MHC區(qū)域HLA-DPB1基因和BTNL2基因與漢族人銀屑病臨床表型相關(guān)性研究
本文選題:HLA + 尋常型銀屑病; 參考:《安徽醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:研究背景 銀屑病是一種涉及多基因和多因素的慢性復(fù)雜性疾病,目前銀屑病的確切發(fā)病機(jī)制尚不清楚,主要認(rèn)為由遺傳因素、免疫因素、皮膚屏障功能和環(huán)境因素等共同的相互作用引起。臨床上以尋常型銀屑病(psoriasis vulgaris,PV)最常見。全世界約1-3%人口受銀屑病的影響。其中中國(guó)人口中銀屑病的患病率約為0.123%。最新的研究通過對(duì)漢族人口9906例健康對(duì)照和8874例銀屑病患者HLA區(qū)域的深度測(cè)序,發(fā)現(xiàn)了HLA-DPB1*05:01、BTNL2基因?yàn)殂y屑病新的易感基因。本實(shí)驗(yàn)在此基礎(chǔ)上,通過進(jìn)一步對(duì)9906例健康對(duì)照和8874例尋常型銀屑病病例進(jìn)行臨床分型(性別、家族史、發(fā)病年齡、發(fā)病類型、地域)的分層分析,探討HLA-DPB1*05:01、BTNL2基因型與尋常型銀屑病臨床表型的關(guān)聯(lián)性。研究目的對(duì)尋常型銀屑病進(jìn)行臨床表型分型,按照發(fā)病年齡(早發(fā)和晚發(fā))、性別(男性和女性)、發(fā)病類型(點(diǎn)滴型和斑塊型)、家族史(陽性和陰性)及地域(南方和北方)分為不同的臨床表型,探討HLA-DPB1*05:01、BTNL2基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人尋常型銀屑病臨床表型之間的關(guān)系。實(shí)驗(yàn)方法 本實(shí)驗(yàn)中的9906例健康對(duì)照者和9946例PV患者均來自前期全基因組外顯子測(cè)序所使用的樣本。本實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)前期對(duì)MHC區(qū)域的深度測(cè)序得出HLA-DPB*05:01、BTNL2基因與尋常型銀屑病有關(guān),本實(shí)驗(yàn)根據(jù)性別、發(fā)病年齡、地域、家族史和皮損類型進(jìn)行臨床表型分層分析,通過PLINK 1.07和SPSS 20.0軟件分析比較對(duì)照組和病例組間等位基因和基因型分布頻率,得出P值、比值比(OR值)、95%置信區(qū)間(95%CI),分析HLA-BPB1*05:01、BTNL2病例組間與病例組和對(duì)照組間的等位基因的關(guān)聯(lián)性時(shí),以α=0.05為標(biāo)準(zhǔn)來判斷統(tǒng)計(jì)結(jié)果是否有意義。結(jié)果 1 HLA-DPB1*05:01基因中基因分布頻率在尋常型銀屑病病例組中低于正常對(duì)照組的分布頻率(35.9%VS 36.4%,p=1.72×10~(-1),OR=0.978,95%CI:0.947-1.01)。HLA-DPB1*05:01基因型與PV臨床表型相關(guān)性分析表明,在PV病例組與對(duì)照組對(duì)比中,HLA-DPB1*05:01基因型表達(dá)與發(fā)病類型中的點(diǎn)滴型(p=3.914×10~(-2),OR=0.9335,95%CI:0.8744-0.9966)及北方地域(p=1.182×10~(-3),OR=0.9108,95%CI:0.8607-0.9637)間存在相關(guān)性;而在病例組間比較中,則僅與地域差異(p=1.36×10~(-4),OR=1.134,95%CI:1.063-1.209)存在明顯相關(guān)性;未發(fā)現(xiàn)與其他臨床表型有相關(guān)性。2 BTNL2基因中T等位基因分布頻率在尋常型銀屑病病例組中低于正常對(duì)照組的分布頻率(5.8%VS 6.3%,p=4.72×10~(-3),OR=0.911,95%CI:0.854-0.972)。BTNL2基因型與PV臨床表型相關(guān)性分析顯示,BTNL2基因的表達(dá),在PV病例組與對(duì)照組分析中,發(fā)現(xiàn)與男性(p=2.563×10~(-2),OR=0.8897,95%CI:0.8029-0.9859),早發(fā)型(p=9.399×10~(-3),OR=0.8856,95%CI:0.808-0.9707),點(diǎn)滴型(p=2.469×10~(-2),OR=0.8558,95%CI:0.7469-0.9805),及陽性家族史(p=1.51×10~(-4),OR=0.772,95%CI:0.6069-0.8551)存在相關(guān)性;并在病例組間,與家族史(p=1.768×10~(-3),OR=0.757,95%CI:0.6355-0.9018),發(fā)病年齡(p=3.818×10~(-2),OR=1.195,95%CI:1.01-1.414)存在明顯關(guān)聯(lián)性,未發(fā)現(xiàn)與其他臨床表型有相關(guān)性。結(jié)論 HLA-DPB*05:01基因與地域差異(p=1.36×10~(-4),OR=1.134,95%CI:1.063-1.209)存在顯著相關(guān)性;BTNL2基因與家族史(p=1.768×10~(-3),OR=0.757,95%CI:0.6355-0.9018)及發(fā)病年齡(p=3.818×10~(-2),OR=1.195,95%CI:1.01-1.414)存在顯著關(guān)聯(lián)性。
[Abstract]:Backgroundpsoriasis is a multi gene and multi factor complex and chronic diseases, the exact pathogenesis of psoriasis is not clear at present, mainly by genetic factors, immune factors, caused by the interaction of skin barrier function and environmental factors. In clinical psoriasis vulgaris (psoriasis vulgaris PV) is the most common. The world population is about 1-3% by the influence of psoriasis. The Chinese psoriatic the population prevalence rate is about the latest research by deep sequencing of 0.123%. of the Han population in 9906 healthy controls and 8874 patients with psoriasis HLA region, found HLA-DPB1*05:01, BTNL2 genes for psoriasis susceptibility genes. The new experimental basis further, through the clinical of 9906 healthy controls and 8874 patients with psoriasis vulgaris were divided into type (gender, family history, age of onset, disease type, region) layers Analysis of HLA-DPB1*05:01, correlation