東北雨蛙線粒體DNA遺傳多樣性的研究
發(fā)布時間:2017-12-18 01:04
本文關鍵詞:東北雨蛙線粒體DNA遺傳多樣性的研究
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【摘要】:東北雨蛙(Hyla japonica)隸屬于兩棲綱(Amphibia),無尾目(Anura),雨蛙科(Hylidae),雨蛙屬(Hyla),在我國主要分布于內(nèi)蒙古和東北三省,在國外主要分布于朝鮮半島,韓國、日本及俄羅斯等地。目前,國內(nèi)外關于東北雨蛙遺傳多樣性的研究較少,國內(nèi)的研究主要集中在東北雨蛙生理生化與細胞遺傳等方面;國外有韓國學者對朝鮮半島分布的東北雨蛙與水原雨蛙(H.suweonensis)遺傳多樣性的比較分析。本文通過對14個地理種群的87個東北雨蛙(包括在Genbank上下載的朝鮮半島的本種同源序列)線粒體DNA的研究,探討了其種群遺傳多樣性及系統(tǒng)分布格局。經(jīng)PCR擴增和測序后,獲得了845bp的cyt b區(qū)基因序列。整個東北雨蛙種群的單倍型多樣性(h)為0.824,核苷酸多樣性(π)為0.00658,無論是與同屬其他雨蛙還是與其他屬蛙類相比較,東北雨蛙種群遺傳多樣性都相對較低。整個內(nèi)類群cyt b區(qū)基因存在41個變異位點,包括31個簡約信息位點;共定義了31個單倍型,其中種群間共享單倍型是5個,種群內(nèi)共享單倍型是6個,特有單倍型是20個;堿基間轉換顛換比為8.32;種群間遺傳距離為0~0.012,平均遺傳距離為0.008;趩伪缎驮诜N群中的分布、系統(tǒng)樹的拓撲結構與單倍型網(wǎng)絡支系分析,研究表明整個東北雨蛙種群分為兩支,其中一支均由朝鮮半島的部分單倍型構成,另外一支則是沒有明顯的地理分布結構。整個東北雨蛙種群的單倍型都沒有形成顯著的地理分布格局。推測可能是由東北雨蛙自身生活特征以及東北地區(qū)沒有明顯地理屏障所導致的。成體的東北雨蛙種群擴散和遷移能力可能較強,導致東北三省不同地理居群包括與朝鮮半島居群間的基因交流較為頻繁;東北地區(qū)地勢主要以平原為主,河流密布而且貫通,高山與河流均未對東北雨蛙種群形成地理上的隔離,各種群之間的基因交流比較容易發(fā)生。在東北雨蛙樣品采集的過程中,發(fā)現(xiàn)其種群數(shù)量呈現(xiàn)下降趨勢,需要加強這一物種的調(diào)查和監(jiān)測工作。東北雨蛙種群的棲息地結構類型單一,多樣性程度低,部分棲息地由于人為活動的影響,破壞現(xiàn)象嚴重。研究結果也表明,東北雨蛙種群的遺傳多樣性(核苷酸多樣性與單倍型多樣性)較低,所以,我們認為應該加強對東北雨蛙種群的關注與保護。
【學位授予單位】:沈陽師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q953
【相似文獻】
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1 朱玉琴;東北雨蛙(Hyla japonica)皮膚中新型鎮(zhèn)痛肽的發(fā)現(xiàn)及其功能研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2014年
2 于佳琳;東北雨蛙線粒體DNA遺傳多樣性的研究[D];沈陽師范大學;2017年
,本文編號:1302202
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