microRNA（miRNA）是一類主要功能為在轉(zhuǎn)錄后水平上抑制基因表達(dá)的內(nèi)源性小型非編碼RNA分子,它在許多重要的生物學(xué)過程中的都具有調(diào)控作用,其中就包含人類的復(fù)雜疾病。最近的研究表明,許多復(fù)雜疾病往往伴隨著miRNA的異常表達(dá),所以miRNA可以作為一類疾病診斷的潛在生物標(biāo)記物和分子靶向治療的靶標(biāo)位點,來輔助疾病診斷、治療以及預(yù)后。因此,大規(guī)模預(yù)測潛在的miRNA-疾病關(guān)聯(lián),對探明致病機(jī)制有十分重要的意義�？紤]到傳統(tǒng)的體外實驗存在耗時和成本高昂等問題,研究有效、可行的計算方法來預(yù)測miRNA與疾病之間的潛在關(guān)聯(lián)越來越受到人們關(guān)注。本文主要研究RNA序列的特征提取以及多源數(shù)據(jù)融合,提出了3種應(yīng)用于miRNA-疾病相關(guān)性預(yù)測的計算模型:1、基于矩陣分解的miRNA-疾病相關(guān)性預(yù)測算法MLMDA。算法使用k-mer稀疏矩陣提取miRNA序列信息,并將其與miRNA功能相似性、疾病語義相似性和高斯相互作用譜內(nèi)核相似性信息相結(jié)合;然后,通過深度自動編碼器神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（AE）來從中提取更多具有代表性的特征。最后,采用隨機(jī)森林分類器來有效預(yù)測潛在的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)。2、基于混沌博弈和增量學(xué)習(xí)的m... 

【文章來源】：中國礦業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

k-mer算法遍歷整RNA核苷酸序列的流程圖

hsa-mir-135(miRNA)的混沌博弈表示Figure2-2CGRofthemiRNAnamedhsa-mir-135

混沌博弈表示中（hsa-mir-135）各個點坐標(biāo)的含義Figure2-3ThemeaningofthecoordinatesofeachpointintheChaosGameRepresentation(hsa-mir-135)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]MicroRNA在腫瘤診治中的研究進(jìn)展[J]. 王俊,王巖.  癌癥進(jìn)展. 2016(05)



本文編號：3556516