本文選題：T2DM　切入點(diǎn)：腸道菌群　出處：《中央民族大學(xué)》2017年碩士論文

【摘要】：Ⅱ型糖尿病(Type 2 Diabetes,T2DM)是嚴(yán)重影響人類健康的一種代謝性疾病,研究顯示作為人體"第二基因組"的腸道菌群與T2DM有非常重要的聯(lián)系。本研究探討T2DM患者和正常人群腸道菌群種類、豐度和結(jié)構(gòu)差異,在矯正腸道菌群相關(guān)影響因素后,分析腸道菌群變化與T2DM的相關(guān)性,并篩選與疾病獨(dú)立相關(guān)的生物標(biāo)志物。本研究根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)收集了 133例臨床糞便樣本(健康樣本78例,T2DM病例樣本55例),在對糞便樣本微生物基因組進(jìn)行提取和建庫的基礎(chǔ)上,以腸道微生物全基因組DNA為模板,擴(kuò)增16srRNA基因,應(yīng)用Hiseq2500對16s rRNA基因的V3+V4區(qū)進(jìn)行高通量測序,下機(jī)數(shù)據(jù)用Usearch、QIIME等生物信息分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)的拼接過濾,物種注釋和分類學(xué)分析。利用R語言數(shù)據(jù)包對分類單位(OTUs),物種多樣性,樣品α多樣性指數(shù),樣品β多樣性指數(shù)進(jìn)行分析,比較正常組與T2DM組的菌群差異,比較兩組間的豐度差異以及進(jìn)行矯正因素后biomarker的篩選。結(jié)果顯示133例樣品初始數(shù)據(jù)共包含25,375,243條PE-reads,過濾后得到17,371,759條reads,最少reads數(shù)60,381,最大reads數(shù)193,482。從門分類水平上Firmicutes、Bacteroidetes、proteoK_Bacteria、Actinok_Bacteria 是兩組樣本的主要核心物種;綱分類水平下:Bacteroidia、Clostridia、Gammaproteo、Negativicutes、Actino、Bacilli和Betaproteo是兩組樣本的主要物種;目分類水平下 Bacteroidales、Clostridiales、EnteroK_Bacteriales、Selenomonadales、Lactobacillales、BifidoK_Bacteriales 和 Burkholderiales 是兩組樣本的主要核心物種;科分類水平下:Bacteroidaceae、Lachnospiraceae、Ruminococcaceae、Prevotellaceae、EnteroK_Bacteriaceae、Veillonellaceae、Lactobacillaceae、BifidoK_Bacteriaceae、Porphyromonadaceae、EuK_Bacteriaceae和Rikenellaceae是兩組樣本的主要核心物種;屬分類水平下Lachnospiracea_incertae_sedis、Faecalibacterium、Escherichia/Shigella、Clostridium_X1Va、Ruminococcus、Gemmiger、Klebsiella、Megamonas、Blautia、Eubacterium、Clostridium_Ⅳ、Megasphaera、Roseburia、Dialister和Oscillibacter是兩組樣本的主要核心物種。在兩組比較中,屬水平上,正常組Bacteroides、Prevotella、Faecalibacterium、Lachnospiacea_incertae_sedis、Clostridium_X1Va高于 T2DM組,T2DM 組在 Escherichia/Shigella、Bifidobacterium、Ruminococcus、Gemmiger、Megasphaera、Lactobacillus 高于正常組。兩組 Alpha 多樣性指標(biāo)差異并不顯著,而Beta多樣性在組間具有顯著差異。在統(tǒng)計(jì)學(xué)篩查和biomarker的篩選中得到了兩組在2個門3個綱6個目7個科14個屬的相對豐度有顯著差異,本研究篩選出了鑒別兩組差異的生物標(biāo)志物,97%相似度OTU水平下,正常組的生物標(biāo)志物包括:Bifidobacterium、BifidoK_Bacteriales、BifidoK_Bacteriales、Laceyella、Thermoactinomycetaceae、Bacillales、Lactobacillales、Lactobacillales、Cupriavidus、Pelagicoccus、Puniceicoccales、Puniceicoccaceae;T2DM 組的生物標(biāo)志物包括:Bacteroidetes、Bacteroidaceae、Bacteroidales、Vagococcus、Clostridium_X1Va、Lachnospiracea_incertae_sedis、Rhizobiaceae、Roseburia、Rhizobium、Clostridium_ⅩⅧ 和 Megamonas。在此基礎(chǔ)上,為了排除年齡、性別、其他疾病等因素的干擾,我們對菌群有影響的各環(huán)境變量進(jìn)行了因素矯正,最終得到了與血糖獨(dú)立相關(guān)的11個 OTUs:OTU1001、OTU1104、OTU13、OTU140、OTU2488、OTU25、OTU381、OTU415、OTU4585、OTU541、OTU736 和 OTU9。根據(jù) OTU 注釋信息,我們發(fā)現(xiàn)T2DM患者的腸道菌群和正常人群的腸道菌群在組成成分和核心菌群上都有不同,T2DM組明顯的顯示出生態(tài)失調(diào)的特點(diǎn)。特別是雙歧桿菌(Bifidobacterium)在T2DM組中表達(dá)更高,與之前的研究結(jié)果有所不同。雙歧桿菌作為一種有益菌高表達(dá)的出現(xiàn)在T2DM組中,值得我們進(jìn)行進(jìn)一步的探究和分析。本研究更精確的證實(shí)了腸道菌群與T2DM的相關(guān)性,為人體腸道微生物群作為T2DM的新的診斷和治療工具的發(fā)展提供啟示和基礎(chǔ)。
[Abstract]:In this study , we collected 133 samples of intestinal flora ( 78 cases of healthy samples and 55 cases of T2DM ) by using Hiseq2500 . There were significant differences between the two groups in the two groups . In the two groups , there were significant differences between the two groups . On the basis of OTU annotation information , we found that the intestinal flora of patients with T2DM and intestinal flora of normal population were different from those in T2DM group .

