夾心平板法在海洋沉積物細(xì)菌分離中的初步應(yīng)用及兩株新菌的多相分類
發(fā)布時間:2021-11-09 12:44
海洋環(huán)境是復(fù)雜多變的,其中存在著巨大的微生物資源。這些海洋微生物不僅在海洋生態(tài)系統(tǒng)和生物地球化學(xué)循環(huán)中起著至關(guān)重要的作用,而且是新型生物活性物質(zhì)和先導(dǎo)化合物的重要來源之一。分離和鑒定海洋微生物資源,尤其是潛在的新物種的分離鑒定和研究是極其重要的。由于分離培養(yǎng)條件和技術(shù)的有限性,這些海洋微生物絕大多數(shù)是未被開發(fā)利用的,也沒有獲得菌株的純培養(yǎng)物,因此,需要對現(xiàn)有分離培養(yǎng)條件進(jìn)行改善和優(yōu)化,開發(fā)新的分離培養(yǎng)方法,分離純化出更多的以前未培養(yǎng)的微生物。本文以威海近海沉積物樣品為研究對象,利用夾心平板法分離海洋沉積物中的微生物,進(jìn)行微生物多樣性的研究,并結(jié)合16S rRNA基因高通量測序技術(shù)分析可培養(yǎng)細(xì)菌的區(qū)系變化,篩選出依賴型菌株,圍繞一株代表性菌株進(jìn)行基因組和轉(zhuǎn)錄組的分析,探究依賴型菌株和助長菌株的促生機(jī)制。將海洋沉積物樣品分為對照組A01、實(shí)驗(yàn)組A08、A38、A71和A72不同的處理組,進(jìn)行微生物的分離培養(yǎng)工作,并結(jié)合16S rRNA基因高通量測序,分析可培養(yǎng)細(xì)菌區(qū)系的變化。選用四株助長菌,利用夾心平板法總共分離到447株細(xì)菌,分布于5個門,116個屬,216個物種中,潛在新物種有156株...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1沉積物樣品采樣點(diǎn)??Fiure?2-1?Sediment?samle?samlinsite??
養(yǎng)基上,大約形成直徑70mm的區(qū)域,置于28°C培養(yǎng)箱培養(yǎng)2天后,即在底層培??養(yǎng)基表面長出菌苔后待用。上層培養(yǎng)基是改良的1/〗〇?2216E培養(yǎng)基,經(jīng)高溫滅菌??后冷卻至50?°C左右后,倒入助長菌生長良好的底層培養(yǎng)基上,使得整個培養(yǎng)皿鋪??滿即可。28?°C培養(yǎng)箱培養(yǎng)2天觀察夾心培養(yǎng)基的情況。如有助長菌生長到夾心培??養(yǎng)基最上層或是有其他雜菌的生長,則說明此培養(yǎng)基被污染。選取表面無任何菌株??生長的培養(yǎng)基作為微生物分離過程中的分離培養(yǎng)基使用。另外,設(shè)計了一組對照組,??即在底層培養(yǎng)基和上層培養(yǎng)基中間沒有任何助長菌的存在。夾心培養(yǎng)基的配制過??程如圖2-2所示。??
文???表2-4不同分離培養(yǎng)基可培養(yǎng)細(xì)菌菌落計數(shù)??Table?2-4?Number?of?colonies?of?culturable?bacteria?in?different?isolation?media??不同處理組?菌落總數(shù)(/g)???A01?1.6xl〇5??A08?2.5xl〇5??A3?8?1.9xl05??A71?9.5xl〇4??A72?1.4xl05??泰C?La?X?)??A01?A08?A38?A71?A72??圖2-3不同分離培養(yǎng)基的細(xì)菌菌落形態(tài)??Fig?2-3?Bacterial?colony?morphology?in?different?isolation?media??表2-S潛在新物種的分類地位??Table?2-5?The?taxonomic?positions?of?potential?novel?species??菌株編號?比對結(jié)果?相似度系統(tǒng)發(fā)育類群(門)??對照組A01??C02?Luteimonas?padinae?97.95%?Proteobacteria??C03?Halocynthiibacter?namhaensis?97.69%?Proteobacteria??C09?Luteimonas?padinae?98.05%?Proteobacteria??CIO?Mesorhizobium?amorphae?98.26%?Proteobacteria??C11?Microbacterium?arthrosphaerae?98.21?%?Actinobacteria??C12?Bacillus?vi
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]海洋放線菌Streptomyces sp.MDW-06中1個新的聚酮類化合物[J]. 王聰,邱子言,雷福厚,譚學(xué)才,姜明國,李浩,李小燕. 中國中藥雜志. 2019(10)
[2]海洋動物來源微生物分離培養(yǎng)的新方法[J]. 陳雷,畢洪玉,王婉瑩,王光玉. 微生物學(xué)通報. 2018(09)
[3]未培養(yǎng)微生物原位培養(yǎng)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 張作艷,丁立建,何山. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2018(05)
[4]從環(huán)境中分離培養(yǎng)微生物:培養(yǎng)基營養(yǎng)水平至關(guān)重要[J]. 周楠,姜成英,劉雙江. 微生物學(xué)通報. 2016(05)
[5]微生物共培養(yǎng)技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 徐德陽,王莉莉,杜春梅. 微生物學(xué)報. 2015(09)
[6]海洋微生物多樣性及其分子生態(tài)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李祎,鄭偉,鄭天凌. 微生物學(xué)通報. 2013(04)
[7]海洋微生物多樣性的研究進(jìn)展[J]. 孫昌魁,馮靜,馬桂榮. 生命科學(xué). 2001(03)
本文編號:3485368
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1沉積物樣品采樣點(diǎn)??Fiure?2-1?Sediment?samle?samlinsite??
