關(guān)于AtNAC091膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的基因克隆以及逆境脅迫下的生物學(xué)功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-03 09:09
植植物遭受逆境會(huì)導(dǎo)致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中大量蛋白無(wú)法折疊或錯(cuò)誤折疊,從而引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫(ER stress),此時(shí)細(xì)胞會(huì)通過(guò)啟動(dòng)未折疊蛋白應(yīng)答途徑(unfolded protein response,UPR)幫助蛋白折疊以緩解脅迫,而在這個(gè)途徑中膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子(membrane-associated transcription factor,MTF)發(fā)揮極其重要的作用。擬南芥中,已研究出NAC家族中的062、089、103都參與到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑,通過(guò)調(diào)節(jié)下游基因來(lái)控制植物生命活動(dòng)。在本研究鑒定了一個(gè)質(zhì)膜相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子AtNAC091(也稱為TIP),在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫及其他非生物途徑中也起著重要作用。在本論文中,1)首先用qRT-PCR分析NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫下表達(dá)情況,確定NAC091受到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)上調(diào);2)NAC091受內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫上調(diào)依賴于bZIP60,同時(shí)發(fā)現(xiàn)NAC091啟動(dòng)子序列上有一段經(jīng)典的ERSE-I元件,該元件是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中的經(jīng)典元件,進(jìn)一步說(shuō)明NAC091參與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑;3)運(yùn)用酵母雙雜交及BiFC技術(shù),發(fā)現(xiàn)NAC091具有轉(zhuǎn)錄激活活性和形成同源二聚體;4)利用激光共聚焦顯...
【文章來(lái)源】:貴州師范大學(xué)貴州省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NAC蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Ookaetal.,2003)
353.1NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑作用下表達(dá)上調(diào)TM、DTT是能夠引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)發(fā)生脅迫的化學(xué)物質(zhì),通過(guò)添加其中的某一種來(lái)模擬內(nèi)質(zhì)網(wǎng)遭受脅迫的環(huán)境。為了判斷NAC091是否會(huì)參與到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中?首先分別用TM(5μg/mL)和DTT(2mM)對(duì)生長(zhǎng)10d的野生型擬南芥幼苗處理4h,并用DMSO處理的幼苗作為空白對(duì)照,然后分別對(duì)處理后的植株幼苗進(jìn)行RNA的提取,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用qRT-PCR檢測(cè)NAC091在不同處理下的表達(dá)差異(圖2),與對(duì)照組(DMSO)相比較NAC091在TM和DTT處理4h的樣品中,其表達(dá)量分別上調(diào)3.431和5.4倍,說(shuō)明NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中表達(dá)量能夠上調(diào)的。圖2NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑處理下的表達(dá)分析用5μg/mL的TM和2mM的DTT處理WT幼苗4h(實(shí)驗(yàn)組),以及用DMSO處理4h(對(duì)照組)后樣品進(jìn)行qRT-PCR分析,相對(duì)基因表達(dá)量是表達(dá)NAC091在處理樣品與未處理樣品中表達(dá)量的差異。樣品中NAC091表達(dá)量已通過(guò)Actin進(jìn)行校正,**P<0.01,*P<0.05。