江西病媒昆蟲蚋分子鑒定研究
發(fā)布時間:2021-10-14 13:34
蚋(Diptera:Simuliidae)不僅叮刺吸血,同時還會傳染疾病,是一種十分重要的人畜共患病的病媒昆蟲,因此許多國家都非常重視對蚋的生態(tài)習(xí)性及防治的研究工作。但并不是所有的蚋都會傳播疾病,因此精確的鑒定蚋種便成為防控工作的基礎(chǔ)。由于蚋的形態(tài)高度相似,尤其是同一種團(tuán)內(nèi)的近緣種難以用形態(tài)學(xué)方法進(jìn)行鑒定,細(xì)胞遺傳學(xué)方法雖然可對近緣種進(jìn)行鑒別,但是操作費時且需要特定發(fā)育階段的樣本。所以利用分子方法等多種綜合手段對蚋科昆蟲的分子分類和系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)行研究分析,是非常有必要的,同時也可以為蚋的防控研究奠定分子基礎(chǔ)。本文對江西省6個標(biāo)志地區(qū)進(jìn)行標(biāo)本采集并分析,根據(jù)形態(tài)學(xué)分類方法將所采集標(biāo)本進(jìn)行分類,得到4種形態(tài)種。紡蚋亞屬的黃毛紡蚋Simulium aureohirtumnr。蚋亞屬的五條蚋S. quinquestriatum、雙齒蚋S. bidentatum和爬蚋S. reptans,其他標(biāo)本鑒定到屬,其中爬蚋S. reptans是新記錄中。將已經(jīng)鑒定過的標(biāo)本提取線粒體基因COI片段,利用MEGA5.0對其進(jìn)行成分、系統(tǒng)發(fā)育和種間遺傳差異的分析,得到的結(jié)果與形態(tài)鑒定的結(jié)果相一致。同時利用PCR...
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蚋科昆蟲簡介
1.2 江西蚋科昆蟲的分類現(xiàn)狀
1.3 蚋科昆蟲分子研究進(jìn)展
1.3.1 DNA條形碼技術(shù)在蚋科昆蟲分子研究中的應(yīng)用
1.3.2 多種序列、標(biāo)記在蚋科昆蟲分子研究中的應(yīng)用
1.3.3 蚋科昆蟲的分子系統(tǒng)發(fā)育研究
1.3.4 多基因標(biāo)記對蚋科昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育研究
1.3.5 討論以及展望
1.4 線粒體基因組簡介
1.4.1 線粒體概述
1.4.2 線粒體基因組的組成及雙翅目昆蟲的線粒體基因組特征
1.5 線粒體基因組測序方法
1.5.1 鳥槍法(Shotgun Squencing)-物理分離線粒體DNA的克隆文庫測序方法
1.5.2 引物步移法(Primer Walking)
1.5.3 LA-PCR測序技術(shù)(Long and accurate polymerase chain reaction)
1.6 雙翅目昆蟲線粒體基因組研究進(jìn)展
1.7 研究的意義和目的
第2章 利用DNA條形碼技術(shù)對江西蚋科進(jìn)行鑒定
1 材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 初步形態(tài)鑒定
1.2.2 分子生物學(xué)鑒定
1.2.2.1 DNA的提取
1.2.2.2 COI基因PCR擴(kuò)增
1.2.2.3 PCR產(chǎn)物的檢測及測序
1.2.2.4 DNA序列數(shù)據(jù)的處理及分子系統(tǒng)樹構(gòu)建
2 結(jié)果和分析
2.1 形態(tài)鑒定結(jié)果
2.2 分子鑒定結(jié)果
2.2.1 COI基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 分子鑒定結(jié)果
2.2.3 COI基因序列分析
2.2.4 COI基因遺傳距離及系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論
第3章 黃毛紡蚋S.aureohirtum線粒體基因組全序列測定
1 材料與方法
1.1 供試蟲形態(tài)鑒定和標(biāo)本保存
1.2 實驗流程
1.2.1 基因組提取
1.2.2 引物的設(shè)計
1.2.3 PCR擴(kuò)增
1.2.4 序列測定
1.2.5 序列的拼接與注釋
2 結(jié)果與分析
2.1 黃毛紡蚋mtDNA基因組結(jié)構(gòu)
2.2 黃毛紡蚋mtDNA基因的堿基組成
