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P450酶活性中心催化有機阻燃劑和多環(huán)芳烴轉(zhuǎn)化機制的計算模擬

發(fā)布時間:2020-12-27 12:48
  細(xì)胞色素P450酶催化轉(zhuǎn)化是多數(shù)外源化合物在生物體內(nèi)代謝消除的重要途徑。P450酶代謝轉(zhuǎn)化能夠起到解毒作用,使污染物極性增強,促進(jìn)其排泄過程;然而,反應(yīng)過程的中間體或產(chǎn)物可能易與生物大分子(如蛋白質(zhì)、核酸)結(jié)合產(chǎn)生毒性增強效應(yīng)。因此,研究P450酶的代謝反應(yīng)機制對評價有機污染物的生物轉(zhuǎn)化歸趨、毒理效應(yīng)和健康風(fēng)險具有重要意義;诨铙w動物和試管實驗等傳統(tǒng)方法探究P450酶代謝轉(zhuǎn)化過程面臨動物倫理、耗時費力、依賴設(shè)備、化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品缺乏等困境,難以捕捉和定性高活性反應(yīng)中間物種,難以滿足數(shù)量巨大且不斷增長的有機化學(xué)品生態(tài)風(fēng)險評價的客觀需求。因此,有必要發(fā)展外源化合物的P450酶代謝轉(zhuǎn)化路徑和產(chǎn)物的預(yù)測方法。隨著量子化學(xué)理論方法的快速發(fā)展以及計算機性能的高速提升,計算模擬已成為解決上述問題的重要手段,在預(yù)測有機物的理化性質(zhì)、環(huán)境轉(zhuǎn)化路徑和產(chǎn)物分布、動力學(xué)等方面具有優(yōu)勢。已有P450酶催化反應(yīng)機制的研究主要集中于常規(guī)化學(xué)底物(如烷烴、苯等)、內(nèi)源激素、藥物分子等。相比之下,種類眾多且結(jié)構(gòu)各異(烷基、芳基、鹵代)的環(huán)境有機污染物的P450酶代謝轉(zhuǎn)化機制仍有待揭示。本研究采用計算模擬方法,考察了 P45... 

【文章來源】:大連理工大學(xué)遼寧省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:183 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

P450酶活性中心催化有機阻燃劑和多環(huán)芳烴轉(zhuǎn)化機制的計算模擬


圖1.4?QM/MM區(qū)域劃分??Fi.?1.4?Division?of?theM/MM?reions??

電子軌道,羥基化,底物


究了甲烷的C-H鍵羥基化¥1,之后眾多學(xué)者相繼研究了包括樟腦丸分子等總共超過十??種烷烴化合物[2】,形成了比較統(tǒng)一的P450酶催化C-H鍵羥基化的機理,即氫遷移??(hydrogen?atom?transfer,?HAT)和氧反彈機理(圖1.7):首先,Compoundl的O氧原子摘取??底物C-H鍵的H原子,形成Fe-OH和烷烴碳自由基,之后Fe-OH轉(zhuǎn)向,OH反彈到??碳自由基上形成醇。Shaik等人[43H十算發(fā)現(xiàn),C-H鍵的羥基化也遵循一個雙態(tài)反應(yīng)機制。??所謂雙態(tài)反應(yīng),是指Compoundl的兩個簡并自旋態(tài)(二、四重態(tài))均參與的過程:在C-H??鍵羥基化過程中,HAT是整個反應(yīng)的決速步驟,而二、四重態(tài)HAT反應(yīng)能量接近,因??此均可參與反應(yīng)。研宄還發(fā)現(xiàn),Compoundl催化烷烴底物羥基化的速率與C-H鍵的鍵??解離能(BDE)呈現(xiàn)線性相關(guān)關(guān)系。但當(dāng)CHH鍵的BDE較低時,如當(dāng)C-H鍵位于強吸電??子基的C?位時,線性相關(guān)變得不顯著。BDE是指底物分子與底物自由基和氫原子的能??量差

阻燃劑,消費量,歐洲,行業(yè)


?SH?SH??圖1.8?P450酶催化苯環(huán)羥基化的三條可能反應(yīng)路徑(環(huán)氧化、NIH轉(zhuǎn)移和質(zhì)子穿梭)??Fig.?1.8?Three?possible?pathways?for?benzene?hydroxylation?catalyzed?by?P450?enzymes??(epoxidation,?NIH?shift?and?proton?shuttle)??除了常規(guī)化學(xué)物質(zhì)外,P450酶代謝反應(yīng)計算模擬研究的熱點底物是內(nèi)源激素及藥??物。在內(nèi)源激素方面,前人重點研宄了?CYP?19A1(芳構(gòu)化酶)參與的性激素的合成和轉(zhuǎn)??化反應(yīng),比如雌二醇轉(zhuǎn)化成雌激素酮,以及睪酮轉(zhuǎn)化成雌二醇等過程|444叱藥物代謝研??宄涉及的底物眾多,如撲熱息痛[47]、美西律%]、左美丙嗪1491等。Ji等人1471基于DFT計??算研宄了撲熱息痛的P450酶代謝過程,比較了撲熱息痛分子的酰胺鍵N與Compound丨??反應(yīng)的三種可能機制:氫原子轉(zhuǎn)移(HAT)、氧加成反應(yīng)(0AR)以及單電子轉(zhuǎn)移反應(yīng)(SET),??發(fā)現(xiàn)HAT是主要的反應(yīng)機制。并且發(fā)現(xiàn)反應(yīng)在Compound丨的兩個簡并自旋態(tài)上所得的??產(chǎn)物不相同

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]In vitro assessment of thyroid hormone receptor activity of four organophosphate esters[J]. Xiaomin Ren,Linying Cao,Yu Yang,Bin Wan,Sufang Wang,Lianghong Guo.  Journal of Environmental Sciences. 2016(07)
[2]大遼河口及其毗鄰區(qū)域表層沉積物中多環(huán)芳烴的分布及其風(fēng)險評估[J]. 王麗平,王安利,南炳旭,廖紹安.  海洋環(huán)境科學(xué). 2015(06)

碩士論文
[1]典型電子廢物處置場地PBDEs污染特征研究[D]. 吳曉飛.河北科技大學(xué) 2013



本文編號:2941764

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