近年來,研究人員在哺乳動(dòng)物樣本內(nèi)發(fā)現(xiàn)了植物miRNA（植物xenomiR）,但在其是否穩(wěn)定存在并參與跨界調(diào)控這一關(guān)鍵問題上不為人所知。為了更進(jìn)一步地探究植物xenomiR的跨界調(diào)控方法,本項(xiàng)目基于人類健康組織中的高通量miRNA測序數(shù)據(jù),應(yīng)用大數(shù)據(jù)分析方法,提出有效的算法和模型來研究植物xenomiR,對(duì)miRNA的跨界調(diào)控研究、中草藥小分子RNA藥物設(shè)計(jì)、人體營養(yǎng)疾病治療等領(lǐng)域具有重要的意義。本文提出并構(gòu)建了一種基于生物大數(shù)據(jù)的植物xenomiR跨界調(diào)控研究模型,在假設(shè)植物miRNA對(duì)人類的跨界調(diào)控是存在的基礎(chǔ)上,通過選取多種人類日常可食用的植物作物,獲取來源于該作物本身的植物miRNA序列數(shù)據(jù)。并在組內(nèi)相關(guān)實(shí)驗(yàn)研究所獲取的在人體樣本內(nèi)檢測到的植物miRNA數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,進(jìn)行數(shù)據(jù)篩選及預(yù)處理。其后,通過靶基因預(yù)測、功能富集分析、GO語義分析等后續(xù)分析,探究這些miRNA在其植物本體內(nèi)與人體內(nèi)參與到的生物過程有何異同。本文應(yīng)用Multiple Dimensional Scaling算法（MDS）將眾多生物過程在二維平面內(nèi)可視化,更有效率地探究各生物過程之間的關(guān)系,同時(shí)深層次地挖掘出植物x... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.3 研究內(nèi)容及意義
    1.4 論文結(jié)構(gòu)安排
第2章 microRNA調(diào)控機(jī)制概述
    2.1 miRNA分子概述
    2.2 miRNA作用機(jī)制
    2.3 miRNA的跨界調(diào)控機(jī)制
    2.4 植物xenomiR進(jìn)入人體機(jī)制研究
    2.5 本章小結(jié)
第3章 植物xenomiR跨界調(diào)控模型構(gòu)建
    3.1 模型概述及技術(shù)路線
        3.1.1 模型概述
        3.1.2 技術(shù)路線
    3.2 基于生物大數(shù)據(jù)與對(duì)比實(shí)驗(yàn)的假說驗(yàn)證
    3.3 基于種子互補(bǔ)配對(duì)和機(jī)器學(xué)習(xí)算法的靶基因預(yù)測
    3.4 基于LeaderRank算法的核心節(jié)點(diǎn)篩選
    3.5 基于Multiple Dimensional Scaling算法的GO語義分析
    3.6 本章小結(jié)
第4章 植物xenomiR跨界調(diào)控模型的數(shù)據(jù)獲取及預(yù)處理
    4.1 數(shù)據(jù)的獲取
    4.2 靶基因預(yù)測
    4.3 核心節(jié)點(diǎn)篩選
    4.4 本章小結(jié)
第5章 植物xenomiR跨界調(diào)控分析
    5.1 植物-植物組功能富集分析
        5.1.1 大豆-大豆
        5.1.2 水稻-水稻
        5.1.3 玉米-玉米
    5.2 植物-人組功能富集分析
        5.2.1 大豆-人
        5.2.2 水稻-人
        5.2.3 玉米-人
    5.3 生物過程及GO語義分析
        5.3.1 大豆
        5.3.2 水稻
        5.3.3 玉米
    5.4 植物xenomiR對(duì)人的跨界調(diào)控作用
第6章 總結(jié)與展望
    6.1 總結(jié)
    6.2 展望
參考文獻(xiàn)
作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]microRNA靶基因預(yù)測算法的研究與發(fā)展[J]. 程爽,郭茂祖,武雪劍.  智能計(jì)算機(jī)與應(yīng)用. 2018(01)



本文編號(hào)：3639175