2.3 蛋白質(zhì)編碼基因分析
2.4 黃毛紡蚋線粒體基因組tRNA與rRNA結(jié)構(gòu)分析
2.5 非編碼區(qū)
3 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]五條蚋(Simulium quinquestriatum)不同地理種群遺傳多樣性的ISSR標(biāo)記研究[J]. 修江帆,張春林,陳漢彬. 生物技術(shù)通報. 2013(07)
[2]雙翅目昆蟲線粒體基因組結(jié)構(gòu)特點及其測序通用引物的設(shè)計和應(yīng)用[J]. 張乃心,張玉娟,余果,陳斌. 昆蟲學(xué)報. 2013(04)
[3]線粒體基因組數(shù)據(jù)的分析方法和軟件[J]. 李雪娟,楊婧,王俊紅,任倩俐,李霞,黃原. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2013(01)
[4]分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)[J]. 黃原. 遺傳. 2012(11)
[5]殘鍔線蛺蝶線粒體基因組全序列及其系統(tǒng)學(xué)意義(英文)[J]. 田麗麗,孫曉燕,陳梅,蓋永華,郝家勝,楊群. 動物學(xué)研究. 2012(02)
[6]福建省五條蚋和黃毛紡蚋nrDNA-ITS序列分析(雙翅目:蚋科)[J]. 王宇平,高博,張建慶,王光輝,黃恩炯. 寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2010 (01)
[7]3種吸血蚋酯酶同工酶的比較研究[J]. 高博,張建慶,蔡亨忠,王光輝,范建華,黃健群,黃恩炯,王宇平,張述鏗,王公東. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2009(02)
[8]江西九連山繩蚋一新種(雙翅目:蚋科)(英文)[J]. 康哲,張春林,陳漢彬. 寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2007(03)
[9]江西省蚋屬一新種(雙翅目,蚋科)(英文)[J]. 陳漢彬,康哲,張春林. 動物分類學(xué)報. 2007(03)
[10]五條蚋兩地理株多線染色體比較研究[J]. 溫小軍,韋靜,陳漢彬. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2007(03)
博士論文
[1]幾種入侵斑潛蠅線粒體全基因組序列分析及種群分化研究[D]. 王帥宇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]中國乳白蟻屬分類修訂研究[D]. 丁俊杰.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]蚋科昆蟲分類研究[D]. 蔡茹.安徽理工大學(xué) 2005
本文編號:3436261
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蚋科昆蟲簡介
1.2 江西蚋科昆蟲的分類現(xiàn)狀
1.3 蚋科昆蟲分子研究進(jìn)展
1.3.1 DNA條形碼技術(shù)在蚋科昆蟲分子研究中的應(yīng)用
1.3.2 多種序列、標(biāo)記在蚋科昆蟲分子研究中的應(yīng)用
1.3.3 蚋科昆蟲的分子系統(tǒng)發(fā)育研究
1.3.4 多基因標(biāo)記對蚋科昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育研究
1.3.5 討論以及展望
1.4 線粒體基因組簡介
1.4.1 線粒體概述
1.4.2 線粒體基因組的組成及雙翅目昆蟲的線粒體基因組特征
1.5 線粒體基因組測序方法
1.5.1 鳥槍法(Shotgun Squencing)-物理分離線粒體DNA的克隆文庫測序方法
1.5.2 引物步移法(Primer Walking)
1.5.3 LA-PCR測序技術(shù)(Long and accurate polymerase chain reaction)
1.6 雙翅目昆蟲線粒體基因組研究進(jìn)展
1.7 研究的意義和目的
第2章 利用DNA條形碼技術(shù)對江西蚋科進(jìn)行鑒定
1 材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 初步形態(tài)鑒定
