新疆維吾爾族常染色體30個(gè)InDel位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)與群體遺傳關(guān)系研究
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【摘要】:目的:本研究擬對(duì)30個(gè)InDel位點(diǎn)(HLD6、HLD39、HLD40、HLD45、HLD48、HLD56、HLD58、HLD64、HLD67、HLD70、HLD77、HLD81、HLD83、HLD84、HLD88、HLD92、HLD93、HLD97、HLD99、HLD101、HLD111、HLD114、HLD118、HLD122、HLD124、HLD125、HLD128、HLD131、HLD133、HLD136)在新疆地區(qū)維吾爾族群體中遺傳多樣性進(jìn)行分析,評(píng)估30個(gè)InDel基因座的法醫(yī)學(xué)鑒別效能,并基于已發(fā)表的群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù),對(duì)新疆維吾爾族和其他民族群體之間的遺傳關(guān)系進(jìn)行研究。方法:(1)采集新疆維吾爾族136個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體的樣本,利用Chelex-100法提取基因組DNA后,利用PCR復(fù)合擴(kuò)增和毛細(xì)管電泳對(duì)30個(gè)InDel位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。統(tǒng)計(jì)30個(gè)InDel位點(diǎn)的基因分型數(shù)據(jù),并計(jì)算各基因座的等位基因頻率和它們的法醫(yī)學(xué)參數(shù)。(2)利用SNP Analyzer V2.0軟件進(jìn)行連鎖不平衡分析;利用21個(gè)其他民族的30個(gè)InDel位點(diǎn)的分型數(shù)據(jù),并結(jié)合本研究中新疆維吾爾族的分型數(shù);利用ARLEQUIN軟件對(duì)這些民族群體間相同的位點(diǎn)進(jìn)行分子方差分析;利用DISPAN軟件計(jì)算這些族群間的遺傳距離DA;利用MEGA軟件構(gòu)建族群的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù);利用軟件MVSP進(jìn)行族群的主成分分析,利用STRUCTURE軟件進(jìn)行族群的聚類(lèi)分析。結(jié)果:(1)30個(gè)InDel基因座在新疆維吾爾族具有較高的多態(tài)性,累積個(gè)體識(shí)別力和累積非父排除率分別是0.999999999999399和0.99632。(2)對(duì)新疆維吾爾族和其他21個(gè)群體的遺傳關(guān)系研究顯示,新疆維吾爾族與烏魯木齊維吾爾族和哈薩克族的具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的位點(diǎn)最少;在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),主成分分析和人群聚類(lèi)分析中表現(xiàn)出較近的遺傳關(guān)系。新疆維吾爾族和6個(gè)墨西哥群體表現(xiàn)出較遠(yuǎn)的遺傳關(guān)系。結(jié)論:30個(gè)常染色體InDel位點(diǎn)在新疆維吾爾族群體中法醫(yī)學(xué)效能高可用于個(gè)體識(shí)別,與烏魯木齊維族和哈薩克族遺傳關(guān)系最近。
【學(xué)位授予單位】:新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類(lèi)號(hào)】:Q987
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,本文編號(hào):1280426
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