統(tǒng)計(jì)聚類在生物信息分析中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2017-12-28 08:07
本文關(guān)鍵詞:統(tǒng)計(jì)聚類在生物信息分析中的應(yīng)用 出處:《蘭州大學(xué)》2014年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
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【摘要】:本文通過實(shí)例分析,簡要闡述了聚類分析在現(xiàn)代生物信息學(xué)中的應(yīng)用。隨著生物信息學(xué)的飛速發(fā)展,特定功能基因篩選已經(jīng)成為了該領(lǐng)域研究的一個(gè)重要方向;從海量數(shù)據(jù)中篩選出對生物遺傳性狀和生命活動有指導(dǎo)意義的信息已成為當(dāng)前生物信息學(xué)研究的新課題。因此,統(tǒng)計(jì)學(xué)作為一種方法論被廣泛應(yīng)用到生物信息分析領(lǐng)域。 我們采用12個(gè)植物果肉樣本差異基因表達(dá)數(shù)據(jù),對這些數(shù)據(jù)做預(yù)處理和統(tǒng)計(jì)分析,包括從相關(guān)性分析,顯著性檢驗(yàn),顯著表達(dá)基因的篩選到聚類分析以及結(jié)果展現(xiàn)等內(nèi)容。首先對數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性分析,然后對差異表達(dá)的基因進(jìn)行顯著性檢驗(yàn),最后采用層次聚類、K-means聚類和SOM聚類算法,對差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類,并給出結(jié)果展示和說明。本文的工作可以為生物相關(guān)領(lǐng)域的研究人員提供基因表達(dá)數(shù)據(jù)的挖掘服務(wù),為科研人員進(jìn)一步研究提供了實(shí)用數(shù)據(jù)。
[Abstract]:The application of cluster analysis in modern bioinformatics is briefly described in this paper. With the rapid development of bioinformatics, specific functional gene screening has become an important direction of research in this field; data from the mass screening has guiding significance for genetic traits and life activities of the information has become a new topic in the research of bioinformatics. Therefore, statistics, as a methodology, has been widely used in the field of bioinformatics analysis.
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:C812
【參考文獻(xiàn)】
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1 賀玲;吳玲達(dá);蔡益朝;;數(shù)據(jù)挖掘中的聚類算法綜述[J];計(jì)算機(jī)應(yīng)用研究;2007年01期
2 祁云霞;劉永斌;榮威恒;;轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J];遺傳;2011年11期
,本文編號:1345233
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