1.2.2 分子生物學(xué)鑒定
1.2.2.1 DNA的提取
1.2.2.2 COI基因PCR擴(kuò)增
1.2.2.3 PCR產(chǎn)物的檢測及測序
1.2.2.4 DNA序列數(shù)據(jù)的處理及分子系統(tǒng)樹構(gòu)建
2 結(jié)果和分析
2.1 形態(tài)鑒定結(jié)果
2.2 分子鑒定結(jié)果
2.2.1 COI基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 分子鑒定結(jié)果
2.2.3 COI基因序列分析
2.2.4 COI基因遺傳距離及系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論
第3章 黃毛紡蚋S.aureohirtum線粒體基因組全序列測定
1 材料與方法
1.1 供試蟲形態(tài)鑒定和標(biāo)本保存
1.2 實驗流程
1.2.1 基因組提取
1.2.2 引物的設(shè)計
1.2.3 PCR擴(kuò)增
1.2.4 序列測定
1.2.5 序列的拼接與注釋
2 結(jié)果與分析
2.1 黃毛紡蚋mtDNA基因組結(jié)構(gòu)
2.2 黃毛紡蚋mtDNA基因的堿基組成
2.3 蛋白質(zhì)編碼基因分析
2.4 黃毛紡蚋線粒體基因組tRNA與rRNA結(jié)構(gòu)分析
2.5 非編碼區(qū)
3 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]五條蚋(Simulium quinquestriatum)不同地理種群遺傳多樣性的ISSR標(biāo)記研究[J]. 修江帆,張春林,陳漢彬. 生物技術(shù)通報. 2013(07)
[2]雙翅目昆蟲線粒體基因組結(jié)構(gòu)特點及其測序通用引物的設(shè)計和應(yīng)用[J]. 張乃心,張玉娟,余果,陳斌. 昆蟲學(xué)報. 2013(04)
[3]線粒體基因組數(shù)據(jù)的分析方法和軟件[J]. 李雪娟,楊婧,王俊紅,任倩俐,李霞,黃原. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2013(01)
[4]分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)[J]. 黃原. 遺傳. 2012(11)
[5]殘鍔線蛺蝶線粒體基因組全序列及其系統(tǒng)學(xué)意義(英文)[J]. 田麗麗,孫曉燕,陳梅,蓋永華,郝家勝,楊群. 動物學(xué)研究. 2012(02)
[6]福建省五條蚋和黃毛紡蚋nrDNA-ITS序列分析(雙翅目:蚋科)[J]. 王宇平,高博,張建慶,王光輝,黃恩炯. 寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2010 (01)
[7]3種吸血蚋酯酶同工酶的比較研究[J]. 高博,張建慶,蔡亨忠,王光輝,范建華,黃健群,黃恩炯,王宇平,張述鏗,王公東. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2009(02)
[8]江西九連山繩蚋一新種(雙翅目:蚋科)(英文)[J]. 康哲,張春林,陳漢彬. 寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2007(03)
[9]江西省蚋屬一新種(雙翅目,蚋科)(英文)[J]. 陳漢彬,康哲,張春林. 動物分類學(xué)報. 2007(03)
[10]五條蚋兩地理株多線染色體比較研究[J]. 溫小軍,韋靜,陳漢彬. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2007(03)
博士論文
[1]幾種入侵斑潛蠅線粒體全基因組序列分析及種群分化研究[D]. 王帥宇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]中國乳白蟻屬分類修訂研究[D]. 丁俊杰.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]蚋科昆蟲分類研究[D]. 蔡茹.安徽理工大學(xué) 2005
本文編號:3436261
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