OGT1催化的NSL3 Thr755位點(diǎn)的O-GlcNAc糖基化修飾對組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物MOF/NSL全酶活性的調(diào)
發(fā)布時(shí)間:2022-02-12 22:00
基于經(jīng)典遺傳學(xué)的概念而來,表觀遺傳學(xué)的含義隨著研究者們對真核生物基因表達(dá)調(diào)控分子機(jī)制研究的深入不斷地更新,目前的通行定義即研究在有絲分裂和減數(shù)分裂的過程中,非基因組DNA序列突變引起的生物體基因功能及表型上的可繼承性的改變。表觀遺傳學(xué)調(diào)控的方式主要有染色質(zhì)重塑,DNA甲基化,組蛋白修飾以及非編碼RNA的作用。本文主要討論組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶MOF/NSL復(fù)合物全酶活性受到其中亞基NSL3 Thr755位點(diǎn)的O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控的分子機(jī)制。MOF(males absent on the first)/NSL組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶復(fù)合物具有十分廣泛的底物特異性,除了可以將組蛋白H4的K16位點(diǎn)乙酰化,還可以在體外重組染色質(zhì)中乙;M蛋白H4的K5及K8位點(diǎn),且非組蛋白p53也是它的底物之一。MOF/NSL復(fù)合物由9個(gè)亞基組成,其中包括O-連接的β-N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)轉(zhuǎn)移酶(同種型1)(OGT1)和NSL3。OGT是自然界中唯一存在的O-GlcNAc糖基轉(zhuǎn)移酶,催化對底物分子的絲氨酸或蘇氨酸殘基進(jìn)行O-GlcNAc糖基化修飾的反應(yīng)。OGT和催化從底物分子的絲氨酸或蘇氨...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 表觀遺傳學(xué)概述
1.2 表觀遺傳學(xué)的分子調(diào)控機(jī)制
1.2.1 DNA的甲基化修飾
1.2.2 組蛋白修飾
1.2.3 染色質(zhì)重塑
1.2.4 非編碼RNA的調(diào)控
1.3 組蛋白乙酰化與MOF/NSL復(fù)合物
1.4 OGT與 O-GlcNAc糖基化修飾
1.4.1 OGT的結(jié)構(gòu)與細(xì)胞內(nèi)存在形式
1.4.2 OGT與 OGA
1.4.3 OGT對非組蛋白底物的修飾與生物學(xué)功能
1.4.4 OGT對組蛋白底物的修飾與生物學(xué)功能
1.4.5 OGT與疾病的關(guān)系
1.5 泛素化修飾與蛋白酶體水解
1.6 NSL3 研究進(jìn)展
1.7 研究背景與立題依據(jù)
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)抗體
2.1.4 質(zhì)粒
2.1.5 細(xì)胞株
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.2 瞬時(shí)轉(zhuǎn)染
2.2.3 構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞株
2.2.4 siRNA基因敲低
2.2.5 昆蟲細(xì)胞蛋白表達(dá)純化
2.2.6 in vitro O-GlcNAc糖基化實(shí)驗(yàn)
2.2.7 細(xì)胞總RNA提取
2.2.8 反轉(zhuǎn)錄(CDNA合成)
2.2.9 PCR擴(kuò)增目的片段
2.2.10 免疫共沉淀
2.2.11 免疫印跡(western blot)
2.2.12 平板克隆形成
2.2.13 免疫熒光染色
2.2.14 蛋白質(zhì)譜
2.2.15 數(shù)據(jù)處理分析
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 OGT1 通過對NSL3 進(jìn)行O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控其泛素化降解
3.1.1 引言
3.1.2 OGT1 影響NSL3 的泛素化修飾水平
3.1.3 NSL3 發(fā)生O-GlcNAc糖基化修飾的部位在C端
3.2 泛素結(jié)合酶UBE2S直接與NSL3 發(fā)生相互作用
3.2.1 引言
3.2.2 泛素結(jié)合酶UBE2S與 NSL3 相互結(jié)合,而非UBE2N
3.2.3 泛素結(jié)合酶UBE2S廣泛地結(jié)合于NSL3上
3.3 OGT1對NSL3的O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.3.1 引言
3.3.2 OGT1 通過抑制UBE2S與 NSL3 相互作用調(diào)控UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.3.3 OGA增強(qiáng)UBE2S與 NSL3 的結(jié)合促進(jìn)UBE2S介導(dǎo)的NSL#3泛素化降解
3.3.4 OGA抑制劑TMG抑制UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.4 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響NSL3 泛素化降解
3.4.1 引言
3.4.2 NSL3 上的O-GlcNAc糖基化修飾主要位點(diǎn)為Thr
3.4.3 NSL3 Thr755 位點(diǎn)的糖基化修飾影響其泛素化降解
3.5 NSL3 Thr755位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性與穩(wěn)定性
3.5.1 引言
3.5.2 NSL3上Thr755位點(diǎn)的O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性
