發(fā)布時(shí)間：2017-12-26 21:23

  本文關(guān)鍵詞：豬圓環(huán)病毒2型Cap蛋白B細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)及鑒定　出處：《鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版)》2017年03期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： 豬圓環(huán)病毒型 Cap蛋白 原核表達(dá) 表位

【摘要】：利用生物信息學(xué)技術(shù)和原核表達(dá)系統(tǒng),篩選豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)核衣殼蛋白(Cap)的B細(xì)胞表位,為進(jìn)一步揭示PCV2的免疫調(diào)控機(jī)制提供研究依據(jù).運(yùn)用生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)PCV2 Cap蛋白的親水性、表面可及性、蛋白柔韌性、抗原性和B細(xì)胞線性表位;根據(jù)預(yù)測(cè)結(jié)果,初步確定Cap蛋白潛在的B細(xì)胞線性表位主要位于58~66、79~91、151~162、174~189、204~213和221~233位氨基酸.設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增Cap蛋白潛在表位區(qū)域基因,并克隆到p ET32a(+)原核表達(dá)載體上,轉(zhuǎn)化至表達(dá)菌BL21(DE3)plys S中,在IPTG誘導(dǎo)下表達(dá)目的蛋白;利用PCV2陽(yáng)性血清鑒定Cap蛋白的B細(xì)胞線性表位,篩選出3個(gè)能與血清結(jié)合的肽段,即Cap77-95、Cap174-189和Cap221-233;對(duì)獲得的肽段進(jìn)行在線同源比對(duì),發(fā)現(xiàn)3個(gè)片段均為PCV2 Cap蛋白的特有序列,有可能成為PCV2的特異性表位.
[Abstract]:Using bioinformatics technique and the prokaryotic expression system, screening of porcine circovirus type 2 (PCV2) nucleocapsid protein (Cap) of the B cell epitope, provide a theoretical basis for the further exploration of the mechanism of immune regulation of PCV2. By using bioinformatics software PCV2 Cap protein predicted hydrophilicity, surface accessibility, flexibility, protein the antigenicity and the linear B cell epitope; according to the forecast results, preliminary determination of Cap protein B cell linear potential epitopes are mainly located in 58~66, 79~91, 151~162, 174~189, 204~213 and 221~233 amino acids. The specific primers were designed, Cap protein gene amplification in latent epitope regions, and cloned into P (+ ET32a) original the eukaryotic expression vector and transformed into E.coli BL21 (DE3) plys S in protein expression induced by IPTG; using the linear B cell epitopes of PCV2 Cap protein positive sera were screened, 3 with serum binding peptides, Cap77-95, C Ap174-189 and Cap221-233; online homology comparison of the obtained peptides revealed that all 3 fragments were specific sequences of PCV2 Cap protein, and might become specific epitope of PCV2.
【作者單位】： 鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0500704) 鄭州市科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(131PCXTD622)
【分類號(hào)】：S852.651
【正文快照】： 0引言豬圓環(huán)病毒(porcine circovirus,PCV)是單鏈環(huán)狀無囊膜DNA病毒,該病毒粒子呈二十面體對(duì)稱結(jié)構(gòu)[1],是已知的最小動(dòng)物病毒之一[2].根據(jù)其基因組成、抗原性和致病性的不同,將其劃分成PCV1和PCV2兩個(gè)類型,其中PCV2是斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(post-weaning multisystemic was

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