“一劑雙靶”新型抑制劑先導結構的生物合理設計與篩選
發(fā)布時間:2021-03-29 00:00
果糖-1,6-二磷酸酶(FBPase)和果糖-1,6-二磷酸醛縮酶(Fba)是參與Calvin循環(huán),糖酵解和糖質新生代謝的重要調控酶,對生命體的能量代謝極其重要,具有重要的醫(yī)學和農學意義。目前,人體內的Ⅰ型FBPae是治療Ⅱ型糖尿病的靶標,針對其變構位點的抑制劑在臨床試驗中。細菌中的Ⅱ型Fba被認為是一種理想的殺菌劑靶標,并且在醫(yī)用疫苗,免疫檢測上都有重大的醫(yī)用價值。研究表明,藍藻細胞內的Ⅱ型FBPase兼具有SBPase的功能,是一種雙功能酶,即藍藻FBP/SBPase.現代分子生物學技術證明了藍藻FBP/SBPase和II型的Fba都是藍藻生長過程中必不可少的調控酶,是具有開發(fā)前景的農藥殺藻劑的重要作用靶標。稻瘟病是水稻三大病害之首,因而稻瘟菌殺菌劑的研發(fā)和應用受到廣泛重視。甾醇14α脫甲基化酶(CYP51)是以三唑類化合物為典型代表的許多重要內吸性甾醇14α脫甲基化酶抑制劑(DMIs)的重要靶酶。三羥基萘酚還原酶(3HNR)和小柱孢酮脫水酶(SD)是黑色素生物合成抑制劑(MBIs)的兩個重要靶酶。三環(huán)唑等MBIs類抑制劑已經有超過三十多年的使用歷史。由于對病原菌沒有直接的殺菌或抑...
【文章來源】:華中師范大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:177 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
本論文的主要創(chuàng)新點
第一章 文獻綜述——研究背景介紹
1.1 藍藻水華及其防治
1.2 Calvin循環(huán),糖酵解和糖質新生代謝
1.2.1 Calvin循環(huán)
1.2.2 糖酵解和糖異生代謝
1.3 果糖-1,6-二磷酸酶和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶的相關研究
1.3.1 果糖-1,6-二磷酸酶的分類
1.3.2 人和動物的果糖-1,6-二磷酸酶
1.3.3 植物的果糖-1,6-二磷酸酶和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶
1.3.4 大腸桿菌、藍藻等低等生物的果糖-1,6-二磷酸酶
1.4 果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的相關研究
1.4.1 果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的分類
1.4.2 Ⅰ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶
1.4.3 Ⅱ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶
1.5 水稻稻瘟菌病及其防治
1.5.1 水稻稻瘟病和稻瘟菌
1.5.2 水稻稻瘟病的防治
1.6 甾醇14α去甲基化酶的相關研究
1.6.1 甾醇14α去甲基化酶的結構
1.6.2 甾醇14α去甲基化酶的抑制劑
1.7 黑色素生物合成抑制劑的研究
1.7.1 三羥基萘酚還原酶及其抑制劑
1.7.2 小柱胞酮脫水酶及其抑制劑
1.8 多靶標抑制劑設計的設計策略
1.9 本論文研究的設計思想及目標
1.10 本論文的主要研究工作
第二章 “一劑雙靶”新型殺藻劑先導結構的生物合理設計與篩選
2.1 前沿
2.2 藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba的克隆與表達
2.2.1 實驗目的
2.2.2 藍藻FBP/SBPase表達載體的構建
2.2.3 藍藻FBP/SBPase表達純化體系的建立
2.2.4 藍藻Ⅱ型Fba表達載體的構建
2.2.5 藍藻Ⅱ型Fba表達純化體系的建立
2.2.6 實驗結果與討論
2.2.7 小結
2.3 藍藻果糖-1,6-二磷酸酶(FBPase)的結構和功能研究
2.3.1 前沿
2.3.2 藍藻FBP/SBPase與底物FBP和SBP的分子動力學模擬
