梭羅草AFLP多態(tài)性分析及指紋圖譜構建
發(fā)布時間:2018-01-07 03:05
本文關鍵詞:梭羅草AFLP多態(tài)性分析及指紋圖譜構建 出處:《青海大學》2017年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:本研究以青海高寒草原鄉(xiāng)土植物梭羅草(Kengyilia thoroldiana)為主要研究材料,并與近緣物種大穎草(K.grandiglumis)、糙毛以禮草(K.hirsuta)、疏花以禮草(K.laxiflora)和硬桿以禮草(K.rigidula)進行對比,建立并優(yōu)化梭羅草的擴增片段長度多態(tài)性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)反應體系,通過AFLP分子標記技術分析梭羅草的居群間及個體間的多樣化水平,構建梭羅草的AFLP指紋圖譜。研究結果如下:利用梭羅草基因組DNA優(yōu)化并建立的梭羅草AFLP反應體系為:預擴增反應體系(25μl):連接產物1μl;10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs 0.375μl;Mg2+1μl;TaqDNA聚合酶0.5μl;EcoR I預擴引物1μl;Mse I預擴引物1.2μl;ddH2O加至25μl。選擴增反應體系(25μl):預擴產物(稀釋20倍)2.0μl,10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs 0.60μl;Mg2+2μl;TaqDNA聚合酶0.1μl;EcoR I選擴引物1.5μl;Mse I選擴引物2.5μl;ddH2O加至25μl。利用優(yōu)化后的AFLP體系,用216對E/M組合的引物對梭羅草(8個居群)和大穎草、疏花以禮草各1個居群共10份供試材料進行了引物篩選,篩選出了38對具有多態(tài)性的引物,其中6對擴增條帶清晰,鑒別效率高,用這6對引物構建了梭羅草的指紋圖譜。引物組合E16C4和E4C10的擴增條帶中均有梭羅草的特征條帶,可用于梭羅草的種質鑒定和純度鑒定。組合E16C4、E3C16擴增出的8個多態(tài)性條帶可以將10份供試材料彼此區(qū)分。利用AFLP技術對12個梭羅草居群和4個近緣草種居群進行遺傳多樣性研究。用38對AFLP引物對16個居群進行遺傳多樣性分析,擴增出122個多態(tài)性位點。12個梭羅草居群間的遺傳同一性變異范圍為0.6837-0.8859,遺傳距離變異范圍為0.1212-0.3802,梭羅草居群間的遺傳變異占總遺傳變異的比例(Gst)為42.82%,大部分(57.18%)遺傳變異存在于居群內部,海拔、生境及栽培條件都對梭羅草的遺傳多樣性和聚類關系產生影響。
[Abstract]:In this paper , we studied the genetic diversity of Thoreau grass ( 25渭l ) by AFLP molecular marker technique . The primers were used to amplify the amplified fragment length polymorphism ( AFLP ) reaction system of Thoreau grass . Most of ( 57.18 % ) genetic variation exists within the population , and the elevation , habitat and culture conditions have an impact on the genetic diversity and clustering relationship of Thoreau grass .
【學位授予單位】:青海大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q943.2
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,本文編號:1390697
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