羊呼吸系統(tǒng)微生物調查及主要疾病病原分析
發(fā)布時間:2021-01-09 00:47
呼吸系統(tǒng)疾病頻發(fā)往往與呼吸道微生物的改變有著密切而直接的聯(lián)系。呼吸道微生物與呼吸道疾病的相關性也越來越為人們所認可。探查呼吸道微生物分布,對于闡明疾病的發(fā)生發(fā)展、轉化及相互作用的機制至關重要;同時為合理使用抗生素,疫苗預防等提供有價值的參考,也為呼吸道疾病的有效治療提供新的思路。本研究以阿克蘇地區(qū)卡拉庫爾羊為研究對象,利用基因組測序技術,對綿羊呼吸系統(tǒng)微生物細、真菌群落結構進行研究。試驗采集有明顯病變的綿羊肺臟組織樣品,并以健康綿羊作為對照;將完整呼吸系統(tǒng)細分為鼻腔、氣管上端、氣管下端以及肺臟四個部位,進行樣本的分別采集;鼻腔取鼻拭子樣品,其它部位則取呼吸道粘液樣品,檢測相應部位細、真菌群的分布狀況。結果表明:從38份樣品中,共檢出細菌2界27門44綱98目178科462屬;真菌則1界16門47綱114目264科494屬。健康綿羊呼吸系統(tǒng)優(yōu)勢細菌種依次為Acinetobacter lwoffii、Psychrobacter faecalis(糞腸球菌)、Lacto bacillus iners(乳酸乳桿菌)、Moraxella ovis(羊莫拉菌)、Acinetobacter haem...
【文章來源】:塔里木大學新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
綿羊肺臟組織樣品Fig.2-1Lungorganizationsamplesofsheeps
塔里木大學碩士學位論文第二章綿羊呼吸道微生物結構及相關疾病病原的探究162.2結果2.2.1基因組檢測結果圖利用細菌、真菌通用及特異性引物,分別對不同的樣品基因組進行初步效果的檢測;PCR擴增完成后,進行1%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定,部分電泳結果展示如下(圖2-2)。圖2-2基因組DNA效果檢測Fig.2-2EffectdetectionofgenomicDNA注:M:marker2000;1-24:基因組樣品2.2.2OTUs注釋結果分析2.2.2.1OTUs結果分析根據(jù)有效OTUs值,我們分析了不同分類水平下,呼吸系統(tǒng)四個部位(鼻腔、氣管上端、氣管下端以及肺臟)細菌、真菌分布情況。從8個鼻拭子樣本、10個氣管上端、10個下端以及10個肺臟樣品中分別測得了細、真菌群的分布。結果表明:細菌為2界27門44綱98目178科462屬;真菌則為1界16門47綱114目264科494屬。2.2.2.2物種豐度柱形圖由物種豐度柱形圖可知,在門水平上,健康綿羊整個呼吸系統(tǒng)微生物相對豐度前15的共有優(yōu)勢細菌為:Proteobacteria(變形菌門)、Firmicutes(硬壁菌門)、Bacteroidetes(擬桿菌門)、Actinobacteria(放線菌門)、Fibrobacteres(纖維桿菌門)、Acidobacteria(酸桿菌門)、Gemmatimonadetes(芽單胞菌門)、Cyanobacteria(藍藻細菌門)、Chloroflexi(綠彎菌門)、Verrucomicrobia(疣微菌門)、Fusobacteria(梭桿菌門);另外,不同生理部位存在差異優(yōu)勢菌為Nitrospirae(硝化螺旋菌門,除肺臟)、Melainabacteria(除
塔里木大學碩士學位論文 第二章 綿羊呼吸道微生物結構及相關疾病病原的探究a(黑粉菌屬,僅鼻腔和肺臟)、Byssochlamys(絲衣霉菌屬,除上端)、Pseudogymnoascus(除上端);與 K 組相比,Aspergillus(曲霉屬)明顯增多(圖 2-4B)。A
本文編號:2965637
【文章來源】:塔里木大學新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
綿羊肺臟組織樣品Fig.2-1Lungorganizationsamplesofsheeps
塔里木大學碩士學位論文第二章綿羊呼吸道微生物結構及相關疾病病原的探究162.2結果2.2.1基因組檢測結果圖利用細菌、真菌通用及特異性引物,分別對不同的樣品基因組進行初步效果的檢測;PCR擴增完成后,進行1%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定,部分電泳結果展示如下(圖2-2)。圖2-2基因組DNA效果檢測Fig.2-2EffectdetectionofgenomicDNA注:M:marker2000;1-24:基因組樣品2.2.2OTUs注釋結果分析2.2.2.1OTUs結果分析根據(jù)有效OTUs值,我們分析了不同分類水平下,呼吸系統(tǒng)四個部位(鼻腔、氣管上端、氣管下端以及肺臟)細菌、真菌分布情況。從8個鼻拭子樣本、10個氣管上端、10個下端以及10個肺臟樣品中分別測得了細、真菌群的分布。結果表明:細菌為2界27門44綱98目178科462屬;真菌則為1界16門47綱114目264科494屬。2.2.2.2物種豐度柱形圖由物種豐度柱形圖可知,在門水平上,健康綿羊整個呼吸系統(tǒng)微生物相對豐度前15的共有優(yōu)勢細菌為:Proteobacteria(變形菌門)、Firmicutes(硬壁菌門)、Bacteroidetes(擬桿菌門)、Actinobacteria(放線菌門)、Fibrobacteres(纖維桿菌門)、Acidobacteria(酸桿菌門)、Gemmatimonadetes(芽單胞菌門)、Cyanobacteria(藍藻細菌門)、Chloroflexi(綠彎菌門)、Verrucomicrobia(疣微菌門)、Fusobacteria(梭桿菌門);另外,不同生理部位存在差異優(yōu)勢菌為Nitrospirae(硝化螺旋菌門,除肺臟)、Melainabacteria(除
塔里木大學碩士學位論文 第二章 綿羊呼吸道微生物結構及相關疾病病原的探究a(黑粉菌屬,僅鼻腔和肺臟)、Byssochlamys(絲衣霉菌屬,除上端)、Pseudogymnoascus(除上端);與 K 組相比,Aspergillus(曲霉屬)明顯增多(圖 2-4B)。A
本文編號:2965637
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