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DTMUV非編碼亞基因組RNA的鑒定及其影響病毒致病性的分子機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2021-02-11 14:03
  鴨坦布蘇病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)在感染鴨后可導(dǎo)致鴨生產(chǎn)性能下降,病程后期可引起典型的神經(jīng)癥狀,嚴(yán)重情況下可導(dǎo)致發(fā)病動(dòng)物死亡,這給我國(guó)養(yǎng)鴨業(yè)帶來(lái)嚴(yán)重的危害,此外,國(guó)內(nèi)外已多次報(bào)導(dǎo)坦布蘇病毒感染人的事件,這同樣給我國(guó)公共衛(wèi)生安全帶來(lái)一定的挑戰(zhàn)。坦布蘇病毒粒子包含囊膜,其基因組長(zhǎng)度大約為11 kb,只含有一個(gè)開放閱讀框,該閱讀框可編碼3種結(jié)構(gòu)蛋白和7種非結(jié)構(gòu)蛋白;此外,在開放閱讀框的5’和3’端各包含一個(gè)非編碼區(qū),其中5’端非編碼區(qū)由94個(gè)核苷酸組成,而3’端非編碼區(qū)由618個(gè)核苷酸組成,兩個(gè)非編碼區(qū)雖然不被編碼成病毒蛋白,但卻有著豐富的生物學(xué)功能,兩者在病毒基因組的復(fù)制及翻譯等過(guò)程中發(fā)揮調(diào)控作用。研究表明,某些黃病毒在復(fù)制過(guò)程中,隨著病毒基因組的不斷復(fù)制,基因組的3’非編碼區(qū)會(huì)產(chǎn)生一些長(zhǎng)度約為0.3-0.5 kb的亞基因組RNA(subgenomic RNA,sgRNA),這類RNA具有豐富多樣的生物學(xué)功能。sgRNA的積累是黃病毒屬病毒特有的一個(gè)現(xiàn)象,該類產(chǎn)物的形成往往是由病毒基因組3’UTR(Untranslated region,UTR)自身保守的高級(jí)... 

【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

DTMUV非編碼亞基因組RNA的鑒定及其影響病毒致病性的分子機(jī)制研究


TMUV病毒粒子結(jié)構(gòu)圖(引自陳浩,2015)

結(jié)構(gòu)圖,病毒,基因組,結(jié)構(gòu)圖


polyA尾巴。開放閱讀框兩端存在高度保守的非編碼區(qū)(Untranslatedregions,UTR),其中5’端非編碼區(qū)長(zhǎng)度為94nt,3’非編碼區(qū)長(zhǎng)度為618nt(Westawayetal.,1985;NakayamaandTakasaki,1999;陳浩,2015)。1.1.3坦布蘇病毒的蛋白結(jié)構(gòu)和功能坦布蘇病毒唯一的一個(gè)開放閱讀框只編碼一個(gè)多聚蛋白,該多聚蛋白包含3425個(gè)氨基酸殘基,后經(jīng)病毒絲氨酸蛋白酶和宿主信號(hào)肽酶水解為10個(gè)蛋白片段,其中包含3種結(jié)構(gòu)蛋白(C,prM/M和E)和7種非結(jié)構(gòu)蛋白(NS1,NS2A,NS2B,NS3,NS4A,NS4B以及NS5)(如圖1-2)(王振忠,2018;陳浩,2015)。圖1-2TMUV病毒基因組結(jié)構(gòu)圖(引自張秋艷,2019)Fig1-2OrganizationoftheTMUVgenomeandexpressionofproteinsC蛋白相對(duì)保守,大小約為12KDa,它是由大分子前體蛋白在粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上經(jīng)酶加工而成,C蛋白包含大量堿性氨基酸,約占總量24%(潘異哲,2014)。衣殼蛋白是病毒核衣殼組裝過(guò)程中的重要原件,并且C蛋白通過(guò)與病毒RNA組裝成核衣殼顆粒,以此保護(hù)病毒核酸不被RNA酶降解或者免受其他外界因素的破壞,除此以外,它還可以誘導(dǎo)體液免疫和細(xì)胞免疫(BykandGamarnik,2016)。一般情況下,這些C蛋白分散于脂滴周圍,在病毒感染后的早期可與脂滴發(fā)生作用,研究發(fā)現(xiàn)這一過(guò)程極有可能與基因組的包被有關(guān),在某些細(xì)胞中,基因組翻譯時(shí)起始密碼的選擇可由C蛋白編碼序列中的cHP結(jié)構(gòu)介導(dǎo),而這在病毒復(fù)制過(guò)程是十分重要的(OliveiraEdsonRAetal.,2017;SamsaMarceloMetal.,2009)。prM蛋白共包含167個(gè)氨基酸殘基,分子量大小大約為19KDa。它作為M蛋白的前體蛋白,只包含一個(gè)弗林蛋白酶切割位點(diǎn),弗林酶在病毒粒子成熟過(guò)程中具有重要作用,在酸性環(huán)境中,可將位于高爾基體上的prM蛋白水解成M段和pr段,此過(guò)程有利于成熟坦布蘇病毒粒子的裝配

