫學研究進展[J]. 張超杰,孔成. 大連醫(yī)科大學學報. 2014(04)
[8]非哺乳期乳腺炎的現(xiàn)代研究進展[J]. 肖薔,張超杰. 醫(yī)學與哲學(B). 2013(03)
[9]動態(tài)磁共振成像在肉芽腫性乳腺炎手術評估中的應用價值[J]. 張超杰,范培芝,劉鵬,張志功. 中國現(xiàn)代醫(yī)學雜志. 2012(21)
[10]非哺乳期乳腺炎27例原因分析與治療體會[J]. 谷云芝,宋德余. 中國誤診學雜志. 2010(28)
碩士論文
[1]初步分析肉芽腫小葉性乳腺炎影響因素及分類治療效果[D]. 朱耀華.湖南師范大學 2018
[2]華南地區(qū)肉芽腫性小葉性乳腺炎的細菌學研究[D]. 王業(yè)勝.廣東藥科大學 2017
[3]CD68、CD163、CD57、IgG4在肉芽腫性乳腺炎中的表達及其臨床意義[D]. 孔成.湖南師范大學 2016
本文編號:3277306
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