養(yǎng)基上,大約形成直徑70mm的區(qū)域,置于28°C培養(yǎng)箱培養(yǎng)2天后,即在底層培??養(yǎng)基表面長出菌苔后待用。上層培養(yǎng)基是改良的1/〗〇?2216E培養(yǎng)基,經(jīng)高溫滅菌??后冷卻至50?°C左右后,倒入助長菌生長良好的底層培養(yǎng)基上,使得整個培養(yǎng)皿鋪??滿即可。28?°C培養(yǎng)箱培養(yǎng)2天觀察夾心培養(yǎng)基的情況。如有助長菌生長到夾心培??養(yǎng)基最上層或是有其他雜菌的生長,則說明此培養(yǎng)基被污染。選取表面無任何菌株??生長的培養(yǎng)基作為微生物分離過程中的分離培養(yǎng)基使用。另外,設(shè)計了一組對照組,??即在底層培養(yǎng)基和上層培養(yǎng)基中間沒有任何助長菌的存在。夾心培養(yǎng)基的配制過??程如圖2-2所示。??
文???表2-4不同分離培養(yǎng)基可培養(yǎng)細(xì)菌菌落計數(shù)??Table?2-4?Number?of?colonies?of?culturable?bacteria?in?different?isolation?media??不同處理組?菌落總數(shù)(/g)???A01?1.6xl〇5??A08?2.5xl〇5??A3?8?1.9xl05??A71?9.5xl〇4??A72?1.4xl05??泰C?La?X?)??A01?A08?A38?A71?A72??圖2-3不同分離培養(yǎng)基的細(xì)菌菌落形態(tài)??Fig?2-3?Bacterial?colony?morphology?in?different?isolation?media??表2-S潛在新物種的分類地位??Table?2-5?The?taxonomic?positions?of?potential?novel?species??菌株編號?比對結(jié)果?相似度系統(tǒng)發(fā)育類群(門)??對照組A01??C02?Luteimonas?padinae?97.95%?Proteobacteria??C03?Halocynthiibacter?namhaensis?97.69%?Proteobacteria??C09?Luteimonas?padinae?98.05%?Proteobacteria??CIO?Mesorhizobium?amorphae?98.26%?Proteobacteria??C11?Microbacterium?arthrosphaerae?98.21?%?Actinobacteria??C12?Bacillus?vi
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]海洋放線菌Streptomyces sp.MDW-06中1個新的聚酮類化合物[J]. 王聰,邱子言,雷福厚,譚學(xué)才,姜明國,李浩,李小燕. 中國中藥雜志. 2019(10)
[2]海洋動物來源微生物分離培養(yǎng)的新方法[J]. 陳雷,畢洪玉,王婉瑩,王光玉. 微生物學(xué)通報. 2018(09)
[3]未培養(yǎng)微生物原位培養(yǎng)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 張作艷,丁立建,何山. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2018(05)
[4]從環(huán)境中分離培養(yǎng)微生物:培養(yǎng)基營養(yǎng)水平至關(guān)重要[J]. 周楠,姜成英,劉雙江. 微生物學(xué)通報. 2016(05)
[5]微生物共培養(yǎng)技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 徐德陽,王莉莉,杜春梅. 微生物學(xué)報. 2015(09)
[6]海洋微生物多樣性及其分子生態(tài)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李祎,鄭偉,鄭天凌. 微生物學(xué)通報. 2013(04)
[7]海洋微生物多樣性的研究進(jìn)展[J]. 孫昌魁,馮靜,馬桂榮. 生命科學(xué). 2001(03)
本文編號:3485368
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