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基于分子馬達(dá)協(xié)助物質(zhì)輸運(yùn)過(guò)程的研究

發(fā)布時(shí)間:2018-04-01 12:12

  本文選題:Smith-Simmons模型 切入點(diǎn):分子馬達(dá) 出處:《山東大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:分子馬達(dá)是一種具有輸運(yùn)功能的蛋白質(zhì),它能夠高效、直接地把化學(xué)能轉(zhuǎn)化為機(jī)械能,進(jìn)而產(chǎn)生某種作用力驅(qū)動(dòng)自身沿軌道定向運(yùn)動(dòng)。它幾乎參與了細(xì)胞內(nèi)所有的生命活動(dòng),如肌肉的收縮、DNA的復(fù)制、囊泡和細(xì)胞器的輸運(yùn)等。在生物體內(nèi),除了自由擴(kuò)散引起的被動(dòng)輸運(yùn),由分子馬達(dá)協(xié)助進(jìn)行的主動(dòng)輸運(yùn)發(fā)揮了至關(guān)重要的作用。常見(jiàn)的分子馬達(dá)有三種:以微絲為運(yùn)動(dòng)軌道的肌球蛋白、沿著微管負(fù)端輸運(yùn)物質(zhì)的動(dòng)力蛋白及沿著微管正端輸運(yùn)物質(zhì)的驅(qū)動(dòng)蛋白。物質(zhì)輸運(yùn)過(guò)程涉及三種微粒:自由的微粒、自由的馬達(dá)及與馬達(dá)結(jié)合的微粒,它們通過(guò)馬達(dá)與微粒的結(jié)合分離相互轉(zhuǎn)化。與公路運(yùn)輸類似,馬達(dá)輸運(yùn)物質(zhì)過(guò)程中亦會(huì)受到阻礙,細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)輸運(yùn)受到阻礙可能會(huì)引發(fā)多種神經(jīng)退行性疾病,如阿爾茨海默病(又稱老年癡呆癥)、遺傳性感覺(jué)神經(jīng)病、帕金森病、亨廷頓病和肌萎縮性(脊髓)側(cè)索硬化癥等,所以針對(duì)馬達(dá)輸運(yùn)物質(zhì)過(guò)程的深入研究具有較深刻的實(shí)際意義,目前已經(jīng)成為生物醫(yī)學(xué)界的研究熱點(diǎn)之一。本文利用數(shù)學(xué)模型研究馬達(dá)協(xié)助物質(zhì)輸運(yùn)的過(guò)程,共分為五章:第一章,首先詳細(xì)介紹本文的生物背景;然后分析了分子馬達(dá)的研究現(xiàn)狀,并簡(jiǎn)要介紹了本文主要采用的數(shù)學(xué)理論;最后簡(jiǎn)要概括本文的主要工作和創(chuàng)新點(diǎn)。第二章,以正向輸運(yùn)為研究對(duì)象,利用數(shù)學(xué)模型分析馬達(dá)的單向輸運(yùn)過(guò)程。首先,本章在Smith-Simmons模型的基礎(chǔ)上引入通量與濃度的關(guān)系,使模型更加優(yōu)化;然后,利用級(jí)數(shù)法擾動(dòng)理論求得模型的零級(jí)近似解和一級(jí)近似解,并作圖說(shuō)明零級(jí)近似解的適用性;最后,作圖分析結(jié)合率k、自由擴(kuò)散率D等因素對(duì)微粒濃度的影響。第三章,針對(duì)單向輸運(yùn)受阻展開(kāi)研究。首先,定義馬達(dá)輸運(yùn)過(guò)程中的"輸運(yùn)正常"與"輸運(yùn)受阻"現(xiàn)象,認(rèn)為模型存在穩(wěn)態(tài)解時(shí)的情形為正常輸運(yùn)狀態(tài),模型不存在穩(wěn)態(tài)解的情形為一種輸運(yùn)受阻狀態(tài);其次,在第二章的基礎(chǔ)上,求得輸運(yùn)受阻臨界點(diǎn)的表達(dá)式,得到輸運(yùn)受阻的條件,并分別分析不同參數(shù)對(duì)輸運(yùn)狀態(tài)的影響;最后,重點(diǎn)研究邊界擾動(dòng)及內(nèi)部擾動(dòng)下的輸運(yùn)過(guò)程,并得到正常輸運(yùn)下擾動(dòng)的閾值。第四章,研究細(xì)胞內(nèi)馬達(dá)協(xié)助物質(zhì)雙向輸運(yùn)的過(guò)程。首先,本章在第二章的基礎(chǔ)上建立改進(jìn)后的Smith-Simmons模型;其次,將模型無(wú)量綱化,求得模型的零級(jí)近似解,得到雙向輸運(yùn)受阻臨界點(diǎn)的解析式;最后,對(duì)比單向輸運(yùn)與雙向輸運(yùn)受阻的條件,分別作圖分析正向結(jié)合率k+、負(fù)向結(jié)合率k_對(duì)輸運(yùn)過(guò)程的影響,分析雙向輸運(yùn)中正向輸運(yùn)與負(fù)向輸運(yùn)之間的耦合效應(yīng)。第五章,總結(jié)全文,概述研究意義,陳述本文不足及有待解決的問(wèn)題。
[Abstract]:A molecular motor is a kind of protein with transport function , it can convert chemical energy into mechanical energy efficiently and directly , and then generate some kind of force to drive itself to move along the track . In chapter 2 , we study the influence of different parameters on the transport process . At last , we study the influence of the positive rate k + and the negative binding rate k _ on the transport process , and analyze the coupling effect between the forward transport and the negative transport in the bi - directional transport .

【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:Q51

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2 伍芳婷;張潛,

本文編號(hào):1695517


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