青藏高原棘球?qū)俳{蟲基因多態(tài)性研究
發(fā)布時間:2017-12-19 13:14
本文關(guān)鍵詞:青藏高原棘球?qū)俳{蟲基因多態(tài)性研究 出處:《青海大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
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【摘要】:【目的】本研究擬以青藏高原棘球蚴病和棘球?qū)俳{蟲為研究對象,運用線粒體細胞色素C氧化酶亞單位Ⅰ基因(COX1)和煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(脫氫酶亞單位Ⅰ基因(NAD1))對收集的青藏高原包蟲病患者感染的棘球?qū)俳{蟲進行基因多態(tài)性研究,明確檢測到棘球?qū)俳{蟲的基因型及其株內(nèi)遺傳變異,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,掌握青藏高原流行的棘球?qū)俳{蟲種類數(shù)目及基因序列多態(tài)性,指導(dǎo)臨床診斷和治療,為棘球蚴病的預(yù)防控制提供理論上的指導(dǎo)!痉椒ā繉κ占172例棘球蚴病患者的包囊,分離純化包囊,提取DNA,選擇線粒體DNA的COX1基因、NAD1基因,設(shè)計特異性引物,PCR擴增,PCR產(chǎn)物測序,通過生物信息學(xué)軟件,分析青藏高原棘球?qū)俳{蟲的流行株基因型及基因的多態(tài)性,利用各個基因構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,研究棘球?qū)俳{蟲的基因序列多樣性和遺傳進化特征!窘Y(jié)果】本論文得到的研究結(jié)果如下:通過分子生物學(xué)方法鑒定所分離出的包囊,均為G1型,表明青藏高原棘球?qū)俳{蟲流行株為細粒棘球絳蟲(G1型)。所測定的G1型棘球蚴絳蟲COX1基因序列和NAD1基因序列長度分別為1674bp和894bp。通過對分離株標(biāo)本提取DNA并擴增NAD1和COX1基因序列分析,發(fā)現(xiàn)青藏高原主要棘球?qū)俳{蟲的優(yōu)勢株為G1型,NAD1基因存在14個各不同的序列,20個突變位點,占分析位點數(shù)的2.2%,COX1基因存在18個各不同的序列,45個突變位點,占分析位點數(shù)的2.8%。堿基的變化為轉(zhuǎn)換和顛換,且轉(zhuǎn)換明顯多于顛換。在對172例分離株成功擴增的基因序列分析中發(fā)現(xiàn)基因序列沒有明顯差異。通過對擴增出的136條基因序列進行同源性分析,均與Genbank中檢索到的普通羊株(AF297617)NAD1基因序列同源性達98.88%以上,COX1基因序列同源性達99.82%以上。對青藏高原各個G1型棘球?qū)俳{蟲分離株NAD1和COX1基因單倍型分析,核苷酸序列差異較小。136株G1型細粒棘球蚴共有14個不同的基因型單倍型。NAD1基因的核苷酸序列在117位點發(fā)生了T與C置換,COX1基因的核苷酸序列在426、429、456位點發(fā)生了T與C置換,是流行于青藏高原最主要的G1型細粒棘球絳蟲單倍體!窘Y(jié)論】青藏高原主要棘球?qū)俳{蟲的優(yōu)勢株為細粒棘球絳蟲G1型,且COX1基因相對于NAD1基因有較為豐富的單倍型多態(tài)性。COX1基因和NAD1基因證實青藏高原G1型棘球?qū)俳{蟲核苷酸序列相互間差異較小。上述研究結(jié)果為進一步開展棘球?qū)俳{蟲分子流行病學(xué)調(diào)查積累了數(shù)據(jù),也為青藏高原包蟲病的防治提供了參考。
【學(xué)位授予單位】:青海大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R532.32
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 李維新,張國才,黃光財,王進香,李仲珊,李明;寧夏棘球?qū)俳{蟲感染的調(diào)查研究[J];地方病通報;1986年02期
2 曹巖,楊軍;DNA技術(shù)在棘球?qū)俳{蟲分類學(xué)上的意義[J];地方病通報;1995年04期
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 李國棟;青藏高原棘球?qū)俳{蟲基因多態(tài)性研究[D];青海大學(xué);2017年
,本文編號:1308090
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