普氏原羚（Procapra przewalskii）是中國特有珍稀瀕危物種,歷史上曾分布于我國的甘肅、內(nèi)蒙、寧夏、青海、新疆和西藏等地,現(xiàn)僅分布在青海湖周邊地區(qū)。通過對青海湖湖東-克圖地區(qū)土壤和牧草礦物質(zhì)元素的研究,發(fā)現(xiàn)該地區(qū)是嚴(yán)重缺硒區(qū)。然而,生存于硒（Se）缺乏地區(qū)的普氏原羚卻不見缺硒表癥。因此,研究普氏原羚對自然棲息地環(huán)境硒脅迫的適應(yīng)性機(jī)制,并為普氏原羚的保護(hù)提出新的對策,不僅是理論研究的必要,并且在瀕危野生動物保護(hù)中也具有重要的指導(dǎo)意義。本研究以青海湖流域湖東-克圖地區(qū)、元者地區(qū)和鳥島保護(hù)區(qū)“土壤-牧草-普氏原羚”系統(tǒng)為研究對象,通過評價土壤、牧草和普氏原羚礦物質(zhì)營養(yǎng)狀況,分析普氏原羚血液生理生化、血液流變學(xué)和抗氧化系統(tǒng)等參數(shù),同時重點運用基于同位素標(biāo)記相對與絕對定量（iTRAQ）的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)探討缺硒環(huán)境中普氏原羚血液差異蛋白質(zhì)組的表達(dá)特性,著重在蛋白水平上尋找普氏原羚對環(huán)境硒缺乏響應(yīng)的生物標(biāo)志物,并探索普氏原羚對環(huán)境硒脅迫的響應(yīng)機(jī)制。本論文主要研究結(jié)果如下:（1）研究區(qū)域土壤和混合牧草礦物質(zhì)營養(yǎng)含量存在明顯的季節(jié)差異。牧草幼苗期和枯草期土壤速效Cu和Se含量... 

【文章來源】：西南科技大學(xué)四川省

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

研究區(qū)域Figure1-1Studiedarea

西南科技大學(xué)碩士學(xué)位論文42圖4-1.涉及硒相關(guān)生物過程的27種差異表達(dá)蛋白的互作分析。注：根據(jù)它們所涉及的生物學(xué)過程，這些蛋白可大致分為六類，即免疫應(yīng)答，氧化還原過程，硒結(jié)合，生長調(diào)節(jié)，骨形態(tài)發(fā)生和內(nèi)皮發(fā)育。Fig.4-1.Stringanalysisof27differentiallyexpressedproteinsinvolvedinSe-associatedbiologicalprocesses.Note:Theseproteinscanbemainlydividedintosixgroups,accordingtothebiologicalprocessesinwhichtheyareinvolved,namely,immuneresponse,oxidation-reductionprocess,seleniumbinding,regulationofgrowth,bonemorphogenesis,andendotheliumdevelopment.4.5.2普氏原羚血清差異蛋白質(zhì)GO功能注釋對鑒定到的所有血清差異蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體數(shù)據(jù)庫(GeneOntology,GO)注釋并統(tǒng)計分析，結(jié)果表明(如圖4-2)，在硒缺組與正常組之間，130個差異蛋白參與1996個生物過程，292個細(xì)胞成分和303個分子功能。二級GO注釋顯示，按照其功能活性分類，這些差異蛋白可以分為三大類，即包括生物過程(79種蛋白質(zhì))、細(xì)胞成分(88種蛋白質(zhì))和分子功能(80種蛋白質(zhì))，每種類型的蛋白質(zhì)均在圖3。最密集的生物學(xué)過程包括單一生物過程(67種蛋白質(zhì))、細(xì)胞過程(66種蛋白質(zhì))和代謝過程(51種蛋白質(zhì))。前三個細(xì)胞組成分別是細(xì)胞外區(qū)域(70個蛋白質(zhì))、細(xì)胞(70個蛋白質(zhì))和細(xì)胞部分(64個蛋白質(zhì))；前三的分子功能分別是結(jié)合(74個蛋白質(zhì))、催化活性(38個蛋白質(zhì))和分子功能調(diào)節(jié)(8個蛋白質(zhì))。

第四章利用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析缺硒環(huán)境普氏原羚血清差異蛋白質(zhì)組表達(dá)特性43圖4-2.差異蛋白的基因本體（GO）分類。注：蛋白質(zhì)分為三大類：生物過程，細(xì)胞成分和分子功能。Fig.4-2.GeneOntology(GO)classificationofthedifferentiallyexpressedproteins.Note:Proteinswereclassifiedintothreemaincategories:biologicalprocess,cellularcomponent,andmolecularfunction.4.5.3普氏原羚血清差異蛋白質(zhì)KEGG分析為了分析缺硒環(huán)境主要影響的生化過程和相關(guān)的病理生理途徑，對普氏原羚血清差異蛋白進(jìn)行了京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路注釋富集分析。附表S1中列出了前55條變化通路的倍數(shù)差異和注釋。比較硒缺組與正常組之間主要功能分類的差異表達(dá)蛋白數(shù)量，差異蛋白主要的KEGG功能分類包括代謝(Metabolism)，基因信息處理(Geneinformationprocessing)，環(huán)境信息處理(Environmentalinformationprocessing)，細(xì)胞過程(Cellularprocesses)和生物系統(tǒng)途徑(Organismalsystempathway)。在所有的差異蛋白中，參與機(jī)體系統(tǒng)途徑的蛋白質(zhì)(23種蛋白質(zhì))表現(xiàn)出最高的富集度(圖4-3)。進(jìn)一步應(yīng)用優(yōu)化篩選標(biāo)準(zhǔn)分析在差異途徑中富集的差異蛋白表明，缺硒組普氏原羚血清的差異蛋白在補體和凝血級聯(lián)反應(yīng)(Coagulationandcomplementcascades)中高度富集，其次是粘著斑通路(Focaladhesion)、胰液分泌通路(Pancreaticsecretion)、花生四烯酸代謝通路(Arachidonicacidmetabolism)、血小板活化(Plateletactivation)及氧化磷酸化(Oxidativephosphorylation)等途徑。總共六個差異蛋白被鑒定為這些途徑的關(guān)鍵信號分子，包括C1S(補體C1s)、F13B(凝血因子XIIIB鏈)、F11(凝血因子XI)、C4BPA(補體成分4結(jié)合蛋白α)、P12725(α-1-抗蛋白酶)和KNG1(激肽原1)(附表S1)。這些差異蛋

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3470443