2.3.3 藍藻FBP/SBPase活性空腔氨基酸殘基與底物FBP配對能的計算
2.3.4 藍藻FBP/SBPase的品體培養(yǎng),解析及定點突變研究
2.3.5 結果與討論
2.4 藍藻Ⅱ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的結構預測及突變研究
2.4.1 前沿
2.4.2 藍藻Ⅱ型醛縮酶的結構預測
2.4.3 藍藻Ⅱ型醛縮酶的定點突變
2.4.4 藍藻Ⅱ型醛縮酶突變體的活性測試
2.4.5 結果與討論
2.5 針對藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba的雙靶酶抑制劑生物合理設計
2.5.1 前言
2.5.2 基于藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba結構的雙靶酶抑制劑設計
2.5.3 基于藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba結構的苯甲酰肼類衍生物的合理設計與合成
2.6 雙靶抑制劑苗頭化合物的活性測試研究
2.6.1 前言
2.6.2 重組酶抑制活性的測定
2.6.3 集胞藻PCC 6803藻體抑制活性的測定
2.6.4 化合物的抑制活性分析
2.7 本章小結
第三章 “一劑雙靶”稻瘟菌新型殺菌劑先導結構的生物合理設計與篩選
3.1 前言
3.2 稻瘟菌3HNR和SD的克隆與表達
3.2.1 實驗目的
3.2.2 稻瘟菌3HNR和SD表達載體的構建
3.2.3 稻瘟菌3HNR和SD異原表達純化體系的建立
3.2.4 結果與討論
3.2.5 小結
3.3 稻瘟菌CYP51的分子模擬研究
3.3.1 前沿
3.3.2 稻瘟菌CYP51的同源模建
3.3.3 稻瘟菌CYP51的分子動力學模擬
3.3.4 結果與討論
3.4 針對稻瘟菌CYP51與3HNR的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.4.1 前言
3.4.2 基于稻瘟菌CYP51和3HNR受體活性空腔的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.5 針對稻瘟菌CYP51與SD的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.5.1 前言
3.5.2 基于稻瘟菌CYP51與SD受體活性空腔的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.6 雙靶苗頭化合物的活性測試研究
3.6.1 前言
3.6.2 重組瘟菌CYP51和3HNR酶抑制活性的測定
3.6.3 稻瘟菌菌體及稻瘟菌黑色素分泌抑制活性的測定
3.6.4 化合物的抑制活性分析
3.7 本章小結
第四章 全文總結與展望
4.1 全文總結
4.2 展望
參考文獻
附錄
個人簡歷
在讀期間發(fā)表的學術論文和研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]果糖-1,6-二磷酸酶AMP變構抑制劑的研究進展[J]. 李占梅,別建波,宋宏銳,徐柏玲. 藥學學報. 2011(11)
[2]滇池水華分形結構動態(tài)研究[J]. 周火艷,王崇云,彭明春,陳美卿. 環(huán)境科學與技術. 2011(02)
[3]巢湖藍藻水華遙感監(jiān)測初探[J]. 周先傳,徐升. 中國環(huán)境監(jiān)測. 2010(03)
[4]稻瘟病化學防治藥劑的歷史沿革與研究現狀[J]. 張傳清,周明國,朱國念. 農藥學學報. 2009(01)
[5]合成殺藻劑先導化合物的篩選和殺藻效果分析[J]. 陳曉雯,趙良元,楊劭. 化學與生物工程. 2008(09)
[6]武漢東湖甲藻水華與環(huán)境因子的關系[J]. 湯宏波,胡圣,胡征宇,況琪軍,劉國祥. 湖泊科學. 2007(06)
[7]太湖水華的遙感分析[J]. 吳傳慶,王橋,楊志峰,魏斌,王昌佐,厲青. 中國環(huán)境監(jiān)測. 2007(03)
[8]除藻與控藻技術[J]. 過龍根. 中國水利. 2006(17)
