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脫氨酶AmnE的表達(dá)純化及其結(jié)構(gòu)解析

發(fā)布時間:2025-03-30 00:45
  微生物在污染環(huán)境的生物修復(fù)方面具有重要作用,它們對環(huán)境污染物的降解是通過一系列酶來進(jìn)行的。因此,研究污染物降解過程中關(guān)健酶的作用機理,對于闡明微生物對污染物的生物降解過程以及生物修復(fù)機制具有重要意義。蛋白質(zhì)晶體學(xué)是利用X射線衍射技術(shù)對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行解析的一門學(xué)科,它能使我們從原子角度了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)信息,結(jié)合蛋白質(zhì)的功能特性,可以確定在實際催化過程中的功能基團及其作用方式,為定向改造提供重要信息。硝基苯是一種重要的化工原料和化學(xué)中間體,進(jìn)入環(huán)境的硝基苯會長期殘留在水體和土壤里,對人類健康造成嚴(yán)重的危害。本文以硝基苯代謝途徑中的脫氨酶AmnE作為研究對象,利用Ni-NTA親和層析及Resource Q離子交換層析對重組表達(dá)于大腸桿菌BL21 (DE3)中的AmnE蛋白進(jìn)行純化。利用懸滴氣相擴散法和商業(yè)結(jié)晶試劑盒進(jìn)行結(jié)晶條件的篩選和優(yōu)化,并在0.2 M KCl、23% PEG3350、0.2 M Bis-Tris pH 7.5的結(jié)晶條件下獲得了高分辨率的蛋白晶體。AmnE晶體的分辨率為2.09A,屬于正交晶系,空間群為C2221,晶胞參數(shù)為a= 63.23 A、b= 88.93 A、c= ...

【文章頁數(shù)】:61 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-7蜜白質(zhì)結(jié)晶過程示意圖??K.?1-7?Process?ofro化in?crs化llization??

圖1-7蜜白質(zhì)結(jié)晶過程示意圖??K.?1-7?Process?ofro化in?crs化llization??

的單晶的獲得是蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析的前提。蛋白質(zhì)結(jié)晶過程是一個有序化的過程,??即在溶液中處于隨機狀態(tài)的分子轉(zhuǎn)變成有序聚集的狀態(tài)。當(dāng)溶液達(dá)到過飽和狀態(tài)時,??蛋白質(zhì)牙可能開始結(jié)晶,如圖1-7。晶體生長包括晶核形成(包含10至200個分子的??聚集)和晶體長大(周圍的分子向晶核聚集)....


圖1-8晶體X射線巧射不意圖??

圖1-8晶體X射線巧射不意圖??

?使用接收器如CCD記錄X射線散射的強度,W獲得與與晶體內(nèi)部的原子分布規(guī)律相??對應(yīng)的特有的衍射圖譜,如圖1-8。在衍射數(shù)據(jù)收集時,一般先收集幾幅衍射圖譜檢??查晶體的衍射質(zhì)量,如果出現(xiàn)衍射點弱、分辨率低、李晶等現(xiàn)象,就沒有必要繼續(xù)收??集數(shù)據(jù)。如果衍射質(zhì)量不錯,則進(jìn)行指標(biāo)化處理....


圖2-1蛋白質(zhì)的結(jié)晶方法??

圖2-1蛋白質(zhì)的結(jié)晶方法??

初篩得到的晶體往往是微晶、奕晶或者衍射效果較差的晶體,所W需要對其初篩??的條件開展進(jìn)一步的優(yōu)化工作。??U)采用懸滴氣相擴散法(如圖2-1)進(jìn)行結(jié)晶條件的優(yōu)化具體操作步驟如下;??26??


圖3-1?PC艮擴增產(chǎn)物??Fig.?3-1?PCR?product?of?AmnE??

圖3-1?PC艮擴增產(chǎn)物??Fig.?3-1?PCR?product?of?AmnE??

3.2.1?PC艮擴增??W公司合成的amnE基因作為模板,應(yīng)用設(shè)計的特異性引物(如表2-3),進(jìn)行??.K:民擴増,其產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果如圖3-1。??M?1?■??6000?bp-^1??1000?bp?-?接造皆?I??圖3-1?PC艮擴增產(chǎn)物??Fig.?....



本文編號:4037916

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