本文關(guān)鍵詞：中國(guó)海岸帶耐鹽植物DNA條形碼研究　出處：《華東師范大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：以耐鹽植物為主體形成的海岸帶濕地生態(tài)系統(tǒng),是全球單位面積服務(wù)功能最高的生態(tài)系統(tǒng)之一。本文對(duì)我國(guó)從遼寧到海南10個(gè)沿海省市大陸及島嶼海岸帶耐鹽植物廣泛采樣,從采集獲得的樣品中篩選出53科97屬的116物種共562樣品進(jìn)行DNA條形碼研究。對(duì)3個(gè)葉綠體片段rbtK、cL、trnH-psbA和1個(gè)核基因片段ITS進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,統(tǒng)計(jì)各個(gè)片段的引物通用性和序列獲得率。擴(kuò)增和測(cè)序方面,選擇使用兩對(duì)matK引物(matK-390F//matK-1326R和matK3F-KIM/matK IR-KIM)能擴(kuò)增出所有類群,序列獲得率達(dá)到89.32%;應(yīng)用18sdir/ITS4對(duì)ITS進(jìn)行擴(kuò)增,序列獲得率為85.59%。序列相似性分析的結(jié)果中單個(gè)片段ITS物種識(shí)別率最高(73.36%),rbcL的物種識(shí)別率最低,僅為46.41%;系統(tǒng)發(fā)育樹的結(jié)果顯示matK的物種識(shí)別率最好(82.3%)。多維度非度量分析(NMDS)和主坐標(biāo)分析(PCoA)結(jié)果表明在進(jìn)行海岸帶區(qū)域性植物的DNA條形碼研究時(shí),葉綠體片段和核基因片段均應(yīng)該考慮。綜合上述研究結(jié)果,推薦聯(lián)合片段ITS+matK作為中國(guó)海岸帶耐鹽植物DNA條形碼。本文為海岸帶耐鹽植物研究提供了總計(jì)1939條DNA條形碼基礎(chǔ)數(shù)據(jù),為構(gòu)建耐鹽植物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:The salt tolerant plants for wetland ecosystem in the main form of the coastal zone, is one of the global ecosystem services per unit area of the highest. The extensive sampling on China to Hainan 10 coastal provinces and cities in the mainland and islands off the coast of salt tolerant plants from Liaoning, from the collected samples screened 116 families and 97 genera of 53 species selected a total of 562 samples were DNA barcoding of 3 chloroplast fragments. RbtK, cL, trnH-psbA and 1 nuclear ITS gene fragments were amplified and sequenced. The statistics of each fragment primers universal and sequence. PCR amplification and sequencing, using two pairs of matK primers (matK-390F//matK-1326R and matK3F-KIM/matK IR-KIM) can be amplified in all groups sequence, rate 89.32%; application of 18sdir/ITS4 to ITS were amplified, sequence rate of single fragment 85.59%. sequence similarity analysis result in ITS species, the highest recognition rate (73.36%), RB Species identification of cL was the lowest, only 46.41%; phylogenetic tree species showed that the recognition rate of matK (82.3%). The best non metric multidimensional analysis (NMDS) and principal coordinate analysis (PCoA) showed that in the study of DNA barcode with Regional Coast plants, chloroplast and nuclear gene fragment all should be considered. Based on the above research results, combined with a fragment of ITS+matK as Chinese recommended coastal salt tolerant plant DNA barcoding. This paper provided a total of 1939 DNA barcode basic data for the coastal zone study on the salt tolerance of plants, for the construction of salt tolerant plants DNA laid the foundation of shape code database.

【學(xué)位授予單位】：華東師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：Q943.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1399461