神經(jīng)肌肉接頭（NMJ）是一種外周膽堿能化學(xué)突觸,主要由三種細(xì)胞組成:運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元,肌纖維和雪旺氏膠質(zhì)細(xì)胞。NMJ發(fā)育和損傷后修復(fù)的過程是一個(gè)復(fù)雜且精細(xì)的多分子參與調(diào)控過程。為研究NMJ發(fā)育、成熟和再生過程中基因的表達(dá)變化,本課題建立了三種研究模型:（1）C2C12肌細(xì)胞分化成肌管細(xì)胞和AGRIN蛋白刺激肌管細(xì)胞模擬突觸后膜形成ACHR聚集簇的模型;（2）生理狀態(tài)下,新生和成年小鼠膈肌表面NMJ突觸區(qū)和非突觸區(qū)發(fā)育的模型;（3）小鼠臂叢神經(jīng)去支配損傷后的肌肉組織的NMJ損傷修復(fù)再生模型�；谶@三種模型,利用Illumina深度測序法,對三種模型的基因表達(dá)水平進(jìn)行差異統(tǒng)計(jì)和比對分析。對統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量評估,發(fā)現(xiàn)樣品的Clean reads、測序飽和度和mRNA打斷的隨機(jī)程度都符合要求。對符合要求的統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行比對,并且對差異基因進(jìn)行Gene Ontology和KEGG pathway分析。根據(jù)上述分析,對差異基因的細(xì)胞組成、參與的生物過程、發(fā)揮的分子功能和主要參與的信號通路進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)。統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)各個(gè)樣品中差異基因主要細(xì)胞組成是細(xì)胞膜、細(xì)胞器和胞外基質(zhì)等;主要參與的生物過程是細(xì)胞基礎(chǔ)代謝、細(xì)胞黏... 

【文章來源】：青島科技大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞
第一章 前言
    1.1 神經(jīng)肌肉接頭（NMJ）
        1.1.1 NMJ的基本概念
        1.1.2 NMJ發(fā)育初期
        1.1.3 NMJ的成熟及其調(diào)控過程
    1.2 深度測序
        1.2.1 深度測序的基本概念
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄組的深度測序
        1.2.3 深度測序結(jié)果
        1.2.4 測序數(shù)據(jù)及處理方法
        1.2.5 深度測序數(shù)據(jù)分析方法
    1.3 研究的目的與意義
第二章 NMJ發(fā)育與再生相關(guān)實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ偷慕?br>    2.1 建立C2C12細(xì)胞誘導(dǎo)分化和ACHR聚集體外模型
        2.1.1 材料與方法
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.2 不同發(fā)育階段小鼠膈肌NMJ模型的建立
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2.2 建立實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ?br>    2.3 建立小鼠臂叢神經(jīng)去神經(jīng)支配損傷與再生模型
        2.3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.3.2 建立實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ?br>第三章 利用深度測序方法挖掘NMJ發(fā)育與再生相關(guān)基因
    3.1 實(shí)驗(yàn)操作方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)方法
        3.1.3 深度測序
    3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.2.1 樣本總RNA提取質(zhì)量
        3.2.2 測序質(zhì)量評估
        3.2.3 差異基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)
        3.2.4 差異基因GO分析
        3.2.5 差異基因的KEGG pathway分析
第四章 NMJ發(fā)育和再生相關(guān)潛在重要基因的挖掘
    4.1 乙酰膽堿受體，乙酰膽堿酯酶和Musk基因的表達(dá)差異
    4.2 WNT和TGF-β信號的表達(dá)差異基因
    4.3 MicroRNA表達(dá)差異基因
    4.4 細(xì)胞黏附信號相關(guān)表達(dá)差異基因
    4.5 細(xì)胞外基質(zhì)表達(dá)差異基因
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]WISP-1——開辟探究腫瘤形成發(fā)展的新途徑[J]. 孫海濤,高雅,唐瓊蘭,文彬,蔣學(xué)風(fēng).  醫(yī)學(xué)綜述. 2008(15)
[2]C2C12成肌細(xì)胞體外誘導(dǎo)分化為肌管的實(shí)驗(yàn)[J]. 陳永樂,周光前,鄧宇斌,智偉,謝彗琪,鄧力,楊志明,王亞柱.  中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2008(01)



本文編號：3159557