基于分子模擬與微衛(wèi)星的微生物酶解木質(zhì)素機(jī)制及基因組特征研究
【文章頁(yè)數(shù)】:154 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1本研究技術(shù)路線圖
博士學(xué)位論文率較高,而CG/GC,CGA/AGC,AAC/CAA和GCT/TCG極少出現(xiàn)文結(jié)構(gòu)與主要內(nèi)容題背景界中的微生物分為兩類:與污染物降解有關(guān)的微生物及與污染物降物。自然界中與污染物降解有關(guān)的微生物種類繁多,有的與木質(zhì)素的與纖維素降解有關(guān),有的與農(nóng)藥降解有關(guān),有....
圖2.1底物在最優(yōu)的Lac-lignin,LiP-lignin和MnP-lignin復(fù)合物中的結(jié)合口袋及結(jié)合取向
或Lac-lignin的可比。特別地,無(wú)論標(biāo)準(zhǔn)是基于MolDock評(píng)分函數(shù)還是Re-Ranking評(píng)分函數(shù),復(fù)合物L(fēng)iP-lignin和MnP-lignin的分值比復(fù)合物L(fēng)ac-lignin更低。Lac的對(duì)接取向與LiP和MnP的對(duì)接取向不同(圖2.1)。在復(fù)合物L(fēng)ac-li....
圖2.2木質(zhì)素降解酶與底物之間結(jié)合模式的3D模型(顏色:綠色,木質(zhì)素降解酶;藍(lán)色,底物)
-28-2.2.2相互作用分析和分子動(dòng)力學(xué)模擬底物與三個(gè)木質(zhì)素降解酶的最佳結(jié)合模式如圖2.2所示。不同的木質(zhì)素降解酶降解木質(zhì)素的能力存在差異[8]。該差異在一定程度上與木質(zhì)素降解酶和木質(zhì)素之間不同的相互作用有關(guān)[9]。復(fù)合物L(fēng)ac-lignin,LiP-lignin和MnP....
圖2.3木質(zhì)素降解酶與底物之間聯(lián)系的數(shù)量Figure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninandMnP-lignincomplexes.Analyzedligand–proteincontactsincludehydrogenbonding(Hb),
圖2.3木質(zhì)素降解酶與底物之間聯(lián)系的數(shù)量ure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninnP-lignincomplexes.Analyzedligan....
本文編號(hào):3943577
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