3.2NAC091的誘導(dǎo)表達(dá)受到bZIP60的直接調(diào)控?fù)?jù)目前已有的研究,在擬南芥中參與調(diào)控內(nèi)質(zhì)網(wǎng)未折疊應(yīng)答途徑中主要是bZIP28、bZIP60這兩條信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路;而且根據(jù)Sun、Yang等研究報(bào)道稱NAC家族中NAC103、NAC062啟動(dòng)子序列上存在的TCATCG順式元件能夠與bZIP60結(jié)合,進(jìn)一步說(shuō)明bZIP類轉(zhuǎn)錄因子會(huì)參與調(diào)控NAC蛋白的表達(dá)。為了分析出NAC091的表達(dá)上調(diào)與bZIP28、bZIP60之間是否存在關(guān)聯(lián),本論文中用bzip28、bzip60單突變體(Sunetal.,2013)和WT野生型10d的幼苗,用5μg/mL的TM對(duì)以上3種不同的樣品進(jìn)行處理4h,并用DMSO處理的幼苗作為空白對(duì)照,然后
36分別對(duì)處理后的植株幼苗進(jìn)行RNA的提取,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再利用qRT-PCR分析這3種不同樣品中NAC091的表達(dá)量。與對(duì)照進(jìn)行比較,TM處理后在WT植株中NAC091的表達(dá)量上調(diào)約5倍;而TM處理后在bzip28單突變體植株中NAC091的表達(dá)量還是有所上調(diào),只是其表達(dá)量與WT植株對(duì)比要低些,說(shuō)明敲除bZIP28對(duì)NAC091的表達(dá)無(wú)影響,也進(jìn)一步說(shuō)NAC091的表達(dá)不受bZIP28調(diào)控;而在bzip60單突變體植株中,TM處理后NAC091的表達(dá)量不上調(diào),且與DMSO對(duì)照組表達(dá)量相比毫無(wú)差異,說(shuō)明NAC091在TM處理下,其表達(dá)受到bZIP60敲除的影響,也證實(shí)了NAC091的表達(dá)是依賴于bZIP60調(diào)控的(圖3);同時(shí),對(duì)NAC091啟動(dòng)子序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)在該段序列上存在一個(gè)經(jīng)典的ERSE-Ⅰ元件CGAAT…CACG(圖4),以上實(shí)驗(yàn)充分說(shuō)明了NAC091能夠參與到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中來(lái),并且受到bZIP60的調(diào)控。圖3在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)下,WT、bzip28、bzip60中NAC091的表達(dá)用5μg/mL的TM(實(shí)驗(yàn)組)及相應(yīng)濃度的DMSO(對(duì)照組)處理WT野生型、bzip28、bzip60單突變體幼苗4h,然后對(duì)處理后的幼苗進(jìn)行RNA提娶逆轉(zhuǎn)錄成cDNA來(lái)進(jìn)行qRT-PCR分析,相對(duì)基因表達(dá)量是不同樣品中NAC091的表達(dá)差異。樣品中NAC091表達(dá)量已通過(guò)Actin進(jìn)行校正,**P<0.01,*P<0.05。圖4NAC091啟動(dòng)子序列上存在ERSE-Ⅰ元件
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子NAC103在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答中的抗性分析[J]. 孫玲,王曉蕾,張宇飛,孫衛(wèi)紅,劉建祥,宋澤婷. 分子植物育種. 2018(05)
[2]植物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答研究進(jìn)展[J]. 楊正婷,劉建祥. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(10)
[3]中國(guó)南方喀斯特生態(tài)系統(tǒng)面臨的問(wèn)題及對(duì)策[J]. 熊康寧,池永寬. 生態(tài)經(jīng)濟(jì). 2015(01)
[4]Transcriptional Regulation of Plant Secondary Metabolism[J]. Chang-Qing Yang 1,Xin Fang 1,Xiu-Ming Wu 1,Ying-Bo Mao 1,Ling-Jian Wang 1 and Xiao-Ya Chen 1,2 1 National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2 Plant Science Research Center,Shanghai Chenshan Botanical Garden,Shanghai 201602,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[5]喀斯特脆弱生態(tài)系統(tǒng)復(fù)合退化控制與重建模式[J]. 彭晚霞,王克林,宋同清,曾馥平,王久榮. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(02)