of BTNL2 genotype and clinical phenotypes of psoriasis vulgaris. The purpose of clinical phenotype of psoriasis vulgaris, according to age (early and late), gender (male and female), disease type (guttate and plaque type), family history (positive and negative) and the region (North and South) is divided into different clinical phenotype of HLA-DPB1*05:01, the relationship between the clinical phenotype of BTNL2 gene polymorphism and China psoriasis vulgaris in Chinese Han population. The experimental methods in this experiment, 9906 healthy controls and 9946 PV patients from the whole exome sequencing using the sample. The experiment team early deep sequencing of the MHC region that HLA-DPB*05:01, BTNL2 genes and psoriasis vulgaris, according to gender, age, region, family history and skin damage type phenotype points Layer analysis, comparing the frequency distribution of alleles and genotypes between cases and controls group analysis by PLINK 1.07 and SPSS 20 software, the P value, the odds ratio (OR value), 95% confidence interval (95%CI), HLA-BPB1*05:01 analysis, BTNL2 correlation between the case group and between case group and control group. Gene, a =0.05 as the standard to judge the statistical result is meaningful. The gene distribution of HLA-DPB1*05:01 gene in 1 frequency lower than the frequency distribution of the normal control group in the cases of psoriasis vulgaris group (35.9%VS 36.4%, p=1.72 * 10~ (-1) OR=, 0.978,95%CI:0.947-1.01).HLA-DPB1*05:01 genotype and clinical phenotype of PV correlation analysis showed that in the case of PV group compared with the control group, the expression of guttate type HLA-DPB1*05:01 genotype and disease type in (p=3.914 * 10~ (-2), OR=0.9335,95%CI:0.8744-0.9966) and the northern region (p=1.182 * 10~ (-3), OR=0.9108,95%C I:0.8607-0.9637) the correlation between the comparison groups; while in, only with regional differences (p=1.36 * 10~ (-4), OR=1.134,95%CI:1.063-1.209) was significantly associated; did not find the frequency distribution of frequencies of T and.2 in BTNL2 gene gene correlation in cases of psoriasis vulgaris were lower than the normal control group and other clinical the phenotype (5.8%VS 6.3%, p=4.72 * 10~ (-3), OR=0.911,95%CI:0.854-0.972).BTNL2 genotype and clinical phenotype of PV correlation analysis showed that the gene expression of BTNL2, PV in case group and control group analysis, and the male (p=2.563 * 10~ (-2), OR=0.8897,95%CI:0.8029-0.9859), early onset (p=9.399 * 10~ (-3) OR=0.8856,95%CI:0.808-0.9707, (p=2.469), guttate * 10~ (-2), OR=0.8558,95%CI:0.7469-0.9805), and positive family history (p=1.51 * 10~ (-4), OR=0.772,95%CI:0.6069-0.8551) and the correlation exists between the case group, With family history (p=1.768 * 10~ (-3), OR=0.757,95%CI:0.6355-0.9018), age (p=3.818 * 10~ (-2), OR=1.195,95%CI:1.01-1.414) has obvious relevance, found no correlation with other clinical phenotype. Conclusion HLA-DPB*05:01 gene and regional differences (p=1.36 * 10~ (-4), OR=1.134,95%CI:1.063-1.209) there was significant correlation between the BTNL2 gene and the family; history (p=1.768 * 10~ (-3), OR=0.757,95%CI:0.6355-0.9018) and age (p=3.818 * 10~ (-2), OR=1.195,95%CI:1.01-1.414) there was significant correlation.
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R758.63
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,本文編號(hào):1751914
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