植物乳桿菌PC518菌株的兩個質(zhì)粒和福菜乳桿菌Y97菌株基因組的序列分析
發(fā)布時間:2023-06-28 03:10
研究背景植物乳桿菌是乳桿菌屬中含有天然質(zhì)粒最為豐富和最為多樣的菌種,也是研究乳桿菌屬的模式菌株。這些質(zhì)粒很可能在植物乳桿菌的生長、發(fā)育、遺傳和進(jìn)化中發(fā)揮著重要作用,所以豐富的天然質(zhì)?梢源龠M(jìn)植物乳桿菌屬的研究并提供理想的研究對象。從中國四川泡菜中檢出的植物乳桿菌PC518菌株中包含有多個質(zhì)粒,本課題組已經(jīng)分析和發(fā)表了其中兩個質(zhì)粒,滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒pLP18和theta復(fù)制的質(zhì)粒pLP60,而本研究則發(fā)現(xiàn)了另外兩個新質(zhì)粒。一個質(zhì)粒是通過滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒,另一個質(zhì)粒是通過theta復(fù)制的質(zhì)粒。全面分析新質(zhì)粒的序列及其所攜帶的遺傳學(xué)研究信息,不僅增加了天然質(zhì)粒數(shù)據(jù)庫的數(shù)量,而且對植物乳桿菌的分子生物學(xué)研究具有重要的意義。全基因組測序可以實現(xiàn)對乳桿菌菌株基因組間變異信息的全面掃描,同時可以一次性開發(fā)出大量的基因標(biāo)記。福菜乳桿菌也屬于乳桿菌屬,而本文分析了一株分離自臺灣福菜中的潛在的益生菌福菜乳桿菌Y97的全基因組序列,為下一步與本課題組從重慶泡姜中分離的福菜乳桿菌重慶亞種CQ16Z1菌株進(jìn)行對比和研究提供理論基礎(chǔ)。目的1.提取并檢出植物乳桿菌PC518菌株中的新質(zhì)粒;2.對新質(zhì)粒進(jìn)行序列分析和生物...
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
第一部分 植物乳桿菌PC518 中質(zhì)粒pLP325 和質(zhì)粒plp75TA的序列分析
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 質(zhì)粒DNA的序列分析方法
3.結(jié)果與分析
3.1 質(zhì)粒提取
3.2 新質(zhì)粒的檢出
3.3 質(zhì)粒的序列分析
4.討論
5.結(jié)論
第二部分 福菜乳桿菌Y97菌株基因組的序列分析
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果與分析
3.1 基因組成分分析
3.2 基因功能注釋
3.3 基因功能分類
4.討論
5.結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
致謝
本文編號:3835860
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
第一部分 植物乳桿菌PC518 中質(zhì)粒pLP325 和質(zhì)粒plp75TA的序列分析
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 質(zhì)粒DNA的序列分析方法
3.結(jié)果與分析
3.1 質(zhì)粒提取
3.2 新質(zhì)粒的檢出
3.3 質(zhì)粒的序列分析
4.討論
5.結(jié)論
第二部分 福菜乳桿菌Y97菌株基因組的序列分析
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果與分析
3.1 基因組成分分析
3.2 基因功能注釋
3.3 基因功能分類
4.討論
5.結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
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本文編號:3835860
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