多重耐藥鮑曼不動桿菌碳青霉烯酶基因檢測和多位點序列分型
本文關鍵詞: 鮑曼不動桿菌 聚合酶鏈式反應 多位點序列分型 多重耐藥 耐藥機制 最小生成樹 出處:《安徽醫(yī)科大學》2017年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:目的鮑曼不動桿菌是一種革蘭陰性桿菌非發(fā)酵菌,屬于條件致病菌。其廣泛分布于醫(yī)院環(huán)境、水、土壤以及人體皮膚表面,為醫(yī)院感染的重要條件致病菌之一,極易引起敗血癥、心內(nèi)膜炎、繼發(fā)性腦膜炎、獲得性肺炎、創(chuàng)口感染和尿路感染等在內(nèi)的多種院內(nèi)感染。隨著臨床廣譜坑生素和免疫抑制劑的應用,大量出現(xiàn)了對碳青霉烯類、頭孢菌素類、β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類和氟喹諾酮類3種及以上抗生素同時耐藥的鮑曼不動桿菌,多重耐藥鮑曼不動桿菌在臨床上的分離率越來越高,在醫(yī)院內(nèi)廣泛流行,給臨床工作者預防感染及治療帶來巨大的挑戰(zhàn)。檢測多重耐藥鮑曼不動桿菌對臨床常見抗菌藥物的敏感性并測定其耐藥基因,分析菌株間親緣進化關系,對菌株進行同源性的研究顯得尤為重要。其能夠為臨床醫(yī)生合理使用抗生素,為預防和控制多重耐藥鮑曼不動桿菌引起的院內(nèi)感染和暴發(fā)流行提供一定的理論依據(jù),給多重耐藥鮑曼不動桿菌的分子流行病學調(diào)查和研究奠定實驗室基礎。方法收集本實驗室2015年從安徽地區(qū)34家醫(yī)院臨床分離而來的多重耐藥鮑曼不動桿菌87株。首先采用瓊脂二倍稀釋法測定其對臨床11種常用抗生素的敏感性,用PCR方法檢測多重耐藥鮑曼不動桿菌攜帶的碳青霉稀類主要的相關耐藥基因,OXA-23、OXA-51、OXA-24、OXA-58型等;然后應用多位點序列分型(MLST)方法分析87株臨床分離的多重耐藥鮑曼不動桿菌同源性,獲得每個菌株的等位基因譜(allelic profile)和其所對應的序列型(sequence type,ST)。在菌株等位基因譜和ST型已知的基礎上使用Bionumerics軟件構(gòu)建最小生成樹圖和聚類圖,e BURST軟件分析確定其所屬于的克隆復合體(clone complex)。結(jié)果87株多重耐藥鮑曼不動桿菌美羅培南、亞胺培南的耐藥率分別為66.7%,74.7%。68株菌對慶大霉素耐藥,62株對哌拉西林/他唑巴坦耐藥,47株對左氧氟沙星耐藥,60株對頭孢曲松耐藥,對其他抗菌藥物均顯示出較高的耐藥率。PCR實驗中87株多重耐藥鮑曼不動桿菌oxa-51基因攜帶率為100%,攜帶oxa-23基因的鮑曼不動桿菌有82株,占94.3%,沒有發(fā)現(xiàn)攜帶oxa-58、oxa-24基因的多重耐藥鮑曼不動桿菌。MLST實驗中87株鮑曼不動桿菌分為42個ST型,其中6個型別是數(shù)據(jù)庫里原來有的,36個型別為新的型別(暫時命名為STnew01-STnew36)。本地區(qū)2015年87株多重耐藥鮑曼不動桿菌主要的流行克隆株等位基因譜為ST2(2-2-2-2-2-2-2),包含37株菌,占42.5%,是優(yōu)勢型別,與世界上很多國家的多重耐藥鮑曼不動桿菌主要流行克隆株ST型具有高度的同源性;其余41個型別分別包含1-4株菌。其中35個型別只包含1株菌,即有35株菌具有獨特的ST型。應用e BURST軟件分析巴斯德研究所網(wǎng)站上所有鮑曼不動桿菌等位基因譜,確定本實驗中ST2型鮑曼不動桿菌屬于克隆復合體CC1。ST型為STnew05、STnew01、STnew29、STnew06、STnew04、STnew28、STnew21、ST724、ST570與ST2型鮑曼不動桿菌只具有一個等位基因上的差別,因此也都屬于克隆群CC1。而本實驗中出現(xiàn)的一株ST105型的鮑曼不動桿菌屬于CC4,ST63屬于CC6,ST235則屬于獨立的ST型。36株新的ST型菌株等位基因譜分別是STnew01(2-2-2-2-2-2-49)、STnew 02(1 3-4-40-1-42-1-1)、STnew03(1-3-2-1-3-1-4 6)、STnew04(2-2-2-2-2-2-44)、STnew05(2-2-2-2-2-2-20)、STnew06(2-2-2-2-2-2-2-97)、STnew 0 7(1 3-4-4 0-1-4 2-1-9 8)、STnew08(1 3-4-40-1-42-1-2)、STnew09(3-2-5-1-3-1-2)、STnew10(2-2-2-2-3-1-2)、STnew11(13-4-2-3-6-1-2)、STnew12(8-5-5-1-7-1-2)、STnew13(3-4-4-2-9-1-2)、STnew14(3-1-2-1-18-1-2)、STnew15(3-1-7-1-7-2-2)、STnew16(17-20-23-10-20-13-2)、STnew17(20-26-26-14-26-16-2)、STnew18(23-20-28-10-25-18-2)、STnew19(45-20-44-67-25-29-2)、STnew 20(2 7-2-110-57-1 21-5 6-2)、STnew 21(2-2-2-2-2-2-3)、STnew 2 2(1-3-4 0-2-7-1-4)、STnew 2 3(3-1-2-2-3-2-4)、STnew 2 4(3-5-5-1-7-1-2 6)、STnew 2 5(1-4-2-2-7-1-29)、STnew26(22-26-90-14-23-16-48)、STnew27(3-3-3-4-7-4-49)、STnew28(2-2-2-2-2-2-51)、STnew29(2-2-2-2-2-2-63)、STnew30(97-2-13-2-3-2-2)、STnew31(9 7-2-1 3-2-3-2-2)、STnew32(3-2-2-2-2-2-5)、STnew33(1-4-2-2-7-1-2)、S Tnew34(2 2-26-90-14-2 3-1 6-2)、STnew35(3-2-2-2-3-4-2)、S T n e w 3 6 ( 3 - 3 - 2 - 5 - 7 - 2 - 4 4 ) 。結(jié)論多重耐藥鮑曼不動桿菌對11種常見臨床抗菌藥物均呈現(xiàn)出較高的耐藥率,87株多重耐藥鮑曼不動桿菌均攜帶OXA-51基因,OXA-23基因的攜帶率為94.3%,未檢測出攜帶oxa-51、oxa-24基因的多重耐藥鮑曼不動桿菌。ST2型別為安徽地區(qū)多重耐藥鮑曼不動桿菌主要的流行克隆株,安徽地區(qū)主要的流行株ST2與世界上主要的流行克隆具有高度的同源性其均屬于克隆復合體CC1。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:安徽醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R440;R516
【參考文獻】
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,本文編號:1550766
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