新型脂肪細胞因子網(wǎng)膜素核心啟動子區(qū)轉錄因子的篩選及驗證
發(fā)布時間:2021-01-22 17:45
背景:網(wǎng)膜素是一種新型脂肪因子,也被稱為腸凝集素-1(Intelectin-1,ITLN-1)。ITLN-1不僅與肥胖癥、糖尿病等疾病關系密切,其在抗炎癥、抗動脈粥樣硬化、抑制腫瘤細胞增殖中的突出作用也得到眾多科研工作者的關注。有研究表明缺血性腦卒中穩(wěn)定斑塊組患者血清的ITLN-1水平高于不穩(wěn)定頸動脈斑塊組。不同個體間的ITLN-1水平具有著明顯差異。ITLN-1在人內皮細胞、網(wǎng)織紅細胞以及結腸、卵巢、肺和胎盤等組織中均有不同程度的表達,但在皮下脂肪中檢測不到。因此研究人ITLN-1基因的轉錄調控機制將有重要的研究意義。DNA pull down是一種基于DNA短片段擁有對DNA結合蛋白的高親和力位點并借助生物素/鏈霉親和素純化系統(tǒng)開發(fā)出的一種技術,廣泛應用于DNA-蛋白質相互作用的研究中。目的:為進一步探索ITLN-1在表達過程中受到的轉錄調控機制,我們使用前期實驗確定出的ITLN-1核心啟動子區(qū)序列為DNA探針進行DNA pull down實驗。對結合在該序列的蛋白質進行富集,結合生信分析篩選出轉錄因子,通過小干擾RNA和雙熒光素酶報告基因實驗初步確定出該轉錄因子對ITLN-1表達...
【文章來源】: 牛曉晨 延安大學
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
(1)(2)瓊脂糖凝膠電泳對目的探針進行分離、純化并回收FIG.3-1(1)(2)Separation,purificationandrecoveryofthetargetprobebyagarosegelelectrophoresis
-23-(2)圖3-1(1)(2)瓊脂糖凝膠電泳對目的探針進行分離、純化并回收FIG.3-1(1)(2)Separation,purificationandrecoveryofthetargetprobebyagarosegelelectrophoresis注:純化biotin(0/+296)即對瓊脂糖凝膠中ITLN-1核心啟動子區(qū)序列經(jīng)純化、回收后得到的目的探針。圖3-2通過WB檢測HEK293細胞核提取物純度Figure3-2DetectionofHEK293nuclearextractpuritybyWB注:GAPDH(37kDa)為胞漿蛋白內參;H3,histone(17kDa)核蛋白內參
-24-3.1.2pulldown根據(jù)DNAPull-down試劑盒說明書操作,將目的探針和陰性探針分別與核蛋白孵育,下拉,對下拉產(chǎn)物進行PAGE-銀染,銀染結果如圖3-3(1)所示。在70kDa、100kDa、130kDa處實驗組(DPD1、DPD2)條帶顏色均明顯較對照組(NC1、NC2)深,其余條帶則無明顯差異。分別將對照組及實驗組在70kDa、100kDa、130kDa處的條帶切膠送質譜檢測,如圖3-3(2)所示。(1)(2)圖3-3(1)(2)DNApulldown產(chǎn)物SDS-PAGE后銀染Figure3-3(1)(2)SilverstainingafterSDS-PAGEofDNApulldownproduct注:Marker為蛋白質分子量標準;NC1為使用陰性探針(NC探針)下拉產(chǎn)物,NC2為其復孔;DPD1為使用目的探針(DPD探針)下拉產(chǎn)物,DPD2為其復孔;Input為HEK293細胞核提取物。N1、N2、N3、D1、D2、D3為NC探針與DPD探針分別下拉產(chǎn)物出現(xiàn)的差異性條帶。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Role of hepatocyte nuclear factor 4-alpha in gastrointestinal and liver diseases[J]. Matthew M Yeh,Dustin E Bosch,Sayed S Daoud. World Journal of Gastroenterology. 2019(30)
本文編號:2993649
【文章來源】: 牛曉晨 延安大學
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
(1)(2)瓊脂糖凝膠電泳對目的探針進行分離、純化并回收FIG.3-1(1)(2)Separation,purificationandrecoveryofthetargetprobebyagarosegelelectrophoresis
-23-(2)圖3-1(1)(2)瓊脂糖凝膠電泳對目的探針進行分離、純化并回收FIG.3-1(1)(2)Separation,purificationandrecoveryofthetargetprobebyagarosegelelectrophoresis注:純化biotin(0/+296)即對瓊脂糖凝膠中ITLN-1核心啟動子區(qū)序列經(jīng)純化、回收后得到的目的探針。圖3-2通過WB檢測HEK293細胞核提取物純度Figure3-2DetectionofHEK293nuclearextractpuritybyWB注:GAPDH(37kDa)為胞漿蛋白內參;H3,histone(17kDa)核蛋白內參
-24-3.1.2pulldown根據(jù)DNAPull-down試劑盒說明書操作,將目的探針和陰性探針分別與核蛋白孵育,下拉,對下拉產(chǎn)物進行PAGE-銀染,銀染結果如圖3-3(1)所示。在70kDa、100kDa、130kDa處實驗組(DPD1、DPD2)條帶顏色均明顯較對照組(NC1、NC2)深,其余條帶則無明顯差異。分別將對照組及實驗組在70kDa、100kDa、130kDa處的條帶切膠送質譜檢測,如圖3-3(2)所示。(1)(2)圖3-3(1)(2)DNApulldown產(chǎn)物SDS-PAGE后銀染Figure3-3(1)(2)SilverstainingafterSDS-PAGEofDNApulldownproduct注:Marker為蛋白質分子量標準;NC1為使用陰性探針(NC探針)下拉產(chǎn)物,NC2為其復孔;DPD1為使用目的探針(DPD探針)下拉產(chǎn)物,DPD2為其復孔;Input為HEK293細胞核提取物。N1、N2、N3、D1、D2、D3為NC探針與DPD探針分別下拉產(chǎn)物出現(xiàn)的差異性條帶。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Role of hepatocyte nuclear factor 4-alpha in gastrointestinal and liver diseases[J]. Matthew M Yeh,Dustin E Bosch,Sayed S Daoud. World Journal of Gastroenterology. 2019(30)
本文編號:2993649
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