[6]Transcriptional, post-transcriptional and post-translational regulations of gene expression during leaf polarity formation[J]. Lin Xu Li YangHai Huang National Laboratory of Plant Molecular Genetics, Shanghai Institute of Plant Physiology and Ecology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, 300 Fenglin Road, Shanghai 200032, China. Cell Research. 2007(06)
[7]巖溶生態(tài)脆弱性研究[J]. 曾曉燕,牟瑞芳,許順國(guó). 環(huán)境科學(xué)與管理. 2006(01)
[8]貴州喀斯特石漠化地區(qū)土地利用方式對(duì)土壤質(zhì)量恢復(fù)能力的影響[J]. 龍健,鄧啟瓊,江新榮,李陽(yáng)兵,姚斌. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2005(12)
[9]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白的降解及其機(jī)制[J]. 齊靜,彭建新. 細(xì)胞生物學(xué)雜志. 2004(02)
[10]我國(guó)西南巖溶地區(qū)土地石漠化研究[J]. 李林立,況明生,蔣勇軍. 地域研究與開(kāi)發(fā). 2003(03)
本文編號(hào):3262286
【文章來(lái)源】:貴州師范大學(xué)貴州省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NAC蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Ookaetal.,2003)
353.1NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑作用下表達(dá)上調(diào)TM、DTT是能夠引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)發(fā)生脅迫的化學(xué)物質(zhì),通過(guò)添加其中的某一種來(lái)模擬內(nèi)質(zhì)網(wǎng)遭受脅迫的環(huán)境。為了判斷NAC091是否會(huì)參與到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中?首先分別用TM(5μg/mL)和DTT(2mM)對(duì)生長(zhǎng)10d的野生型擬南芥幼苗處理4h,并用DMSO處理的幼苗作為空白對(duì)照,然后分別對(duì)處理后的植株幼苗進(jìn)行RNA的提取,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用qRT-PCR檢測(cè)NAC091在不同處理下的表達(dá)差異(圖2),與對(duì)照組(DMSO)相比較NAC091在TM和DTT處理4h的樣品中,其表達(dá)量分別上調(diào)3.431和5.4倍,說(shuō)明NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中表達(dá)量能夠上調(diào)的。圖2NAC091在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑處理下的表達(dá)分析用5μg/mL的TM和2mM的DTT處理WT幼苗4h(實(shí)驗(yàn)組),以及用DMSO處理4h(對(duì)照組)后樣品進(jìn)行qRT-PCR分析,相對(duì)基因表達(dá)量是表達(dá)NAC091在處理樣品與未處理樣品中表達(dá)量的差異。樣品中NAC091表達(dá)量已通過(guò)Actin進(jìn)行校正,**P<0.01,*P<0.05。3.2NAC091的誘導(dǎo)表達(dá)受到bZIP60的直接調(diào)控?fù)?jù)目前已有的研究,在擬南芥中參與調(diào)控內(nèi)質(zhì)網(wǎng)未折疊應(yīng)答途徑中主要是bZIP28、bZIP60這兩條信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路;而且根據(jù)Sun、Yang等研究報(bào)道稱NAC家族中NAC103、NAC062啟動(dòng)子序列上存在的TCATCG順式元件能夠與bZIP60結(jié)合,進(jìn)一步說(shuō)明bZIP類轉(zhuǎn)錄因子會(huì)參與調(diào)控NAC蛋白的表達(dá)。為了分析出NAC091的表達(dá)上調(diào)與bZIP28、bZIP60之間是否存在關(guān)聯(lián),本論文中用bzip28、bzip60單突變體(Sunetal.,2013)和WT野生型10d的幼苗,用5μg/mL的TM對(duì)以上3種不同的樣品進(jìn)行處理4h,并用DMSO處理的幼苗作為空白對(duì)照,然后