【學(xué)位授予單位】：中央民族大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R587.1

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王三虎,高星;鉛的生物標(biāo)志物研究[J];中國職業(yè)醫(yī)學(xué);2002年01期

2 鄭玉新,莊志雄;基因組時代生物標(biāo)志物研究的機(jī)遇與挑戰(zhàn)[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2005年03期

3 黃忠;;生物標(biāo)志物的蛋白組學(xué)研究-高通量質(zhì)譜分析[J];瀘州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2011年05期

4 葉細(xì)標(biāo),倪為民,傅華;分子生物標(biāo)志物及其應(yīng)用[J];中國工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志;2002年01期

5 邵華;生物標(biāo)志物的研究進(jìn)展[J];職業(yè)與健康;2002年09期

6 胡訓(xùn)軍;肖萍;王文靜;陳良;盧偉;;三氯乙烯生物標(biāo)志物的研究進(jìn)展[J];環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué);2006年01期

7 肖忠海;王林;;癌癥生物標(biāo)志物[J];國外醫(yī)學(xué).藥學(xué)分冊;2006年06期

8 賈光;沈惠麒;;以生物標(biāo)志物研究為切入點(diǎn)推動生物監(jiān)測的發(fā)展[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2006年06期

9 ;《生物監(jiān)測與生物標(biāo)志物理論基礎(chǔ)及應(yīng)用》新書預(yù)告[J];中華勞動衛(wèi)生職業(yè)病雜志;2006年12期

10 本刊編輯部;;全國生物監(jiān)測與生物標(biāo)志物理論基礎(chǔ)及應(yīng)用講習(xí)班招生通知[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2007年01期

相關(guān)會議論文 前10條

1 陳建平;鄧春萍;宋孚慶;張大江;;應(yīng)用生物標(biāo)志物定量計(jì)算混合原油油源的數(shù)學(xué)模型[A];第十屆全國有機(jī)地球化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編[C];2005年

2 王曉蓉;;分子生物標(biāo)志物在水環(huán)境有機(jī)污染的早期預(yù)警研究進(jìn)展[A];有機(jī)污染環(huán)境化學(xué)前沿與環(huán)境可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略論文集[C];2006年

3 申秀萍;賈長虹;;十二五“重大新藥創(chuàng)制”毒性生物標(biāo)志物與人源化動物模型關(guān)鍵技術(shù)課題簡介[A];2013年（第三屆）中國藥物毒理學(xué)年會暨藥物非臨床安全性評價研究論壇論文摘要[C];2013年

4 申秀萍;賈長虹;;十二五“重大新藥創(chuàng)制”毒性生物標(biāo)志物與人源化動物模型關(guān)鍵技術(shù)課題簡介[A];中國藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志(2013年6月第27卷第3期)[C];2013年

5 謝鑫友;;新技術(shù)在生物標(biāo)志物篩選中的應(yīng)用(英文)[A];2007年浙江省醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2007年

6 馬t，

本文編號：1674760