3.5.3 NSL3 Thr755位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性與穩(wěn)定性
3.6 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)糖基化修飾調(diào)控A549 細(xì)胞的增殖能力
3.6.1 引言
3.6.2 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控A549 細(xì)胞的增殖
第四章 總結(jié)討論與展望
4.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果總結(jié)討論
4.2 后期展望
參考文獻(xiàn)
作者簡介及博士期間獲得的科研成果
致謝
本文編號:3622458
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
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摘要
abstract
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 表觀遺傳學(xué)概述
1.2 表觀遺傳學(xué)的分子調(diào)控機(jī)制
1.2.1 DNA的甲基化修飾
1.2.2 組蛋白修飾
1.2.3 染色質(zhì)重塑
1.2.4 非編碼RNA的調(diào)控
1.3 組蛋白乙酰化與MOF/NSL復(fù)合物
1.4 OGT與 O-GlcNAc糖基化修飾
1.4.1 OGT的結(jié)構(gòu)與細(xì)胞內(nèi)存在形式
1.4.2 OGT與 OGA
1.4.3 OGT對非組蛋白底物的修飾與生物學(xué)功能
1.4.4 OGT對組蛋白底物的修飾與生物學(xué)功能
1.4.5 OGT與疾病的關(guān)系
1.5 泛素化修飾與蛋白酶體水解
1.6 NSL3 研究進(jìn)展
1.7 研究背景與立題依據(jù)
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)抗體
2.1.4 質(zhì)粒
2.1.5 細(xì)胞株
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.2 瞬時(shí)轉(zhuǎn)染
2.2.3 構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞株
2.2.4 siRNA基因敲低
2.2.5 昆蟲細(xì)胞蛋白表達(dá)純化
2.2.6 in vitro O-GlcNAc糖基化實(shí)驗(yàn)
2.2.7 細(xì)胞總RNA提取
2.2.8 反轉(zhuǎn)錄(CDNA合成)
2.2.9 PCR擴(kuò)增目的片段
2.2.10 免疫共沉淀
2.2.11 免疫印跡(western blot)
2.2.12 平板克隆形成
2.2.13 免疫熒光染色
2.2.14 蛋白質(zhì)譜
2.2.15 數(shù)據(jù)處理分析
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 OGT1 通過對NSL3 進(jìn)行O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控其泛素化降解
3.1.1 引言
3.1.2 OGT1 影響NSL3 的泛素化修飾水平
3.1.3 NSL3 發(fā)生O-GlcNAc糖基化修飾的部位在C端
3.2 泛素結(jié)合酶UBE2S直接與NSL3 發(fā)生相互作用
3.2.1 引言
3.2.2 泛素結(jié)合酶UBE2S與 NSL3 相互結(jié)合,而非UBE2N
3.2.3 泛素結(jié)合酶UBE2S廣泛地結(jié)合于NSL3上
3.3 OGT1對NSL3的O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.3.1 引言
3.3.2 OGT1 通過抑制UBE2S與 NSL3 相互作用調(diào)控UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.3.3 OGA增強(qiáng)UBE2S與 NSL3 的結(jié)合促進(jìn)UBE2S介導(dǎo)的NSL#3泛素化降解
3.3.4 OGA抑制劑TMG抑制UBE2S介導(dǎo)的NSL3 泛素化降解
3.4 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響NSL3 泛素化降解
3.4.1 引言
3.4.2 NSL3 上的O-GlcNAc糖基化修飾主要位點(diǎn)為Thr
3.4.3 NSL3 Thr755 位點(diǎn)的糖基化修飾影響其泛素化降解
3.5 NSL3 Thr755位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性與穩(wěn)定性
3.5.1 引言
3.5.2 NSL3上Thr755位點(diǎn)的O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性
3.5.3 NSL3 Thr755位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾影響MOF/NSL復(fù)合物的全酶活性與穩(wěn)定性
3.6 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)糖基化修飾調(diào)控A549 細(xì)胞的增殖能力
3.6.1 引言
3.6.2 OGT1 介導(dǎo)的NSL3 Thr755 位點(diǎn)O-GlcNAc糖基化修飾調(diào)控A549 細(xì)胞的增殖
第四章 總結(jié)討論與展望
4.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果總結(jié)討論
4.2 后期展望
參考文獻(xiàn)
作者簡介及博士期間獲得的科研成果
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