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分子生態(tài)學(xué)技術(shù)在環(huán)境微生物群落與功能基因中的應(yīng)用研究

發(fā)布時間:2021-06-17 21:31
  隨著工業(yè)的發(fā)展,人類活動對全球環(huán)境變化的影響越來越大。當(dāng)今世界三大環(huán)境問題:空氣中CO2含量逐漸升高、氮沉積效應(yīng)和生物多樣性下降,都與人類活動有著密切的關(guān)系。通過與美國俄克拉荷馬大學(xué)周集中教授的合作,本文首先通過環(huán)境微生物對全球氮沉積問題進行了初步的研究。然后對礦山的環(huán)境污染問題--酸性礦山廢水中的環(huán)境微生物進行了研究。環(huán)境樣品中微生物的多樣性和復(fù)雜性,促使人們不斷地嘗試使用新的研究方法和技術(shù)。在本文中,運用分子生態(tài)學(xué)中的功能基因芯片(functional gene arrays, FGAs)和限制片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)技術(shù)對環(huán)境微生物群落和功能基因進行了研究。(1)采用對土壤施加氮肥的方式模擬氮沉積對植物和微生物的影響。從美國明尼蘇達大學(xué)的Cedar Creek生態(tài)科學(xué)研究保留地BioCON試驗田取得24個樣品,12個樣品經(jīng)過施加氮肥的處理,12個樣品沒有施加氮肥。通過對24個樣品的基因組DNA提取和功能基因芯片技術(shù)分析后,發(fā)現(xiàn)氮肥的施用對土壤中微生物群落結(jié)構(gòu)和植物生長產(chǎn)生了顯著的影響。施加氮肥使... 

【文章來源】:東華大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:149 頁

【學(xué)位級別】:博士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
第一章 文獻綜述
    1.1 環(huán)境微生物學(xué)及研究發(fā)展趨勢
        1.1.1 傳統(tǒng)環(huán)境微生物研究方法的局限
        1.1.2 環(huán)境微生物研究的新發(fā)展
    1.2 分子生態(tài)學(xué)技術(shù)基本概況
        1.2.1 分子生物學(xué)概述
        1.2.2 分子生態(tài)技術(shù)簡介
    1.3 課題研究背景及主要研究內(nèi)容
        1.3.1 課題研究背景
        1.3.2 主要研究內(nèi)容
第二章 不同氮濃度條件下土壤微生物群落與功能基因研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 樣品采集地描述
        2.1.2 樣品中DNA的抽提、純化和定量
        2.1.3 功能基因芯片雜交
        2.1.4 圖像處理
        2.1.5 數(shù)據(jù)分析與處理
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 功能基因芯片結(jié)果及數(shù)據(jù)初步處理
        2.2.2 添加氮肥對植物生長的影響
        2.2.3 24個樣品功能基因芯片的整體分析
        2.2.4 碳、氮、硫和磷循環(huán)功能基因分析
        2.2.5 與氮循環(huán)相關(guān)的關(guān)鍵基因分析
        2.2.6 外界因素與樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系
    2.3 本章小結(jié)
第三章 施肥時間長短對土壤微生物群落及功能基因的影響
    3.1 材料與方法
        3.1.1 樣品描述
        3.1.2 樣品中DNA的抽提、純化和定量
        3.1.3 功能基因芯片雜交及掃描
        3.1.4 數(shù)據(jù)分析與處理
    3.2 結(jié)果與討論
        3.2.1 功能基因芯片結(jié)果及數(shù)據(jù)初步處理
        3.2.2 八個樣品中功能基因芯片的整體分析
        3.2.3 參與碳、氮、硫和磷循環(huán)作用相關(guān)功能基因分析
        3.2.4 與氮循環(huán)相關(guān)關(guān)鍵功能基因分析
    3.3 本章小結(jié)
第四章 礦山酸性廢水中微生物生態(tài)多樣性研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 采樣點描述及樣品收集
        4.1.2 地理化學(xué)參數(shù)分析
        4.1.3 群落基因組DNA的提取、純化
        4.1.4 細菌和古菌16S rDNA的擴增
        4.1.5 感受態(tài)制備、基因克隆與RFLP酶切
        4.1.6 序列測定及系統(tǒng)發(fā)育分析
        4.1.7 核苷酸序列登錄號
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 樣品的地理化學(xué)性質(zhì)分析結(jié)果
        4.2.2 RFLP結(jié)果
        4.2.3 兩樣品中細菌16S rDNA片斷RFLP飽和度分析及測序
        4.2.4 云浮硫鐵礦兩樣品中細菌16S rDNA基因比較
    4.3 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論
參考文獻
博士期間發(fā)表論文、申請專利及獲獎情況
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]UASB反應(yīng)器中厭氧氨氧化污泥的種群分析[J]. 楊洋,左劍惡,全哲學(xué),Lee Sung-taik,沈平,顧夏聲.  中國環(huán)境科學(xué). 2006(01)
[2]DGGE污泥堆肥工藝微生物種群結(jié)構(gòu)分析[J]. 傅以鋼,王峰,何培松,夏四清,趙建夫.  中國環(huán)境科學(xué). 2005(S1)
[3]熒光原位雜交技術(shù)及其在微生物生態(tài)學(xué)中的應(yīng)用[J]. 呼慶,齊鴻雁,張洪勛.  生態(tài)學(xué)報. 2004(05)
[4]TGGE分析焦化廢水處理系統(tǒng)活性污泥細菌種群動態(tài)變化及多樣性[J]. 高平平,晁群芳,張學(xué)禮,王凌華,趙立平.  生態(tài)學(xué)報. 2003(10)
[5]OLAND生物脫氮系統(tǒng)中硝化菌群16S rDNA的DGGE分析[J]. 張丹,劉耀平,徐慧,張穎,陳冠雄.  生物技術(shù). 2003(05)
[6]大腸桿菌MG1655菌株ERIC-PCR圖譜主帶序列組成分析[J]. 陳迎春,曹又方,趙立平.  微生物學(xué)通報. 2002(06)
[7]水環(huán)境細菌16S rDNA限制性片段長度多型性及群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 李志崗,楊官品,朱艷紅.  水生生物學(xué)報. 2001(02)
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博士論文
[1]基于分子生態(tài)學(xué)技術(shù)的環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)與功能的研究[D]. 楊朝暉.湖南大學(xué) 2007
[2]在銅礦礦坑水微生物群落結(jié)構(gòu)與功能研究中基因芯片技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[D]. 尹華群.中南大學(xué) 2007
[3]應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)解析不同處理狀況下土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的變化[D]. 趙勇.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號:3235955

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