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SRC3蛋白純化和結(jié)構(gòu)解析

發(fā)布時(shí)間:2021-04-12 14:16
  作為細(xì)胞核激素受體的核心轉(zhuǎn)錄共激活因子,p160家族的三個(gè)同源成員蛋白(SRC1,SRC2和SRC3)中的SRC1(NCOA1)在1995被發(fā)現(xiàn),之后SRC2(也稱TIF2,GRIP1或NCOA2)和SRC3(也稱P/CIP,RAC3,AIB1,ACTR,TRAM1或NCOA3)相繼被發(fā)現(xiàn)。大量的文獻(xiàn)報(bào)道SRCs家族成員不僅是細(xì)胞核激素受體的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄共激活因子,還廣泛參與其它轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,此外SRC3還在癌癥中扮演重要的作用。SRC3以及SRC1在1997年被報(bào)道具有乙;揎椕富钚,但之后關(guān)于這兩者的酶活真實(shí)性科學(xué)界一直存在爭(zhēng)議,且后續(xù)沒有SRC3蛋白本身以及關(guān)于其酶活的結(jié)構(gòu)信息報(bào)道。我們想通過解析SRC3蛋白結(jié)構(gòu)為SRC3的相關(guān)研究提供結(jié)構(gòu)依據(jù)并為其是否具有乙;富钐峁┙Y(jié)構(gòu)信息。另外,解析SRC3的結(jié)構(gòu)可以為開發(fā)針對(duì)SRC3的小分子抑制劑,用于今后SRC3相關(guān)癌癥的臨床治療提供幫助。為了獲得結(jié)構(gòu)研究所需的大量SRC3蛋白,我們首先選擇使用最簡(jiǎn)單、快速且成本較低的大腸桿菌系統(tǒng)進(jìn)行不同的SRC3截短體蛋白的表達(dá)和分離純化,但發(fā)現(xiàn)SRC3在大腸桿菌系統(tǒng)表達(dá)很低,即便我們進(jìn)行了不同... 

【文章來源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:107 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

SRC3蛋白純化和結(jié)構(gòu)解析


Waddington的古典表觀遺傳景觀[4]1957年ConradWaddington提出了表觀遺傳學(xué)概念,以代表細(xì)胞決策的過程

閱讀器,擦除,蛋白


21.2組蛋白修飾1.2.1組蛋白修飾類型與功能組蛋白是染色體的重要組成部分,染色體由DNA、組蛋白以及非組蛋白幾部分構(gòu)成,染色體的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體,核小體是2分子H2A、H2B、H3以及H4組成組蛋白八聚體并由147bpDNA分子纏繞形成。每分子核小體八聚體之間由鉸鏈核酸和一分子H1組蛋白連接形成染色質(zhì),染色質(zhì)繼續(xù)折疊固縮形成染色體。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)中組蛋白尾巴裸漏在外,其可以發(fā)生多種組蛋白修飾。近年來隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,以芝加哥大學(xué)趙英明教授實(shí)驗(yàn)室為首,先后鑒定了包括丙;□;投辊;,棕櫚;樗峄刃滦偷鞍踪|(zhì)翻譯后修飾(post-translationalmodification,PTM)[5-7]。組蛋白尾巴上含有多個(gè)可以修飾的氨基酸,其中經(jīng)典的修飾發(fā)生在以精氨酸、賴氨酸為主的氨基酸上。多發(fā)生包括甲基化、ADP-核糖基化、泛素化、磷酸化、糖基化,以及其他酰基化修飾。大量的文獻(xiàn)報(bào)道集中在酰化修飾、甲基化以及磷酸化修飾,科學(xué)界普遍認(rèn)為這些組蛋白修飾在很大程度上決定了染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)和開放狀態(tài)。近年的科研發(fā)現(xiàn)了很多修飾相關(guān)酶,這些酶負(fù)責(zé)“書寫”和“擦除”表觀遺傳標(biāo)記。下面我們將對(duì)其中部分修飾進(jìn)行介紹。圖1.2.1a組蛋白H3表觀修飾的“書寫器”、“閱讀器”和“擦除器”[8]。左側(cè)標(biāo)出翻譯后修飾(PTM)的組蛋白H3尾部賴氨酸殘基。陰影塊指示為遠(yuǎn)端增強(qiáng)子的長(zhǎng)度。綠色表示甲基化,藍(lán)色表示活性基因相關(guān)的組蛋白乙;瘶(biāo)記,紅色表示沉默的基因。右側(cè)列出了一些相關(guān)酶。

甲基化,蛋白,機(jī)制


華東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文3組蛋白甲基化修飾無疑是表觀遺傳學(xué)的一大熱土。近年來科學(xué)家在組蛋白甲基化修飾領(lǐng)域投入了大量資源,該領(lǐng)域也已發(fā)表眾多科研成果,細(xì)數(shù)組蛋白甲基化研究歷程我們會(huì)發(fā)現(xiàn)早在1960年RNA的合成即被證明受到了組蛋白中氨基的甲基化調(diào)節(jié)[9,10],但是直到2000年,才發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)組蛋白KMT,即人源SUV39H1(KMT1A),該工作由ThomasJenuwein和他的同事完成,并證明該酶從酵母到人具有高度保守性[11]。由于KMT1A的發(fā)現(xiàn),后續(xù)根據(jù)SET結(jié)構(gòu)域的同源性搜索,Dillon等人先后確定了數(shù)十種KMT[12]。另外,除了含有SET結(jié)構(gòu)域的甲基轉(zhuǎn)移酶之外,還有一類組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶不含有SET結(jié)構(gòu)域即KMT4,但兩種類型甲基轉(zhuǎn)移酶具有一個(gè)共同點(diǎn)即是都以S-腺苷-甲硫氨酸(SAM)作為甲基供體[12-15]。甲基化修飾具體分為以下幾種類型,圖1.2.1b組蛋白甲基化普遍機(jī)制[16]。其中賴氨酸上可以發(fā)生單甲基、二甲基、三甲基化,精氨酸上可以發(fā)生單甲基化、對(duì)稱二甲基化和非對(duì)稱二甲基化,另外據(jù)報(bào)道組蛋白也可以發(fā)生單甲基化修飾[10,17-20],F(xiàn)今為止,研究最為廣泛的甲基化位點(diǎn)包括賴氨酸的H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79以及H4K20和精氨酸的H3R2、H3R8、H3R17、H3R26、H4R3。回首過去,很長(zhǎng)一段時(shí)間科學(xué)界認(rèn)為組蛋白甲基化修飾是一種不可逆的修飾,直到H3K4去甲基化酶KDM1(LSD1)的發(fā)現(xiàn)證明了組蛋白甲基化修飾為可逆的修飾類型[21]。按照該研究的思路,現(xiàn)如今已發(fā)現(xiàn)一大批甲基轉(zhuǎn)移酶和組蛋白去甲基化酶,他們分別識(shí)別不同的底物,作用在不同的甲基化位點(diǎn)履行著去除甲基的功能[22]。但是值得注意的是組蛋白上的甲基化標(biāo)記并不孤立存在。同一組蛋白

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SRC-3/AIB1:transcriptional coactivator in oncogenesis[J]. Sophia Y TSAI,Ming-jer TSAI.  Acta Pharmacologica Sinica. 2006(04)



本文編號(hào):3133444

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