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定量PCR方法與流式成像技術(shù)在亞歷山大藻藻華研究中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2016-11-10 10:43

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《中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所)》 2015年

定量PCR方法與流式成像技術(shù)在亞歷山大藻藻華研究中的應(yīng)用

高巖  

【摘要】:有害藻華(harmful algal bloom,HAB)是近海常見的一類海洋生態(tài)災(zāi)害現(xiàn)象。部分有害藻華原因種能夠產(chǎn)生藻毒素,其中,麻痹性貝類毒素(paralytic shellfish toxins,PST)在全球分布最廣、危害也最為嚴(yán)重。甲藻中的有毒亞歷山大藻是海洋中麻痹性貝類毒素的重要來源,在亞歷山大藻研究中,如何針對(duì)有毒藻種開展特異性檢測,獲取長期、連續(xù)的觀測資料,對(duì)于剖析亞歷山大藻藻華成因、防控藻華危害效應(yīng)至關(guān)重要。塔瑪亞歷山大藻復(fù)合種(Alexandrium tamarense species complex)是一類重要的有害藻華原因種,在我國近海多次形成藻華。本研究針對(duì)我國近海的有毒塔瑪亞歷山大藻復(fù)合種,首次將針對(duì)特定產(chǎn)毒藻種和麻痹性貝類毒素產(chǎn)毒基因qPCR檢測方法應(yīng)用于近海亞歷山大藻藻華研究;并在留學(xué)基金委支持下,在美國開展了應(yīng)用Imaging FlowCytobot(IFCB)進(jìn)行亞歷山大藻藻華原位觀測的研究,取得了以下認(rèn)識(shí):(1)針對(duì)中國近海塔瑪亞歷山大藻復(fù)合種的兩種有毒藻種--A.fundyense(I核糖體型)和A.pacificum(IV核糖體型),分別建立了基于TaqMan探針的qPCR檢測方法,并對(duì)該方法進(jìn)行了特異性、靈敏度和準(zhǔn)確性驗(yàn)證。將qPCR方法與傳統(tǒng)的顯微鏡檢測方法及麻痹性貝類毒素高效液相色譜分析技術(shù)相結(jié)合,在亞歷山大藻藻華多發(fā)的長江口鄰近海域及黃渤海海域開展了調(diào)查和研究。根據(jù)2011年春季和2012年春季在長江口鄰近海域及黃渤海的調(diào)查結(jié)果,發(fā)現(xiàn)A.pacificum主要分布在長江口鄰近海域,是該海域亞歷山大藻中的優(yōu)勢藻種和麻痹性貝類毒素的主要來源,另外在渤海秦皇島附近海域也有少量該藻種存在;而A.fundyense是黃海海域亞歷山大藻的優(yōu)勢種,主要分布在34oN以北海域。該研究首次闡明了兩種有毒亞歷山大藻(A.fundyense和A.pacificum)在我國近海不同的分布特征,也顯示了qPCR檢測方法良好的特異性、靈敏度及其在亞歷山大藻生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用潛力。(2)將一種針對(duì)產(chǎn)毒基因sxt A4的qPCR檢測方法應(yīng)用于黃海和長江口鄰近海域的麻痹性貝類毒素產(chǎn)毒藻檢測,并與該海域有毒藻種檢測結(jié)果和麻痹性貝類毒素分析結(jié)果進(jìn)行了對(duì)比。發(fā)現(xiàn)基于sxt A產(chǎn)毒基因的qPCR方法檢測結(jié)果與有毒塔瑪亞歷山大藻復(fù)合種(A.fundyense和A.pacificum)的豐度顯著相關(guān)(r2值為0.73,P0.05),表明有毒塔瑪亞歷山大藻復(fù)合種是調(diào)查期間該海域主要的產(chǎn)毒藻種。調(diào)查海域麻痹性貝類毒素的分布狀況與兩種qPCR方法得到的有毒藻分布狀況基本一致,但藻毒素水平與有毒藻豐度之間缺乏良好的相關(guān)性。該研究首次將基于產(chǎn)毒基因的檢測方法應(yīng)用于我國近海麻痹性貝類毒素有毒藻種檢測,結(jié)果表明該方法適合于我國近海麻痹性貝類毒素產(chǎn)毒藻的監(jiān)測,具有良好的應(yīng)用前景,該方法與毒素化學(xué)分析手段相結(jié)合,將更有利于對(duì)有毒藻種的早期監(jiān)測和預(yù)警。(3)應(yīng)用IFCB,開展了美國Cape Cod地區(qū)Salt Pond中有毒亞歷山大藻A.fundyense藻華動(dòng)態(tài)的研究,并對(duì)比分析了64子集和80子集分類系統(tǒng)對(duì)藻華種類的識(shí)別情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn),64子集分類系統(tǒng)對(duì)A.fundyense的自動(dòng)檢測結(jié)果好于80子集分類系統(tǒng),與手動(dòng)校正結(jié)果比較,r2值可達(dá)0.958。根據(jù)IFCB檢測結(jié)果,獲得了A.fundyense藻華全程觀測數(shù)據(jù),揭示了藻華末期A.fundyense的有性生殖過程及寄生甲藻對(duì)藻華消亡的影響。此外,還發(fā)現(xiàn)了由異帽藻(Heterocapsa triquetra)形成的藻華,最高豐度可達(dá)107 cells L-1。上述結(jié)果表明,IFCB是一種具有良好應(yīng)用潛力的藻華原位觀測技術(shù),其應(yīng)用有助于認(rèn)識(shí)藻華動(dòng)態(tài)過程、探索藻華生消機(jī)制。總之,本研究將針對(duì)特定有毒藻種和產(chǎn)毒基因的qPCR方法應(yīng)用于渤、黃、東海的有毒塔瑪亞歷山大藻研究,首次闡明了兩種麻痹性貝類毒素產(chǎn)毒藻在該海域的分布格局,揭示了該海域麻痹性貝類毒素的主要來源,也證明了分子生物學(xué)方法在有害藻華生態(tài)學(xué)研究中的意義和價(jià)值。此外,應(yīng)用全自動(dòng)原位觀測設(shè)備IFCB開展了亞歷山大藻藻華動(dòng)態(tài)的探索性研究,揭示了A.fundyense有性生殖過程及寄生甲藻對(duì)藻華消亡的影響。研究結(jié)果深化了對(duì)我國近海有毒亞歷山大藻藻華的認(rèn)識(shí),也為開展亞歷山大藻藻華的監(jiān)測和研究提供了重要的方法學(xué)依據(jù)。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:Q949.2;X55
【目錄】:

