沙門菌噬菌體YSP2尾絲蛋白鑒定及功能研究
發(fā)布時間:2021-04-15 04:37
雞白痢沙門菌(Salmonella pullorum)是一種常見的禽類病原菌,可引起雛雞關(guān)節(jié)炎、腹瀉和食欲不振等一些急性系統(tǒng)性疾病,可以通過雞胚垂直傳播,還會通過糞便和飲用水經(jīng)消化道和呼吸道水平傳播。感染雞白痢沙門菌會導(dǎo)致雞的生產(chǎn)性能下降,明顯降低種蛋孵化率,或引起雞群的大規(guī)模發(fā)病和死亡,嚴(yán)重影響畜禽健康,造成重大經(jīng)濟損失。沙門菌是我國農(nóng)業(yè)部要求重點監(jiān)測的14種動物疫病病原菌之一,所有種畜禽場必須凈化。而且在食品安全方面,所有涉及的食品現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)中,均不得檢出沙門菌,這也使沙門菌的凈化不僅僅涉及畜禽養(yǎng)殖行業(yè),更關(guān)乎食品安全和公共衛(wèi)生安全。近年來由于抗生素的濫用,雞白痢沙門菌已經(jīng)對多種抗生素產(chǎn)生耐藥性,日益成為影響家禽養(yǎng)殖業(yè)和公共衛(wèi)生安全的重要病原菌,嚴(yán)重制約養(yǎng)禽業(yè)的發(fā)展,影響公共衛(wèi)生安全。噬菌體作為一類能特異性識別裂解病原微生物的一種病毒,可利用其宿主特異性對特定微生物進行檢測。尾絲蛋白是噬菌體特異性識別宿主的物質(zhì)基礎(chǔ),篩選表達(dá)出噬菌體的尾絲蛋白在特定微生物檢測凈化等方面具有重要意義。本實驗對噬菌體YSP2進行純化濃縮后,使用蛋白質(zhì)多肽分子鑒定技術(shù)對其進行全蛋白質(zhì)譜分析,結(jié)果得到52個蛋...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
密度梯度離心后的噬菌體YSP2Fig.1-1BacteriophageYSP2afterdensitygradientcentrifugation
第二篇研究內(nèi)容第一章噬菌體YSP2的總蛋白質(zhì)譜分析及尾絲蛋白分析19菌屬的噬菌體具有極大相似性;而Chaperonin只與氨基酸數(shù)據(jù)庫中的噬纖維菌屬噬菌體具有相似性;Galactose-1-phosphateuridylyltransferase的確定則來自數(shù)據(jù)庫中的乳酸菌噬菌體。圖1-2噬菌體YSP2蛋白質(zhì)譜基峰Fig.1-2BasepeakofphageYSP2proteinspectrum
第二篇研究內(nèi)容第一章噬菌體YSP2的總蛋白質(zhì)譜分析及尾絲蛋白分析201.3.3尾絲蛋白氨基酸比對分析實驗前期根據(jù)噬菌體全基因測序結(jié)果,擴增ORF35、ORF44兩段假定尾絲蛋白基因,構(gòu)建原核表達(dá)載體,并驗證成功后構(gòu)建重組表達(dá)菌株,ORF35、ORF44理論擴增片段大小分別為2409bp、3777bp,電泳結(jié)果如圖1-3所示,條帶大小符合預(yù)期;之后經(jīng)過連接轉(zhuǎn)化后用BamHI、XhoⅠ酶切鑒定、PCR擴增驗證,酶切理論片段大小約為5329bp和2409bp、3777bp,酶切驗證電泳結(jié)果如圖1-4所示,PCR擴增驗證結(jié)果如圖1-5所示,條帶大小符合預(yù)期。但是在探究蛋白表達(dá)條件的實驗中一直沒能成功表達(dá)尾絲蛋白,在對基因片段進一步分析后,對比數(shù)據(jù)庫中相應(yīng)的氨基酸的功能,選擇了長度為1503bp的ORF35的截短片段35Q(圖1-6),并進行后續(xù)實驗。通過比對分析可知,35q可能為噬菌體YSP2的尾絲蛋白基因序列,該尾絲蛋白含有500個氨基酸,大約為55KDa。35Q與沙門菌噬菌體phaSE-2尾絲蛋白,沙門菌噬菌體vB_SenS_PHB07尾絲蛋白和檸檬酸桿菌噬菌體CF1DK-2017尾絲蛋白的同源性分別為83.40%,61.20%和60.40%(見圖1-7)。圖1-3ORF35、ORF44PCR擴增結(jié)果Fig.1-3ORF35,ORF44PCRamplificationproducts1:ORF35PCR擴增產(chǎn)物;2:ORF44PCR擴增產(chǎn)物;M:DL5000DNAmarker
【參考文獻】:
期刊論文
[1]一株山羊源腸炎沙門氏菌對小鼠的致病性研究[J]. 譚爍,馮帆,陳極奎,湯承,岳華. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(13)
[2]利用蛋白質(zhì)組技術(shù)快速鑒定噬菌體結(jié)構(gòu)蛋白[J]. 趙飛揚,邢少貞,孫強,裴廣倩,米志強,安小平,童貽剛,任慧英. 中國抗生素雜志. 2017(09)
[3]雞白痢沙門菌研究進展[J]. 殷俊磊,李求春,耿士忠,潘志明,焦新安. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2016(09)
