基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的B16F10細(xì)胞CD44基因定向修飾的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-13 08:27
CRISPR/Cas9系統(tǒng)是繼鋅指核酸酶(ZFNs)技術(shù)和轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(TALENs)技術(shù)后新的基因編輯技術(shù)。與ZFNs和TALENs相比,CRISPR/Cas9系統(tǒng)具有操作簡(jiǎn)單,花費(fèi)低的優(yōu)點(diǎn)。CRISPR/Cas系統(tǒng)有三種類型,即I型、II型和III型,其中II型是最為簡(jiǎn)單的,人們將其改為基因組定點(diǎn)修飾技術(shù),即CRISPR/Cas9系統(tǒng)。CD44是一組分布極為廣泛的多分子形式的膜整合糖蛋白,可以在細(xì)胞中介導(dǎo)粘附作用,參與細(xì)胞之間特異性粘連過程,包括細(xì)胞與細(xì)胞之間,細(xì)胞與基質(zhì)之間等。大量研究表明,CD44分子在許多惡性腫瘤中表達(dá),參與腫瘤的發(fā)生及其調(diào)控,但當(dāng)前CD44分子的作用機(jī)制尚不明確,所以,建立CD44表達(dá)降低的小鼠黑色素瘤(B16F10)細(xì)胞研究其CD44蛋白的作用有重要的意義。研究目的:利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)基因編輯技術(shù),在小鼠黑色素瘤細(xì)胞中建立CD44表達(dá)降低的細(xì)胞株,并以CD44表達(dá)降低的細(xì)胞為研究對(duì)象,進(jìn)行各種生物學(xué)活性的檢測(cè)。研究方法:(1)對(duì)CD44基因設(shè)計(jì)sgRNA序列,sg RNA序列與線性化的PX459質(zhì)粒連接形成重組質(zhì)粒,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證,構(gòu)...
【文章來(lái)源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
嗜熱鏈球菌CRISPR/Cas系統(tǒng)基本結(jié)構(gòu)
圖 2 CRISPR/Cas 系統(tǒng)干擾外源噬菌體入侵示意圖[35]Fig 2 CRISPR/Cas system interference with exogenous phage intrusions1.1.4 sgRNA 的設(shè)計(jì)與選擇根據(jù)前邊介紹及研究,我們得知 sgRNA 的設(shè)計(jì)和選擇是 CRISPR/Cas9 技術(shù)的精髓,也是實(shí)驗(yàn)成功與否的關(guān)鍵。因?yàn)?sgRNA 決定了 Cas9 的靶向性和特異性,
目前廣泛應(yīng)用的土壤農(nóng)桿菌系統(tǒng)來(lái)說:sgRNA 結(jié)合的靶基因序列的 3’端必G 序列(N 可以為 A、T、C、G 任意堿基),即 PAM 序列(例如本實(shí)驗(yàn)所–GAATACACCTGCGTAGCGGCAGG-3’),Cas9 會(huì)在 PAM 序列 5’端大約對(duì) DNA 序列進(jìn)行切割(見圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]神經(jīng)皮膚黑色素細(xì)胞增生伴原發(fā)顱內(nèi)黑色素瘤[J]. 趙程程,姚坤. 哈爾濱商業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(06)
[2]TALENs:Customizable Molecular DNA Scissors for Genome Engineering of Plants[J]. Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2013(06)
[3]CD44與乳腺癌的研究進(jìn)展[J]. 趙書,黃彬. 四川解剖學(xué)雜志. 2011(02)
[4]CD44在胃癌中研究新進(jìn)展[J]. 涂琦,劉勇,戴艷枝. 江西醫(yī)藥. 2010(12)
[5]CD44分子變異體在胃癌轉(zhuǎn)移中的研究進(jìn)展[J]. 侯振江,鄭玉中,單保恩. 中國(guó)腫瘤臨床與康復(fù). 2008(05)
[6]Isolation and biological analysis of tumor stem cells from pancreatic adenocarcinoma[J]. Peng Huang, Chun-You Wang, Shan-Miao Gou, He-Shui Wu, Tao Liu, Jiang-Xin Xiong, Department of Pancreatic Surgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430022, Hubei Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2008(24)
[7]CD44v6在非小細(xì)胞肺癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 仲寧,沈振亞,鄭世營(yíng),余云生,葉文學(xué),焦鵬,黃浩岳. 蘇州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2008(02)
[8]CD44v3在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)以及對(duì)生存率的預(yù)測(cè)價(jià)值[J]. 吳秋平,蔣耀光,閔家新,羅世忠. 中國(guó)肺癌雜志. 2003(06)
本文編號(hào):3492690
【文章來(lái)源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
嗜熱鏈球菌CRISPR/Cas系統(tǒng)基本結(jié)構(gòu)
圖 2 CRISPR/Cas 系統(tǒng)干擾外源噬菌體入侵示意圖[35]Fig 2 CRISPR/Cas system interference with exogenous phage intrusions1.1.4 sgRNA 的設(shè)計(jì)與選擇根據(jù)前邊介紹及研究,我們得知 sgRNA 的設(shè)計(jì)和選擇是 CRISPR/Cas9 技術(shù)的精髓,也是實(shí)驗(yàn)成功與否的關(guān)鍵。因?yàn)?sgRNA 決定了 Cas9 的靶向性和特異性,
目前廣泛應(yīng)用的土壤農(nóng)桿菌系統(tǒng)來(lái)說:sgRNA 結(jié)合的靶基因序列的 3’端必G 序列(N 可以為 A、T、C、G 任意堿基),即 PAM 序列(例如本實(shí)驗(yàn)所–GAATACACCTGCGTAGCGGCAGG-3’),Cas9 會(huì)在 PAM 序列 5’端大約對(duì) DNA 序列進(jìn)行切割(見圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]神經(jīng)皮膚黑色素細(xì)胞增生伴原發(fā)顱內(nèi)黑色素瘤[J]. 趙程程,姚坤. 哈爾濱商業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(06)
[2]TALENs:Customizable Molecular DNA Scissors for Genome Engineering of Plants[J]. Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2013(06)
[3]CD44與乳腺癌的研究進(jìn)展[J]. 趙書,黃彬. 四川解剖學(xué)雜志. 2011(02)
[4]CD44在胃癌中研究新進(jìn)展[J]. 涂琦,劉勇,戴艷枝. 江西醫(yī)藥. 2010(12)
[5]CD44分子變異體在胃癌轉(zhuǎn)移中的研究進(jìn)展[J]. 侯振江,鄭玉中,單保恩. 中國(guó)腫瘤臨床與康復(fù). 2008(05)
[6]Isolation and biological analysis of tumor stem cells from pancreatic adenocarcinoma[J]. Peng Huang, Chun-You Wang, Shan-Miao Gou, He-Shui Wu, Tao Liu, Jiang-Xin Xiong, Department of Pancreatic Surgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430022, Hubei Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2008(24)
[7]CD44v6在非小細(xì)胞肺癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 仲寧,沈振亞,鄭世營(yíng),余云生,葉文學(xué),焦鵬,黃浩岳. 蘇州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2008(02)
[8]CD44v3在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)以及對(duì)生存率的預(yù)測(cè)價(jià)值[J]. 吳秋平,蔣耀光,閔家新,羅世忠. 中國(guó)肺癌雜志. 2003(06)
本文編號(hào):3492690
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