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基于數(shù)據(jù)場與3-D圖形表示的DNA序列分析

發(fā)布時間:2022-02-09 10:21
  該文提出了DNA序列的一種3-D圖形表示,并且針對此圖形表示的非退化性給出了數(shù)學(xué)證明。然后計算所提3維圖形表示的L/L矩陣的ALE指標(biāo),并給出了所提3維圖形的圖半徑,從而對DNA序列進(jìn)行數(shù)值刻畫。結(jié)合物理學(xué)中重力場勢函數(shù)的思想,構(gòu)造了向量形式的數(shù)據(jù)對象間的勢函數(shù),進(jìn)而以K-近鄰算法為分類器,對208個RIG-I基因進(jìn)行了分類識別。實驗結(jié)果證明了該文所提的分類辦法是有效的。 

【文章來源】:科技資訊. 2020,18(21)

【文章頁數(shù)】:3 頁

【部分圖文】:

基于數(shù)據(jù)場與3-D圖形表示的DNA序列分析


4種堿基A、C、G、T的賦向圖

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于綜合DNA序列特征的支持向量機(jī)方法識別核小體定位[J]. 崔穎,徐澤龍,李建中.  生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志. 2020(03)
[2]一種基于數(shù)據(jù)場的K-均值算法[J]. 簡艷,賈洪勇.  計算機(jī)應(yīng)用研究. 2010(12)
[3]基于數(shù)據(jù)場的大規(guī)模本體映射[J]. 仲茜,李涓子,唐杰,周立柱.  計算機(jī)學(xué)報. 2010(06)

博士論文
[1]基于多核和眾核平臺的并行DNA序列比對算法[D]. 產(chǎn)院東.山東大學(xué) 2019
[2]基于新型表達(dá)模式的序列特征獲取方法及應(yīng)用研究[D]. 向其林.湖南大學(xué) 2017
[3]雞MDA5-STING-IFN-β抗病毒天然免疫通路的發(fā)現(xiàn)及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制[D]. 程玉強(qiáng).上海交通大學(xué) 2016

碩士論文
[1]DNA序列的圖形表示及其應(yīng)用[D]. 費文超.渤海大學(xué) 2016
[2]基于圖形表示的DNA序列相似性分析[D]. 王科.河北科技大學(xué) 2016



本文編號:3616835

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