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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的超富集植物鼠耳芥抗Zn/Cd脅迫基因篩選及初步分析

發(fā)布時(shí)間:2021-09-15 13:40
  超富集植物是自然界中一類能夠超量吸收重金屬并將其轉(zhuǎn)移至地上部的植物,因其對(duì)重金屬出色的耐受和累積能力,成為研究重金屬累積耐受遺傳調(diào)控機(jī)制和土壤植物修復(fù)的重要材料。對(duì)超富集植物重金屬應(yīng)答和適應(yīng)性調(diào)控基因的鑒定和分析,為植物重金屬環(huán)境適應(yīng)能力的遺傳改良提供候選基因資源和理論依據(jù),進(jìn)而為通過(guò)植被種植治理土壤重金屬污染奠定基礎(chǔ)。本研究以Zn/Cd超富集植物鼠耳芥作為研究對(duì)象,以非超富集模式植物擬南芥作為參照,分別用Zn和Cd對(duì)鼠耳芥和擬南芥處理2小時(shí)和8小時(shí)后,采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的技術(shù)手段對(duì)這兩個(gè)近緣物種進(jìn)行物種內(nèi)以及物種間的重金屬應(yīng)答和適應(yīng)相關(guān)基因進(jìn)行篩選和鑒定。主要結(jié)果如下:在驗(yàn)證鼠耳芥對(duì)Zn/Cd的超富集能力以后,分別提取擬南芥鼠耳芥總RNA進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。在種內(nèi)差異分析中發(fā)現(xiàn)擬南芥和鼠耳芥在Zn脅迫下響應(yīng)的差異顯著基因要比Cd脅迫下響應(yīng)的差異顯著基因要多,并且隨著時(shí)間從2小時(shí)變?yōu)?小時(shí),兩個(gè)物種中的差異顯著基因數(shù)量變少,推測(cè)這可能與物種對(duì)外界脅迫的適應(yīng)性有關(guān)。還發(fā)現(xiàn)擬南芥中差異顯著基因要比鼠耳芥芥多,推測(cè)鼠耳芥中抗Zn/Cd脅迫基因?qū)n/Cd的解毒能力要比擬南芥中的強(qiáng)。通過(guò)GO富集... 

【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的超富集植物鼠耳芥抗Zn/Cd脅迫基因篩選及初步分析


擬南芥根部細(xì)胞Zn/Cd轉(zhuǎn)運(yùn)、螯合過(guò)程(高華etal.,2001)

溶液培養(yǎng),擬南芥,植株,基因


1-2 溶液培養(yǎng)下鼠耳芥(左)擬南芥(右)植opsis halleri(left) and Arabidopsis thaliana(rightculture(Kr mer, 2010)子的吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)在很大程度上一來(lái)與相同的運(yùn) 的累積表現(xiàn)出明顯的正相關(guān)。 近年來(lái),關(guān)于分子機(jī)制的研究已經(jīng)許多報(bào)道。利用芯片雜交屬吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的基因在鼠耳芥根部中的表中此前推定可能參與植物體內(nèi)重金屬調(diào)控的基2008)。鼠耳芥根部的高表達(dá) NAS2 基因能誘導(dǎo)夠和鋅結(jié)合,尼克酰胺的合成和外面與鼠耳芥利用 RNAi 技術(shù)抑制 AhNAS2 表達(dá),明顯降低nd Clemens, 2012)。這其中包括之前提到的將要因子之一 AhHMA4 基因(Hanikenne et al., 2

培養(yǎng)條件


3.1.1 種子來(lái)源鼠耳芥(Arabidopsis halleri L.)langelsheim 生態(tài)型種子購(gòu)自美國(guó) NBRC 種子庫(kù),其采集自歐洲阿爾卑斯山的鉛鋅尾礦區(qū)。擬南芥(Arabidopsis thaliana L.)Columbia -0 生態(tài)型由德國(guó)圖賓根大學(xué)植物分子生物學(xué)中心惠贈(zèng)。3.1.2 培養(yǎng)條件將鼠耳芥和擬南芥種子用70%酒精及次氯酸鈉滅菌后置于1/2MS固體培養(yǎng)基上。采用 130mm×130mm 方形培養(yǎng)皿,每個(gè)培養(yǎng)皿中放置 8 顆種子。擬南芥 4℃春化 3 天,鼠耳芥 4℃春化 7 天,轉(zhuǎn)入人工氣候箱中培養(yǎng)至 4 周。然后將幼苗轉(zhuǎn)移到 1/2Hoagland 營(yíng)養(yǎng)液中培養(yǎng) 2 周。水培時(shí)所用容器為 4L 塑料盆,用泡沫和海綿作為植株的支撐,每盆放置養(yǎng) 12 棵幼苗。所用營(yíng)養(yǎng)液配方如下:KNO3(1.25 mM), KH2PO4(0.28 mM), MgSO4(0.75 mM), Ca(NO3)2(1.25 mM),H3BO3(25 μM), MnCl2(5 μM), ZnSO4(1 μM), CuSO4(0.5 μM), (NH4)6Mo7O24(0.1μM), FeSO4(5 μM), Na2EDTA(10 μM),營(yíng)養(yǎng)液每三天更新一次。具體培養(yǎng)條件為:光照 11 小時(shí)黑暗 13 小時(shí)進(jìn)行交替,光照強(qiáng)度為 145 mmolm-2s-1。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3396182

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