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突觸粘附分子編碼基因NRXN轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制研究

發(fā)布時間:2021-06-17 15:00
  目的:本研究的目的是探索是否存在新的NRXN基因的轉(zhuǎn)錄本,分析NRXN基因相關(guān)的啟動子功能區(qū)域,以探究突觸粘附分子編碼基因NRXN的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制。方法:通過對NRXN3基因7個轉(zhuǎn)錄本的序列和蛋白結(jié)構(gòu)域比對分析,以及PCR擴增特異的外顯子區(qū)域確定NRXN3基因新型轉(zhuǎn)錄本。通過構(gòu)建熒光素酶報告質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染細胞并檢測熒光素酶活性確定NRXN3δ和NRXN2α啟動子活性區(qū)域,在構(gòu)建的啟動子報告基因質(zhì)粒的基礎(chǔ)上對DNA序列進行進一步刪切和點突變鑒定功能區(qū)域和順式作用元件。通過對核心啟動子區(qū)域進行序列分析和查詢dbTSS數(shù)據(jù)庫分析典型和非典型的核心啟動子元件。結(jié)果:對NRXN3基因的分析,我們發(fā)現(xiàn)了從未報道過的人類NRXN3基因的第三種獨特的轉(zhuǎn)錄本,命名為δ-NRXN3。我們進一步鑒定了δ-NRXN3的最強啟動子活性區(qū)域,最小啟動子區(qū)域和具有基礎(chǔ)活性的核心啟動子區(qū)域以及三個NRXN3δ基因正向調(diào)控功能區(qū)域和四個負向調(diào)控功能區(qū)域。此外,我們在NRXN3δ基因的核心啟動子區(qū)域中鑒定了兩個非典型的核心啟動子元件和典型的Inr基序。對NRXN2α基因的啟動子分析,我們確定了NRXN2α基因的啟動子活性區(qū)域和... 

【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

突觸粘附分子編碼基因NRXN轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制研究


SignalP5.0neurexins蛋白信號肽預測結(jié)果

示意圖,突觸,相互作用,分子


重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文67并非都是常規(guī)的“一對一”模式。根據(jù)是否參與突觸以外功能可以將突觸細胞粘附分子分成以突觸功能為主的粘附分子(例如neurexins和neuroligins)和非突觸功能為主粘附分子(例如dystroglycan,teneurins或LAR型PTPR)。部分突觸細胞粘附分子也可能參與大腦的發(fā)育,特別是神經(jīng)元的遷移(例如MDGA和FLRT)[21]。圖1跨突觸分子相互作用網(wǎng)絡(luò)示意圖Figure1.Schematicdiagrammolecularnetworkoftrans-synapticinteractionNeurexins基因和蛋白結(jié)構(gòu)Neurexins是特異性表達于神經(jīng)元表面的跨膜蛋白,在哺乳動物中由3個非連鎖的基因組成,分別為NRXN1、NRXN2、NRXN3,其中NRXN1和NRXN3是已知人類基因中分子量最大的基因,在人類基因組中的大小分別為1.1Mb和1.7Mb,覆蓋整個人類基因組近0.1%,而NRXN2相對較小,僅有110kb。NRXN1和NRXN2

示意圖,家族,基因,位點


重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文69圖2Neurexins家族基因結(jié)構(gòu)示意圖Figure2.SchematicdiagramofthegenestructureoftheNeurexins圖3Neurexins家族蛋白結(jié)構(gòu)域以及剪切位點示意圖Figure3.SchematicdiagramofneurexinsproteindomainsandalternativesplicingsitesNeurexins的可變剪切與分子多樣性Neurexins經(jīng)6個經(jīng)典的剪切位點選擇性剪切生成數(shù)千種亞型,其中α-NRXN包含剪切位點SS#1-SS#6,β-NRXN包含剪切點SS#4和SS#5,而γ-NRXN1包含剪切點SS#5[26,27](圖3)。不同的亞型在大腦的不同部位表達不同,對于確定的神經(jīng)元和確定的剪切位點,neurexin的可變剪切通常是連續(xù)進行的,并非為“全或無”的模式。不同類型的神經(jīng)元對于確定的剪切位點表達的mRNA不同,可能包括或不包括相應的剪切位點[28]。Neurexins家族三個基因NRXN1,NRXN2和NRXN3在大

【參考文獻】:
期刊論文
[1]48孔板熒光素酶報告基因?qū)嶒炦吘壭猍J]. 廖丹,徐云飛,孟莎莎,周衛(wèi)輝.  基因組學與應用生物學. 2018(09)



本文編號:3235416

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