帶狀結(jié)構(gòu),病毒,二聚體


tikhuntetal.,2008)。在經(jīng)酶作用后的prM蛋白,pr段將被分泌至細(xì)胞外,而M段會(huì)穿插于細(xì)胞膜脂質(zhì)雙分子層中,以此參與病毒囊膜的形成(顏丕熙,2012)。E蛋白對(duì)于坦布蘇病毒來(lái)說(shuō)是一種主要的糖蛋白,同時(shí)也是最大的結(jié)構(gòu)蛋白,它存在于病毒粒子表面,分子量達(dá)到54KDa左右,作為主要的抗原遞呈蛋白,可誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生特異性抗體,在病毒吸附、組裝以及受體結(jié)合等方面同樣發(fā)揮著重要的作用(DengYQetal.,2011;仲華等,2007;張琳等,2012)。E蛋白可形成3個(gè)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域,從X射線晶體學(xué)來(lái)劃分,包括domainⅠ/Ⅱ/Ⅲ(DⅠ/DⅡ/DⅢ)(如圖1-3)(Chenetal.,2005;DowdKAandPiersonTC,2011;FritzRetal.,2008)。其中DⅠ包含3個(gè)不連續(xù)的片段,該區(qū)域的二硫鍵可形成β折疊結(jié)構(gòu),用以連接DⅡ以及DⅢ。DⅡ較為保守,是由DⅠ投射的兩個(gè)擴(kuò)展循環(huán)組成,呈指樣結(jié)構(gòu),該區(qū)域參與形成E蛋白二聚體,在病毒融合過(guò)程中,可以與靶細(xì)胞的細(xì)胞膜相互作用。位于E蛋白羧基端的DⅢ,結(jié)構(gòu)類似于IgG,其作用為與受體結(jié)合,大部分抗體均可識(shí)別DⅢ上的抗原表位(DengYQetal.,2011;李焱等,2010;寇甜甜等,2014)。圖1-3黃病毒E蛋白二聚體帶狀結(jié)構(gòu)(引自DowdKA,2011)圖中表示E蛋白的三個(gè)結(jié)構(gòu)域以及E-DⅡ的遠(yuǎn)端融合環(huán),其中棕色球表示N連碳水化合物修飾Fig1-3RibbondiagramoftheflavivirusEproteindimerIndividualdomainsoftheEproteinareindicated,asisthefusionloopatthedistalendofE-DⅡ.TheN-linkedcarbohydratemodificationsonEareshownasbrownspheres.NS1蛋白的分子量約為40KDa,是一個(gè)多功能糖蛋白,不僅可被糖基化修飾,也可以形成二聚體分泌到胞外。NS1功能具有多樣性,在病毒早期復(fù)制中發(fā)揮重要作

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]一例鴨坦布蘇病的診治[J]. 江敏生,陳盛絮.  中國(guó)畜牧獸醫(yī)文摘. 2018(02)
[3]鴨坦布蘇病毒分離鑒定及全基因組序列分析[J]. 王賓賓,閆大為,倪欣濤,李雪松,滕巧泱,楊健美,陳鴻軍,劉芹防,李澤君.  中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2017(06)
[4]實(shí)時(shí)熒光定量TaqMan RT-PCR檢測(cè)鴨坦布蘇病毒方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 劉洋,霍斯琪,王傳彬,楊林,張倩,劉玉良,馬英,顧小雪.  中國(guó)家禽. 2017(20)
[5]一例蛋鴨黃病毒病診治[J]. 劉波,劉娜,孔令靜,張棟,宦者威,陳月鋒,谷桂平,楊俊青.  中國(guó)畜禽種業(yè). 2017(06)
[6]鴨坦布蘇病毒的分離和PCR鑒定[J]. 曹宗喜,賀冬梅,葉保國(guó),張艷,楊少雄,陳朝喜,林哲敏.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[7]鴨坦布蘇病毒E基因重組桿狀病毒的構(gòu)建與間接ELISA檢測(cè)方法的建立[J]. 王善輝,謝金文,強(qiáng)成魁,呂顏枝,李云龍.  中國(guó)家禽. 2016(01)
[8]鴨胚中鴨坦布蘇病毒的分離與鑒定[J]. 李芳韜,江蕾,王雪梅,郭柳川,王兆山,刁有祥.  中國(guó)家禽. 2015(24)
[9]一例蛋鴨黃病毒病的診治[J]. 劉強(qiáng),顧海豐.  湖北畜牧獸醫(yī). 2015(03)
[10]H9亞型禽流感病毒和鴨坦布蘇病毒二重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 趙虹,謝芝勛,謝麗基,劉加波,鄧顯文,謝志勤,龐耀珊,范晴,羅思思.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2014(10)

博士論文
[1]黃病毒復(fù)制缺陷病毒的構(gòu)建及sfRNA產(chǎn)生機(jī)制研究[D]. 張秋艷.中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所) 2019
[2]坦布蘇病毒感染對(duì)鴨胚成纖維細(xì)胞生物學(xué)功能的影響及其機(jī)制研究[D]. 于觀留.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]鴨坦布蘇病毒細(xì)胞適應(yīng)毒免疫原性及致弱分子基礎(chǔ)研究[D]. 章麗嬌.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]坦布蘇病毒ZC株感染性克隆的構(gòu)建和部分3’非編碼區(qū)功能的初步研究[D]. 陳浩.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]坦布蘇病毒的分離鑒定及重組腺病毒介導(dǎo)shRNA抑制坦布蘇病毒在體外復(fù)制的研究[D]. 唐熠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013

碩士論文
[1]鴨坦布蘇病毒NS1蛋白互作宿主蛋白的篩選及驗(yàn)證[D]. 王振忠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]鴨坦布蘇病毒NS1蛋白的原核表達(dá)與應(yīng)用[D]. 潘異哲.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]鴨坦布蘇病毒的分離、致病性及細(xì)胞適應(yīng)研究[D]. 張玥.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]鴨坦布蘇病毒分離鑒定及其生物學(xué)特性的研究[D]. 顏丕熙.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012



本文編號(hào):3029220

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