本文關鍵詞：豬圓環(huán)病毒2型Cap蛋白B細胞表位的預測及鑒定　出處：《鄭州大學學報(理學版)》2017年03期 　論文類型：期刊論文

  更多相關文章： 豬圓環(huán)病毒型 Cap蛋白 原核表達 表位

【摘要】：利用生物信息學技術和原核表達系統(tǒng),篩選豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)核衣殼蛋白(Cap)的B細胞表位,為進一步揭示PCV2的免疫調(diào)控機制提供研究依據(jù).運用生物信息學軟件預測PCV2 Cap蛋白的親水性、表面可及性、蛋白柔韌性、抗原性和B細胞線性表位;根據(jù)預測結(jié)果,初步確定Cap蛋白潛在的B細胞線性表位主要位于58~66、79~91、151~162、174~189、204~213和221~233位氨基酸.設計特異性引物,擴增Cap蛋白潛在表位區(qū)域基因,并克隆到p ET32a(+)原核表達載體上,轉(zhuǎn)化至表達菌BL21(DE3)plys S中,在IPTG誘導下表達目的蛋白;利用PCV2陽性血清鑒定Cap蛋白的B細胞線性表位,篩選出3個能與血清結(jié)合的肽段,即Cap77-95、Cap174-189和Cap221-233;對獲得的肽段進行在線同源比對,發(fā)現(xiàn)3個片段均為PCV2 Cap蛋白的特有序列,有可能成為PCV2的特異性表位.
[Abstract]:Using bioinformatics technique and the prokaryotic expression system, screening of porcine circovirus type 2 (PCV2) nucleocapsid protein (Cap) of the B cell epitope, provide a theoretical basis for the further exploration of the mechanism of immune regulation of PCV2. By using bioinformatics software PCV2 Cap protein predicted hydrophilicity, surface accessibility, flexibility, protein the antigenicity and the linear B cell epitope; according to the forecast results, preliminary determination of Cap protein B cell linear potential epitopes are mainly located in 58~66, 79~91, 151~162, 174~189, 204~213 and 221~233 amino acids. The specific primers were designed, Cap protein gene amplification in latent epitope regions, and cloned into P (+ ET32a) original the eukaryotic expression vector and transformed into E.coli BL21 (DE3) plys S in protein expression induced by IPTG; using the linear B cell epitopes of PCV2 Cap protein positive sera were screened, 3 with serum binding peptides, Cap77-95, C Ap174-189 and Cap221-233; online homology comparison of the obtained peptides revealed that all 3 fragments were specific sequences of PCV2 Cap protein, and might become specific epitope of PCV2.
【作者單位】： 鄭州大學生命科學學院;
【基金】：國家重點研發(fā)計劃項目(2016YFD0500704) 鄭州市科技創(chuàng)新團隊項目(131PCXTD622)
【分類號】：S852.651
【正文快照】： 0引言豬圓環(huán)病毒(porcine circovirus,PCV)是單鏈環(huán)狀無囊膜DNA病毒,該病毒粒子呈二十面體對稱結(jié)構[1],是已知的最小動物病毒之一[2].根據(jù)其基因組成、抗原性和致病性的不同,將其劃分成PCV1和PCV2兩個類型,其中PCV2是斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(post-weaning multisystemic was

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