合成生物學(xué)是生命科學(xué)在二十一世紀(jì)剛剛出現(xiàn)的一個正在迅速發(fā)展的分支學(xué)科,它與化學(xué)、物理學(xué)、信息科學(xué)、工程科學(xué)、計算機(jī)等多種學(xué)科相結(jié)合�；虿考捌鋬�(nèi)部特征是合成生物學(xué)家的主要研究對象,而序列信息是部件及其內(nèi)部特征的基礎(chǔ)組成�，F(xiàn)有的部件及其特征序列往往是沿用以前的信息,這些信息不全面、不準(zhǔn)確,另外對部件及其特征序列的描述、格式都沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),現(xiàn)在的分析數(shù)據(jù)的方法較為費(fèi)時,這使得學(xué)者對部件內(nèi)部特征研究困難重重。為了解決這一問題,我們使用新的方法來分析廣泛使用的數(shù)據(jù)包含超過7000個部件和70000多個特征序列。使用結(jié)構(gòu)化查詢語句（SQL）,使我們獲得全面非冗余的信息從而構(gòu)成一個完整的數(shù)據(jù)集。通過對比分析生物部件的內(nèi)部序列特征,我們?yōu)楹铣缮飳W(xué)家提供了構(gòu)造新的具有特定的功能質(zhì)粒部件的理論基礎(chǔ)。GenoCAD是合成生物學(xué)領(lǐng)域的軟件工具可幫助設(shè)計復(fù)雜的結(jié)構(gòu),在GenoCAD平臺上根據(jù)個人需求可以設(shè)計相應(yīng)的語法規(guī)則來構(gòu)造一種DNA分子。邏輯門在各個學(xué)科領(lǐng)域都有涉及和廣泛的應(yīng)用,但在設(shè)計構(gòu)造質(zhì)粒的方面還未有提及,雜志期刊上已發(fā)表的文章也沒有用邏輯門來構(gòu)造質(zhì)粒部件的應(yīng)用,本文提出了自己在生物部件的構(gòu)建... 

【文章來源】：陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１雙穩(wěn)態(tài)轉(zhuǎn)換器的設(shè)計??阻遏蛋白１?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒｌ）由｜Ｃ啟動子ｌ（Ｐｒｏｍｏｔｅｒｌ抑制了阻遏蛋白２?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒ２）的轉(zhuǎn)錄

Ｔ??Ｉｎｄｕｃｅｒ?１??圖１－１雙穩(wěn)態(tài)轉(zhuǎn)換器的設(shè)計??阻遏蛋白１?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒｌ）由｜Ｃ啟動子ｌ（Ｐｒｏｍｏｔｅｒｌ）抑制了阻遏蛋白２?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒ２）的轉(zhuǎn)錄。??這個轉(zhuǎn)換器應(yīng)用誘導(dǎo)物１或２?（ｉｎｄｕｃｅｒ）可以在穩(wěn)態(tài)之間翻轉(zhuǎn)。??為了能夠設(shè)計較大的和更復(fù)雜的基因線路，常用到標(biāo)準(zhǔn)化的生物模塊－生物積??塊（Ｂｉｏｂｒｉｃｋ）?［１７＿＇但由于成分、宿主和合成系統(tǒng)不完全清楚，使其難于預(yù)測特??殊宿主內(nèi)合成網(wǎng)絡(luò)的精確行為。??合成生物學(xué)是借助設(shè)計和構(gòu)建遺傳路線合成新的生物機(jī)體，許多合成生物學(xué)??家用生物積塊（ＢｉｏＢｒｉｃｋ）組裝遺傳路徑，ＢｉｏＢｒｉｃｋ中有各種各樣的特征，例如：??啟動子、核糖體結(jié)合位點(diǎn)，編碼蛋白質(zhì)及轉(zhuǎn)錄終止子等。每個ＢｉｏＢｒｉｃｋ的本質(zhì)都??是環(huán)狀質(zhì)粒上的一種物理ＤＮＡ序列。ＢｉｏＢｒｉｃｋ的標(biāo)準(zhǔn)化序列能夠經(jīng)由限制酶消化??和連接兩個ＢｉｏＢｒｉｃｋ［１８］的組裝，標(biāo)準(zhǔn)組裝涉及用不同的酶消化兩種質(zhì)粒，留下相??同的黏性末端，其可以一起連接成新的質(zhì)粒。這種在模塊之間用序列取代限制性??酶切位點(diǎn)

可運(yùn)行外部程序，可以通過掃描這些程序的輸出得到你感興趣的東西。Ｐｅｒｌ語言也??很容易在許多現(xiàn)代操作系統(tǒng)上編譯和運(yùn)行，它是高效率的編程語言。從ｉＧＥＭ上??提取數(shù)據(jù)，我們用語句如圖２－１來實現(xiàn)數(shù)據(jù)獲取并依據(jù)數(shù)據(jù)類型對對數(shù)據(jù)分類、分??析以獲得所需信息。??１１??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3225181