量熱法與光譜法研究FTO蛋白與小分子類似物的相互作用
本文關(guān)鍵詞: 結(jié)構(gòu)類似物 FTO蛋白 光譜法 等溫滴定量熱法 相互作用 出處:《鄭州大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:FTO(fat mass and obesity associated)是與肥胖有關(guān)的基因,可通過(guò)去甲基作用來(lái)影響其他基因的表達(dá)。目前對(duì)于FTO蛋白是否為有效的藥物作用靶點(diǎn)還不是很清楚,而藥物小分子與蛋白質(zhì)的作用情況可在一定程度上預(yù)示藥物作用的發(fā)展進(jìn)程,因此,對(duì)于FTO蛋白與小分子類似物相互作用的研究有助于篩選有效的FTO抑制劑,指導(dǎo)藥物先導(dǎo)化合物的優(yōu)化及設(shè)計(jì)。本論文采用量熱法及光譜法研究了咔唑類生物堿、核苷類似物、喜樹(shù)堿及其衍生物、三氮唑衍生物與FTO蛋白的相互作用,主要分為以下幾個(gè)部分:第一章:主要概述了蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)功能、藥物小分子與蛋白質(zhì)大分子相互作用的研究方法、內(nèi)容及意義。第二章:采用量熱法、光譜法及分子模擬研究了6種咔唑生物堿(2a~2f)與FTO蛋白的結(jié)合情況,結(jié)果顯示:只有化合物2e與FTO發(fā)生了結(jié)合,結(jié)合過(guò)程為靜態(tài)猝滅,靜電力和疏水作用為主要作用力,同時(shí)FTO蛋白的構(gòu)象發(fā)生了變化。第三章:采用光譜法及分子模擬法研究了6種核苷類似物(3a~3f)與FTO蛋白的相互作用情況,結(jié)果表明:6種核苷類似物均能通過(guò)靜態(tài)猝滅過(guò)程與FTO發(fā)生相互作用,同時(shí)疏水作用占主導(dǎo)作用,溫度升高會(huì)引起復(fù)合物穩(wěn)定性升高;與其他化合物相比化合物3d和FTO的結(jié)合能力最強(qiáng)。第四章:研究了FTO蛋白與3種喜樹(shù)堿及其衍生物(4a~4c)的相互作用。3種化合物都能使FTO蛋白的熒光發(fā)生靜態(tài)猝滅,靜電力和疏水作用為分子間主要作用力,取代基種類及位置都會(huì)影響反應(yīng)結(jié)果,三個(gè)反應(yīng)體系中化合物4b與FTO蛋白的結(jié)合能力最強(qiáng)。第五章:考察了6種三氮唑衍生物(5a~5f)與FTO蛋白的相互作用。6種三氮唑衍生物引起FTO蛋白猝滅的過(guò)程為靜態(tài)猝滅,疏水作用力為主要作用力,其中化合物5a與5f的結(jié)合常數(shù)較大,化合物5c最小,分子模擬結(jié)果與光譜學(xué)結(jié)果基本一致。
[Abstract]:FTO(fat mass and obesity is a fat-related gene that affects the expression of other genes through demethylation. It is not clear whether the FTO protein is an effective drug target. However, the interaction between small molecules and proteins may to some extent indicate the development of drug action. Therefore, the study of the interaction of FTO proteins with small molecular analogues may help to screen effective FTO inhibitors. In this paper, the interaction of carbazole alkaloids, nucleoside analogues, camptothecin and its derivatives with FTO protein was studied by calorimetry and spectrophotometry. It is mainly divided into the following parts: the first chapter: the structure and function of protein, the research methods, contents and significance of the interaction between small drug molecules and protein macromolecules. The binding of six carbazole alkaloids (2a2f) to FTO protein was studied by spectrophotometry and molecular simulation. The results show that only compound 2e binds to FTO, the binding process is static quenching, and hydrostatic and hydrophobic interaction is the main interaction force. At the same time, the conformation of FTO protein was changed. In Chapter 3, the interaction of six nucleoside analogues with FTO protein was studied by spectrophotometry and molecular simulation. The results showed that all of the six nucleoside analogues could interact with FTO through static quenching process, and the hydrophobic interaction was dominant, and the stability of the complex would be increased with the increase of temperature. Compared with other compounds, compounds 3D and FTO have the strongest binding ability. Chapter 4th: we studied the interaction of FTO protein with three camptothecin and its derivative (4a4c). 3 kinds of compounds can cause the fluorescence of FTO protein to be quenched statically. Electrostatic force and hydrophobic interaction are the main intermolecular forces, and the type and position of substituents will affect the reaction results. The binding ability of compound 4b to FTO protein was the strongest in the three reaction systems. Chapter 5th: the interaction of 6 triazole derivatives with FTO protein was investigated. The quenching process of FTO protein induced by six triazole derivatives was static quenching. The hydrophobic force is the main force among which the binding constant of compound 5a and 5f is larger and the compound 5c is the smallest. The results of molecular simulation are in good agreement with the results of spectroscopy.
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:O657.3;TQ460.1
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,本文編號(hào):1547072
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