[9]黑色素生物合成抑制劑分子生物合理設計研究進展[J]. 趙軍鋒,丁明武. 世界農藥. 2004(05)
[10]藍藻水華的危害及治理動態(tài)[J]. 王揚才,陸開宏. 水產學雜志. 2004(01)
博士論文
[1]基于靶酶結構的新型抑制劑先導化合物的合理設計與篩選研究[D]. 張青葉.華中師范大學 2008
[2]稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)14α-去甲基化酶與抑制劑的結合特性與新型殺真菌劑篩選[D]. 楊嬌艷.華中師范大學 2008
碩士論文
[1]以FBPase和SBPase為靶標的抑制劑設計和理論研究[D]. 劉鍇.華中師范大學 2009
本文編號:3106493
【文章來源】:華中師范大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:177 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
本論文的主要創(chuàng)新點
第一章 文獻綜述——研究背景介紹
1.1 藍藻水華及其防治
1.2 Calvin循環(huán),糖酵解和糖質新生代謝
1.2.1 Calvin循環(huán)
1.2.2 糖酵解和糖異生代謝
1.3 果糖-1,6-二磷酸酶和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶的相關研究
1.3.1 果糖-1,6-二磷酸酶的分類
1.3.2 人和動物的果糖-1,6-二磷酸酶
1.3.3 植物的果糖-1,6-二磷酸酶和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶
1.3.4 大腸桿菌、藍藻等低等生物的果糖-1,6-二磷酸酶
1.4 果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的相關研究
1.4.1 果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的分類
1.4.2 Ⅰ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶
1.4.3 Ⅱ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶
1.5 水稻稻瘟菌病及其防治
1.5.1 水稻稻瘟病和稻瘟菌
1.5.2 水稻稻瘟病的防治
1.6 甾醇14α去甲基化酶的相關研究
1.6.1 甾醇14α去甲基化酶的結構
1.6.2 甾醇14α去甲基化酶的抑制劑
1.7 黑色素生物合成抑制劑的研究
1.7.1 三羥基萘酚還原酶及其抑制劑
1.7.2 小柱胞酮脫水酶及其抑制劑
1.8 多靶標抑制劑設計的設計策略
1.9 本論文研究的設計思想及目標
1.10 本論文的主要研究工作
第二章 “一劑雙靶”新型殺藻劑先導結構的生物合理設計與篩選
2.1 前沿
2.2 藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba的克隆與表達
2.2.1 實驗目的
2.2.2 藍藻FBP/SBPase表達載體的構建
2.2.3 藍藻FBP/SBPase表達純化體系的建立
2.2.4 藍藻Ⅱ型Fba表達載體的構建
2.2.5 藍藻Ⅱ型Fba表達純化體系的建立
2.2.6 實驗結果與討論
2.2.7 小結
2.3 藍藻果糖-1,6-二磷酸酶(FBPase)的結構和功能研究
2.3.1 前沿
2.3.2 藍藻FBP/SBPase與底物FBP和SBP的分子動力學模擬
2.3.3 藍藻FBP/SBPase活性空腔氨基酸殘基與底物FBP配對能的計算
2.3.4 藍藻FBP/SBPase的品體培養(yǎng),解析及定點突變研究
2.3.5 結果與討論
2.4 藍藻Ⅱ型果糖-1,6-二磷酸醛縮酶的結構預測及突變研究
2.4.1 前沿
2.4.2 藍藻Ⅱ型醛縮酶的結構預測
2.4.3 藍藻Ⅱ型醛縮酶的定點突變
2.4.4 藍藻Ⅱ型醛縮酶突變體的活性測試
2.4.5 結果與討論
2.5 針對藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba的雙靶酶抑制劑生物合理設計
