本文關(guān)鍵詞： 宮頸癌 放療 放化療 蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò) 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)　出處：《浙江大學》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：宮頸癌是排在乳腺癌后的婦女第二大生殖系統(tǒng)惡性腫瘤,在導致女性的死亡因素中位列第四[1,2]。在2012年,大約有52萬8千婦女患宮頸癌,26萬6千人死于該病[2]。其中80%左右的宮頸癌患者都在發(fā)展中國家[3]。放療和放化療是宮頸癌患者重要的治療手段[4,5]。在過去的十年,放療和放化療在宮頸癌上的治療正逐漸引起大家的研究興趣[6,7]。放療相比于手術(shù)而言帶來了相似的生存結(jié)果,但是也不可避免地帶來一些副作用,比如性功能的紊亂等[8]。順鉑聯(lián)合同步放療是目前局部晚期宮頸癌的標準治療模式[9]。據(jù)文獻報道順鉑同步放化療療效優(yōu)于單純放療[10]。同步放化療相比單純放療的優(yōu)勢在一些隨機臨床試驗中已經(jīng)獲得證實[11],例如,絕對的改善了患者的總生存率和顯著減少了局部復發(fā)率[12,13]。無論如何,很少有研究來觀察這些治療的基因反應性。在這個研究中,我們調(diào)查研究經(jīng)過放療和放化療的官頸癌患者的基因芯片表達譜數(shù)據(jù)來分析放化療背后潛在的分子機制。篩選出放化和放化療之間的差異表達基因,預測差異表達基因可能具有的功能。我們通過構(gòu)建蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI),構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子-差異表達基因(TF-DEG)可視化調(diào)控網(wǎng)絡(luò)以及構(gòu)建miRNA-差異表達基因(miRNA-DEG)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)挖掘在放化療治療中的宮頸癌樣本中的關(guān)鍵基因。目的:宮頸癌在婦女中有著較高的發(fā)病率和死亡率,放療和放化療是其治療的重要手段。這個研究目的是挖掘接受放療和放化療的宮頸癌樣本中的差異表達基因。方法:先由基因表達綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)中下載GSE3578基因芯片數(shù)據(jù),其包含了 20例單純放療患者以及19例同步放化療治療患者的官頸癌標本。用R語言的siggenes包篩選差異表達基因(DEGs)。由Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)可視圖。利用Cytoscape及MCODE插件挖掘和構(gòu)建子網(wǎng)絡(luò)模塊,對子網(wǎng)絡(luò)模塊的功能進行分析。使用Cytoscape軟件做圖,分別得到上調(diào)、下調(diào)差異表達基因的轉(zhuǎn)錄因子-差異表達基因以及miRNA-差異表達基因可視化的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并分析預測其潛在可能的分子機制。結(jié)果:總共從同步放化療組患者的宮頸癌樣本中篩選出22個上調(diào)表達基因和181個下調(diào)表達基因。對這些上調(diào)和下調(diào)的差異表達基因進行基因本體功能分析以及通路富集分析。一個涉及ZNF449和ZNF673基因的模塊從下調(diào)基因的蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中挖掘出來。在TF-DEG調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中,GATA3(由SP1基因調(diào)控)既是轉(zhuǎn)錄因子,同時也發(fā)生了顯著下調(diào)表達,而我們發(fā)現(xiàn)上調(diào)的CDK6基因則受多個轉(zhuǎn)錄因子(例如 GATA3)調(diào)控。在miRNA-DEG調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中,Hsa-miR-17,hsa-miR-34a,hsa-miR-124,has-miR-1185-2-3p,hsa-1185-1-3p,and hsa-1et-7f-2-3p被證實為關(guān)鍵miRNA。結(jié)論:同步放化療相比單純放療治療宮頸癌更敏感可能通過這些分子機制。
[Abstract]:Cervical cancer is the second largest reproductive system malignancy in women after breast cancer . In 2012 , there were approximately 52.8 million women with cervical cancer and 26 , 000 people died of the disease . Among them , about 80 % of cervical cancer patients are in developing countries . Radiotherapy and radiotherapy are important treatments for cervical cancer . In the past decade , the treatment of radiotherapy and radiotherapy for cervical cancer has gradually attracted a lot of research interests . Compared with surgery , radiotherapy has brought similar survival results , but also inevitably brings some side effects , such as disturbance of sexual function , etc . Cisplatin combined with simultaneous radiotherapy is the standard treatment model for advanced cervical cancer . It is reported that the effect of cisplatin synchronous radiotherapy is superior to that of radiotherapy alone . In this study , we investigated the potential molecular mechanism of radiotherapy and chemotherapy in cervical cancer samples .

【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R737.33

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本文編號：1540383