36分別對(duì)處理后的植株幼苗進(jìn)行RNA的提取,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再利用qRT-PCR分析這3種不同樣品中NAC091的表達(dá)量。與對(duì)照進(jìn)行比較,TM處理后在WT植株中NAC091的表達(dá)量上調(diào)約5倍;而TM處理后在bzip28單突變體植株中NAC091的表達(dá)量還是有所上調(diào),只是其表達(dá)量與WT植株對(duì)比要低些,說(shuō)明敲除bZIP28對(duì)NAC091的表達(dá)無(wú)影響,也進(jìn)一步說(shuō)NAC091的表達(dá)不受bZIP28調(diào)控;而在bzip60單突變體植株中,TM處理后NAC091的表達(dá)量不上調(diào),且與DMSO對(duì)照組表達(dá)量相比毫無(wú)差異,說(shuō)明NAC091在TM處理下,其表達(dá)受到bZIP60敲除的影響,也證實(shí)了NAC091的表達(dá)是依賴于bZIP60調(diào)控的(圖3);同時(shí),對(duì)NAC091啟動(dòng)子序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)在該段序列上存在一個(gè)經(jīng)典的ERSE-Ⅰ元件CGAAT…CACG(圖4),以上實(shí)驗(yàn)充分說(shuō)明了NAC091能夠參與到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑中來(lái),并且受到bZIP60的調(diào)控。圖3在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)下,WT、bzip28、bzip60中NAC091的表達(dá)用5μg/mL的TM(實(shí)驗(yàn)組)及相應(yīng)濃度的DMSO(對(duì)照組)處理WT野生型、bzip28、bzip60單突變體幼苗4h,然后對(duì)處理后的幼苗進(jìn)行RNA提娶逆轉(zhuǎn)錄成cDNA來(lái)進(jìn)行qRT-PCR分析,相對(duì)基因表達(dá)量是不同樣品中NAC091的表達(dá)差異。樣品中NAC091表達(dá)量已通過(guò)Actin進(jìn)行校正,**P<0.01,*P<0.05。圖4NAC091啟動(dòng)子序列上存在ERSE-Ⅰ元件
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子NAC103在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答中的抗性分析[J]. 孫玲,王曉蕾,張宇飛,孫衛(wèi)紅,劉建祥,宋澤婷. 分子植物育種. 2018(05)
[2]植物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答研究進(jìn)展[J]. 楊正婷,劉建祥. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(10)
[3]中國(guó)南方喀斯特生態(tài)系統(tǒng)面臨的問(wèn)題及對(duì)策[J]. 熊康寧,池永寬. 生態(tài)經(jīng)濟(jì). 2015(01)
[4]Transcriptional Regulation of Plant Secondary Metabolism[J]. Chang-Qing Yang 1,Xin Fang 1,Xiu-Ming Wu 1,Ying-Bo Mao 1,Ling-Jian Wang 1 and Xiao-Ya Chen 1,2 1 National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2 Plant Science Research Center,Shanghai Chenshan Botanical Garden,Shanghai 201602,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[5]喀斯特脆弱生態(tài)系統(tǒng)復(fù)合退化控制與重建模式[J]. 彭晚霞,王克林,宋同清,曾馥平,王久榮. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(02)
[6]Transcriptional, post-transcriptional and post-translational regulations of gene expression during leaf polarity formation[J]. Lin Xu Li YangHai Huang National Laboratory of Plant Molecular Genetics, Shanghai Institute of Plant Physiology and Ecology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, 300 Fenglin Road, Shanghai 200032, China. Cell Research. 2007(06)
[7]巖溶生態(tài)脆弱性研究[J]. 曾曉燕,牟瑞芳,許順國(guó). 環(huán)境科學(xué)與管理. 2006(01)
[8]貴州喀斯特石漠化地區(qū)土地利用方式對(duì)土壤質(zhì)量恢復(fù)能力的影響[J]. 龍健,鄧啟瓊,江新榮,李陽(yáng)兵,姚斌. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2005(12)
[9]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白的降解及其機(jī)制[J]. 齊靜,彭建新. 細(xì)胞生物學(xué)雜志. 2004(02)
[10]我國(guó)西南巖溶地區(qū)土地石漠化研究[J]. 李林立,況明生,蔣勇軍. 地域研究與開(kāi)發(fā). 2003(03)
本文編號(hào):3262286
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