2.5.1 前言
2.5.2 基于藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba結構的雙靶酶抑制劑設計
2.5.3 基于藍藻FBP/SBPase和Ⅱ型Fba結構的苯甲酰肼類衍生物的合理設計與合成
2.6 雙靶抑制劑苗頭化合物的活性測試研究
2.6.1 前言
2.6.2 重組酶抑制活性的測定
2.6.3 集胞藻PCC 6803藻體抑制活性的測定
2.6.4 化合物的抑制活性分析
2.7 本章小結
第三章 “一劑雙靶”稻瘟菌新型殺菌劑先導結構的生物合理設計與篩選
3.1 前言
3.2 稻瘟菌3HNR和SD的克隆與表達
3.2.1 實驗目的
3.2.2 稻瘟菌3HNR和SD表達載體的構建
3.2.3 稻瘟菌3HNR和SD異原表達純化體系的建立
3.2.4 結果與討論
3.2.5 小結
3.3 稻瘟菌CYP51的分子模擬研究
3.3.1 前沿
3.3.2 稻瘟菌CYP51的同源模建
3.3.3 稻瘟菌CYP51的分子動力學模擬
3.3.4 結果與討論
3.4 針對稻瘟菌CYP51與3HNR的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.4.1 前言
3.4.2 基于稻瘟菌CYP51和3HNR受體活性空腔的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.5 針對稻瘟菌CYP51與SD的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.5.1 前言
3.5.2 基于稻瘟菌CYP51與SD受體活性空腔的雙靶酶抑制劑生物合理設計
3.6 雙靶苗頭化合物的活性測試研究
3.6.1 前言
3.6.2 重組瘟菌CYP51和3HNR酶抑制活性的測定
3.6.3 稻瘟菌菌體及稻瘟菌黑色素分泌抑制活性的測定
3.6.4 化合物的抑制活性分析
3.7 本章小結
第四章 全文總結與展望
4.1 全文總結
4.2 展望
參考文獻
附錄
個人簡歷
在讀期間發(fā)表的學術論文和研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]果糖-1,6-二磷酸酶AMP變構抑制劑的研究進展[J]. 李占梅,別建波,宋宏銳,徐柏玲. 藥學學報. 2011(11)
[2]滇池水華分形結構動態(tài)研究[J]. 周火艷,王崇云,彭明春,陳美卿. 環(huán)境科學與技術. 2011(02)
[3]巢湖藍藻水華遙感監(jiān)測初探[J]. 周先傳,徐升. 中國環(huán)境監(jiān)測. 2010(03)
[4]稻瘟病化學防治藥劑的歷史沿革與研究現狀[J]. 張傳清,周明國,朱國念. 農藥學學報. 2009(01)
[5]合成殺藻劑先導化合物的篩選和殺藻效果分析[J]. 陳曉雯,趙良元,楊劭. 化學與生物工程. 2008(09)
[6]武漢東湖甲藻水華與環(huán)境因子的關系[J]. 湯宏波,胡圣,胡征宇,況琪軍,劉國祥. 湖泊科學. 2007(06)
[7]太湖水華的遙感分析[J]. 吳傳慶,王橋,楊志峰,魏斌,王昌佐,厲青. 中國環(huán)境監(jiān)測. 2007(03)
[8]除藻與控藻技術[J]. 過龍根. 中國水利. 2006(17)
[9]黑色素生物合成抑制劑分子生物合理設計研究進展[J]. 趙軍鋒,丁明武. 世界農藥. 2004(05)
[10]藍藻水華的危害及治理動態(tài)[J]. 王揚才,陸開宏. 水產學雜志. 2004(01)
博士論文
[1]基于靶酶結構的新型抑制劑先導化合物的合理設計與篩選研究[D]. 張青葉.華中師范大學 2008
[2]稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)14α-去甲基化酶與抑制劑的結合特性與新型殺真菌劑篩選[D]. 楊嬌艷.華中師范大學 2008
碩士論文
[1]以FBPase和SBPase為靶標的抑制劑設計和理論研究[D]. 劉鍇.華中師范大學 2009
本文編號:3106493
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