[4]全球禽肉生產(chǎn)和貿(mào)易中的沙門菌風(fēng)險評估與控制[J]. G.Mead,A.M.Lammerding,N.Cox,M.P.Doyle,F.Humbert,A.Kulikocskiy,A.Panin,V.P.do Nascimento,M.Wierup. 中國家禽. 2011(05)
[5]解決沙門氏菌困擾養(yǎng)禽業(yè)的技術(shù)途徑[J]. 包啟明,劉文奎. 中國家禽. 2002(09)
碩士論文
[1]雞白痢沙門菌噬菌體裂解酶LySP2在畢赤酵母中的表達(dá)及其初步應(yīng)用[D]. 張楸楊.吉林大學(xué) 2018
[2]雞白痢沙門菌噬菌體的分離鑒定及其初步應(yīng)用[D]. 袁玉玉.吉林大學(xué) 2016
本文編號:3138682
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
密度梯度離心后的噬菌體YSP2Fig.1-1BacteriophageYSP2afterdensitygradientcentrifugation
第二篇研究內(nèi)容第一章噬菌體YSP2的總蛋白質(zhì)譜分析及尾絲蛋白分析19菌屬的噬菌體具有極大相似性;而Chaperonin只與氨基酸數(shù)據(jù)庫中的噬纖維菌屬噬菌體具有相似性;Galactose-1-phosphateuridylyltransferase的確定則來自數(shù)據(jù)庫中的乳酸菌噬菌體。圖1-2噬菌體YSP2蛋白質(zhì)譜基峰Fig.1-2BasepeakofphageYSP2proteinspectrum
第二篇研究內(nèi)容第一章噬菌體YSP2的總蛋白質(zhì)譜分析及尾絲蛋白分析201.3.3尾絲蛋白氨基酸比對分析實驗前期根據(jù)噬菌體全基因測序結(jié)果,擴增ORF35、ORF44兩段假定尾絲蛋白基因,構(gòu)建原核表達(dá)載體,并驗證成功后構(gòu)建重組表達(dá)菌株,ORF35、ORF44理論擴增片段大小分別為2409bp、3777bp,電泳結(jié)果如圖1-3所示,條帶大小符合預(yù)期;之后經(jīng)過連接轉(zhuǎn)化后用BamHI、XhoⅠ酶切鑒定、PCR擴增驗證,酶切理論片段大小約為5329bp和2409bp、3777bp,酶切驗證電泳結(jié)果如圖1-4所示,PCR擴增驗證結(jié)果如圖1-5所示,條帶大小符合預(yù)期。但是在探究蛋白表達(dá)條件的實驗中一直沒能成功表達(dá)尾絲蛋白,在對基因片段進一步分析后,對比數(shù)據(jù)庫中相應(yīng)的氨基酸的功能,選擇了長度為1503bp的ORF35的截短片段35Q(圖1-6),并進行后續(xù)實驗。通過比對分析可知,35q可能為噬菌體YSP2的尾絲蛋白基因序列,該尾絲蛋白含有500個氨基酸,大約為55KDa。35Q與沙門菌噬菌體phaSE-2尾絲蛋白,沙門菌噬菌體vB_SenS_PHB07尾絲蛋白和檸檬酸桿菌噬菌體CF1DK-2017尾絲蛋白的同源性分別為83.40%,61.20%和60.40%(見圖1-7)。圖1-3ORF35、ORF44PCR擴增結(jié)果Fig.1-3ORF35,ORF44PCRamplificationproducts1:ORF35PCR擴增產(chǎn)物;2:ORF44PCR擴增產(chǎn)物;M:DL5000DNAmarker
【參考文獻】:
期刊論文
[1]一株山羊源腸炎沙門氏菌對小鼠的致病性研究[J]. 譚爍,馮帆,陳極奎,湯承,岳華. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(13)
[2]利用蛋白質(zhì)組技術(shù)快速鑒定噬菌體結(jié)構(gòu)蛋白[J]. 趙飛揚,邢少貞,孫強,裴廣倩,米志強,安小平,童貽剛,任慧英. 中國抗生素雜志. 2017(09)
[3]雞白痢沙門菌研究進展[J]. 殷俊磊,李求春,耿士忠,潘志明,焦新安. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2016(09)
[4]全球禽肉生產(chǎn)和貿(mào)易中的沙門菌風(fēng)險評估與控制[J]. G.Mead,A.M.Lammerding,N.Cox,M.P.Doyle,F.Humbert,A.Kulikocskiy,A.Panin,V.P.do Nascimento,M.Wierup. 中國家禽. 2011(05)
[5]解決沙門氏菌困擾養(yǎng)禽業(yè)的技術(shù)途徑[J]. 包啟明,劉文奎. 中國家禽. 2002(09)
碩士論文
[1]雞白痢沙門菌噬菌體裂解酶LySP2在畢赤酵母中的表達(dá)及其初步應(yīng)用[D]. 張楸楊.吉林大學(xué) 2018
[2]雞白痢沙門菌噬菌體的分離鑒定及其初步應(yīng)用[D]. 袁玉玉.吉林大學(xué) 2016
本文編號:3138682
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