發(fā)布時間：2017-12-08 02:10

  本文關鍵詞：白色鏈霉菌和白背飛虱的基因組學研究

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【摘要】：第一部分:鏈霉菌是一類生活在極端復雜土壤環(huán)境中的革蘭氏陽性菌,能夠產(chǎn)生大量的次級代謝產(chǎn)物,是抗生素、抗腫瘤藥物及免疫抑制劑等的主要來源之一。本研究從自然界中篩選出一株產(chǎn)量為0.79 g/L的ε-聚賴氨酸(ε-poly-lysine)產(chǎn)生菌S.albulus ZPM。我們對S.albulus ZPM的基因組進行了測序、組裝、功能注釋和比較基因組學分析。S.albulus ZPM基因組大小為9.78 Mb,GC含量為72.2%,共編碼9,073個基因。比較基因組分析顯示鏈霉菌核心基因組區(qū)位于S.albulus ZPM染色體的中部,染色體的兩端區(qū)域含有很多物種特異性的基因。通過分析發(fā)現(xiàn)S.albulus ZPM含有44個次級代謝相關基因簇,其中有20個與聚酮化合物(Polyketide)和非核糖體多肽(non-ribosomal peptide)合成相關的基因簇,包括負責ε-聚賴氨酸的PGC(poly-lysine synthase gene cluster)非核糖體多肽基因簇。為了進一步鑒定與ε-聚賴氨酸產(chǎn)量相關的調(diào)控基因,我們使用復合誘變的方法篩選獲得了180株產(chǎn)量不同的S.albulus ZPM突變體。通過對30株高產(chǎn)突變株組成的混合高產(chǎn)文庫和30株低產(chǎn)突變株組成的混合低產(chǎn)文庫進行基因組重測序分析,共鑒定出162個具有能導致非同義突變的編碼蛋白基因,這些SNP突變分布在高產(chǎn)組和低產(chǎn)組有顯著差異,提示這些基因可能參與調(diào)控ε-聚賴氨酸生物合成。功能富集分析c彩菊廡┗蛑饕斡胩妓銜鎰擻氪�、基因转录调控壹s澳芰坎，

本文編號：1264643