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3 高巖;定量PCR方法與流式成像技術(shù)在亞歷山大藻藻華研究中的應(yīng)用[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2015年

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中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 樊立靜;亞歷山大藻生長和產(chǎn)毒相關(guān)基因的基礎(chǔ)研究[D];中國海洋大學(xué);2006年

2 李天深;氮、磷營養(yǎng)鹽對(duì)鏈狀亞歷山大藻(東海株)生長和產(chǎn)毒的影響研究[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2007年

3 梁姍;兩株海洋亞歷山大藻的分子鑒定以及Alexandrium catenella中細(xì)胞核增殖抗原基因的克隆和分析[D];中國海洋大學(xué);2007年

4 王春燕;鏈狀亞歷山大藻環(huán)境條件響應(yīng)基因的篩選及我國北黃海海域微型藻的分離鑒定[D];中國海洋大學(xué);2009年

5 唐祥海;中國沿海有毒亞歷山大藻種群識(shí)別與計(jì)數(shù)方法研究[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2005年

6 李瑞丹;赤潮產(chǎn)毒藻亞歷山大藻生長及產(chǎn)毒特性分析[D];上海交通大學(xué);2009年

7 馬金華;鏈狀亞歷山大藻衰亡時(shí)期的生理與分子調(diào)控研究[D];中國海洋大學(xué);2013年

8 張淑;鏈狀亞歷山大藻高通量轉(zhuǎn)錄組測序與基因表達(dá)分析[D];中國海洋大學(xué);2014年

9 王東東;亞歷山大藻屬微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及應(yīng)用研究[D];暨南大學(xué);2007年

10 張彬;亞歷山大藻(非PSP產(chǎn)毒株)毒理的初步研究[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2007年


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