動物的雌性個體常常傾向于選擇特定的雄性作為配偶,雄性個體間也會通過性別內(nèi)的直接競爭決定交配機會。無論哪種方式的性選擇,獲得更高生殖成功率的雄性通常在體格、健康程度、免疫力等方面有更高的優(yōu)勢,最終提高了后代的適合度。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),動物的皮膚微生物組的特征與宿主的免疫力、健康狀況等有密切關(guān)系;與此同時,宿主的遺傳背景也常常對其皮膚微生物組的組成與結(jié)構(gòu)有著重要影響。普氏蹄蝠存在典型的性別二態(tài)性,雄性個體頭部的頂葉器官存在明顯的大小差異,具有更大頂葉的雄性蝙蝠被認(rèn)為在性選擇中處于更高的優(yōu)勢地位。本文以普氏蹄蝠（Hipposideros pratti）為研究對象,通過對不同頂葉大小的雄性普氏蹄蝠皮膚微生物組的比較分析,揭示其頂葉形態(tài)特征與皮膚微生物組特征之間的關(guān)系。本研究通過拭子法采集雄性普氏蹄蝠的皮膚微生物,并進行16S rRNA高通量測序。在對測序結(jié)果進行質(zhì)控、拼接、分類注釋、多樣性分析、網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)構(gòu)建、差異分析和功能注釋等相關(guān)分析后,我們發(fā)現(xiàn)雄性普氏蹄蝠皮膚微生物群落主要有4個優(yōu)勢菌門,分別為擬桿菌門（Bacteroidetes）、變形菌門（Proteobacteria）、厚壁菌門（Firm... 

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 皮膚微生物研究概述
        1.1.1 皮膚微生物與免疫
        1.1.2 皮膚微生物與疾病
        1.1.3 影響皮膚微生物的因素
    1.2 皮膚微生物的研究方法
        1.2.1 擴增子測序
        1.2.2 宏基因組測序
    1.3 性選擇研究概述
        1.3.1 性別二態(tài)性概述
        1.3.2 性選擇的表現(xiàn)形式
        1.3.3 性選擇的意義
    1.4 本文的研究背景
        1.4.1 蝙蝠概述
        1.4.2 蝙蝠皮膚微生物的研究進展
        1.4.3 蝙蝠性選擇研究進展
        1.4.4 本文的研究目的
第二章 材料與方法
    2.1 樣品收集與基因測序
        2.1.1 實驗材料的收集
        2.1.2 樣品微生物的基因組提取
        2.1.3 16S rRNA擴增子文庫構(gòu)建及測序
    2.2 16S rRNA測序數(shù)據(jù)分析
        2.2.1 16S rRNA測序生物信息學(xué)分析
        2.2.2 alpha多樣性
        2.2.3 beta多樣性
        2.2.4 微生物分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)
        2.2.5 組間差異物種分析
        2.2.6 Piphillin進行的宏基因組預(yù)測與功能比較分析
第三章 結(jié)果
    3.1 樣品采集情況
    3.2 16S rRNA測序結(jié)果
    3.3 普氏蹄蝠皮膚微生物組群落組成
        3.3.1 門水平皮膚菌群的組成
        3.3.2 屬水平皮膚菌群的組成
    3.4 普氏蹄蝠皮膚微生物群落結(jié)構(gòu)分析
        3.4.1 普氏蹄蝠皮膚菌群alpha多樣性分析
        3.4.2 普氏蹄蝠皮膚菌群beta多樣性分析
    3.5 普氏蹄蝠群落結(jié)構(gòu)影響因素分析
    3.6 普氏蹄蝠皮膚微生物網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)分析
    3.7 普氏蹄蝠皮膚微生物差異分析
        3.7.1 基于LEfSe的差異分析
        3.7.2 基于隨機森林的差異分析
    3.8 普氏蹄蝠皮膚微生物的宏基因組預(yù)測與功能比較分析
第四章 討論
    4.1 普氏蹄蝠皮膚微生物多樣性
    4.2 不同大小頂葉的雄性普氏蹄蝠皮膚微生物群落差異
        4.2.1 微生物群落結(jié)構(gòu)差異
        4.2.2 微生物群落差異物種
        4.2.3 微生物基因功能差異
第五章 結(jié)論
    5.1 結(jié)論
    5.2 不足與展望
參考文獻
附錄
在學(xué)期間科研成果
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]厭氧處理系統(tǒng)微生物群落結(jié)構(gòu)與生態(tài)網(wǎng)絡(luò)研究[D]. 陶彧.哈爾濱工業(yè)大學(xué) 2015



本文編號：3703505